Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G017732.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R0E4
Pfam PF13417
Panther DB PTHR11260 PTHR11260:SF171
NCBI CDD KOG1422; Intracellular Cl- channel CLIC, contains GST domain
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G75270 : dehydroascorbate reductase 2
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g02530.1 : glutathione S-transferase, N-terminal domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a038237 , Zm00025a038238 , Zm00025a040844
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS1B02G059100 , TraesCS1B02G059100 , TraesCS1A02G045700
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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19 Sobic.008G184400 aspartic proteinase, putative, expressed -
20 Sobic.003G238900 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G017732 Sobic009G017732 Sobic001G323500 Sobic001G323500 Sobic009G017732--Sobic001G323500 Sobic005G177200 Sobic005G177200 Sobic009G017732--Sobic005G177200 Sobic006G276401 Sobic006G276401 Sobic009G017732--Sobic006G276401 Sobic008G045700 Sobic008G045700 Sobic009G017732--Sobic008G045700 Sobic006G139400 Sobic006G139400 Sobic009G017732--Sobic006G139400 Sobic005G082400 Sobic005G082400 Sobic009G017732--Sobic005G082400 Sobic001G183300 Sobic001G183300 Sobic009G017732--Sobic001G183300 Sobic007G040500 Sobic007G040500 Sobic009G017732--Sobic007G040500 Sobic005G148700 Sobic005G148700 Sobic009G017732--Sobic005G148700 Sobic001G323500--Sobic009G017732 Sobic001G323500--Sobic006G276401 Sobic001G323500--Sobic005G148700 Sobic001G323500--Sobic005G177200 Sobic001G323500--Sobic005G082400 Sobic001G323500--Sobic008G045700 Sobic001G323500--Sobic006G139400 Sobic005G141500 Sobic005G141500 Sobic001G323500--Sobic005G141500 Sobic005G221200 Sobic005G221200 Sobic001G323500--Sobic005G221200 Sobic008G181200 Sobic008G181200 Sobic005G177200--Sobic008G181200 Sobic005G037800 Sobic005G037800 Sobic005G177200--Sobic005G037800 Sobic005G177200--Sobic006G139400 Sobic002G049800 Sobic002G049800 Sobic005G177200--Sobic002G049800 Sobic008G184400 Sobic008G184400 Sobic005G177200--Sobic008G184400 Sobic005G177200--Sobic001G323500 Sobic008G069000 Sobic008G069000 Sobic005G177200--Sobic008G069000 Sobic009G210700 Sobic009G210700 Sobic005G177200--Sobic009G210700 Sobic003G238900 Sobic003G238900 Sobic005G177200--Sobic003G238900 Sobic005G147700 Sobic005G147700 Sobic006G276401--Sobic005G147700 Sobic006G276401--Sobic005G148700 Sobic006G276401--Sobic001G323500 Sobic006G276401--Sobic005G221200 Sobic006G276401--Sobic005G141500 Sobic009G039700 Sobic009G039700 Sobic006G276401--Sobic009G039700 Sobic005G174700 Sobic005G174700 Sobic006G276401--Sobic005G174700 Sobic006G276401--Sobic005G082400 Sobic005G109900 Sobic005G109900 Sobic006G276401--Sobic005G109900 Sobic008G045700--Sobic009G210700 Sobic001G438300 Sobic001G438300 Sobic008G045700--Sobic001G438300 Sobic008G045700--Sobic006G139400 Sobic008G045700--Sobic007G040500 Sobic008G045700--Sobic001G183300 Sobic008G045700--Sobic001G323500 Sobic008G045700--Sobic003G238900 Sobic004G048400 Sobic004G048400 Sobic008G045700--Sobic004G048400 Sobic008G045700--Sobic005G082400 Sobic006G139400--Sobic009G210700 Sobic006G139400--Sobic003G238900 Sobic006G139400--Sobic005G177200 Sobic006G139400--Sobic008G045700 Sobic006G139400--Sobic008G069000 Sobic006G139400--Sobic008G181200 Sobic006G139400--Sobic005G037800 Sobic006G139400--Sobic001G323500 Sobic003G167566 Sobic003G167566 Sobic006G139400--Sobic003G167566 Sobic005G082400--Sobic007G040500 Sobic005G082400--Sobic004G048400 Sobic005G133100 Sobic005G133100 Sobic005G082400--Sobic005G133100 Sobic005G082400--Sobic001G438300 Sobic005G082400--Sobic006G276401 Sobic005G082400--Sobic001G183300 Sobic005G082400--Sobic001G323500 Sobic009G039000 Sobic009G039000 Sobic005G082400--Sobic009G039000 Sobic005G082400--Sobic008G045700 Sobic001G183300--Sobic001G438300 Sobic001G183300--Sobic007G040500 Sobic001G183300--Sobic004G048400 Sobic001G183300--Sobic008G045700 Sobic001G183300--Sobic005G082400 Sobic001G183300--Sobic009G210700 Sobic008G135800 Sobic008G135800 Sobic001G183300--Sobic008G135800 Sobic001G183300--Sobic001G323500 Sobic001G183300--Sobic006G139400 Sobic007G040500--Sobic004G048400 Sobic007G040500--Sobic001G438300 Sobic007G040500--Sobic005G082400 Sobic007G040500--Sobic001G183300 Sobic007G040500--Sobic008G135800 Sobic007G040500--Sobic005G133100 Sobic007G040500--Sobic008G045700 Sobic007G040500--Sobic009G210700 Sobic007G040500--Sobic001G323500 Sobic005G148700--Sobic006G276401 Sobic005G148700--Sobic005G221200 Sobic005G148700--Sobic009G039700 Sobic005G148700--Sobic005G141500 Sobic005G148700--Sobic001G323500 Sobic005G174600 Sobic005G174600 Sobic005G148700--Sobic005G174600 Sobic005G148700--Sobic005G109900 Sobic005G148700--Sobic005G147700 Sobic004G017700 Sobic004G017700 Sobic005G148700--Sobic004G017700
Octagon: transcription factors


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