Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G037800.1
Synonym Sb05g003150
Functional annotation sialyltransferase family domain containing protein, expressed
UniProt A0A1Z5RGS1
Pfam PF00777
Panther DB PTHR13713 PTHR13713:SF58
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008373; sialyltransferase activity GO:0006486protein glycosylation


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G08280 : Glycosyltransferase family 29 (sialyltransferase) family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g05550.1 : sialyltransferase family domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a033487
Brachypodium KQJ83461
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G177200 expressed protein -
2 Sobic.008G181200 - -
3 Sobic.002G049800 pumilio-family RNA binding protein, putative, expressed K17943: pumilio RNA-binding family
4 Sobic.008G184400 aspartic proteinase, putative, expressed -
5 Sobic.006G139400 expressed protein -
6 Sobic.008G069000 protein kinase family protein, putative, expressed K14500: BR-signaling kinase
7 Sobic.010G137700 - -
8 Sobic.001G323500 expressed protein -
9 Sobic.010G029800 - -
10 Sobic.002G238900 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
11 Sobic.001G307400 oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family domain containing family, expressed K19329: WW domain-containing oxidoreductase
12 Sobic.005G226800 pumilio-family RNA binding protein, putative, expressed K17943: pumilio RNA-binding family
13 Sobic.006G250200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@amino acid transporter, putative, expressed -
14 Sobic.008G045700 PHD-finger family protein, expressed -
15 Sobic.009G017732 - -
16 Sobic.003G238900 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
17 Sobic.009G210700 LTPL29 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
18 Sobic.005G042400 expressed protein -
19 Sobic.009G062300 BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1-associated receptor kinase 1 precursor, putative, expressed -
20 Sobic.005G141500 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G037800 Sobic005G037800 Sobic005G177200 Sobic005G177200 Sobic005G037800--Sobic005G177200 Sobic008G181200 Sobic008G181200 Sobic005G037800--Sobic008G181200 Sobic002G049800 Sobic002G049800 Sobic005G037800--Sobic002G049800 Sobic008G184400 Sobic008G184400 Sobic005G037800--Sobic008G184400 Sobic006G139400 Sobic006G139400 Sobic005G037800--Sobic006G139400 Sobic008G069000 Sobic008G069000 Sobic005G037800--Sobic008G069000 Sobic010G137700 Sobic010G137700 Sobic005G037800--Sobic010G137700 Sobic001G323500 Sobic001G323500 Sobic005G037800--Sobic001G323500 Sobic010G029800 Sobic010G029800 Sobic005G037800--Sobic010G029800 Sobic005G177200--Sobic008G181200 Sobic005G177200--Sobic005G037800 Sobic005G177200--Sobic006G139400 Sobic005G177200--Sobic002G049800 Sobic005G177200--Sobic008G184400 Sobic005G177200--Sobic001G323500 Sobic005G177200--Sobic008G069000 Sobic009G210700 Sobic009G210700 Sobic005G177200--Sobic009G210700 Sobic003G238900 Sobic003G238900 Sobic005G177200--Sobic003G238900 Sobic008G181200--Sobic005G177200 Sobic008G181200--Sobic005G037800 Sobic008G181200--Sobic002G049800 Sobic008G181200--Sobic008G184400 Sobic008G181200--Sobic008G069000 Sobic008G181200--Sobic006G139400 Sobic008G181200--Sobic010G029800 Sobic008G181200--Sobic010G137700 Sobic008G181200--Sobic001G323500 Sobic002G049800--Sobic005G037800 Sobic002G049800--Sobic008G184400 Sobic002G049800--Sobic008G181200 Sobic002G049800--Sobic010G137700 Sobic002G049800--Sobic005G177200 Sobic005G226800 Sobic005G226800 Sobic002G049800--Sobic005G226800 Sobic002G049800--Sobic001G323500 Sobic009G006800 Sobic009G006800 Sobic002G049800--Sobic009G006800 Sobic003G135201 Sobic003G135201 Sobic002G049800--Sobic003G135201 Sobic008G184400--Sobic005G037800 Sobic008G184400--Sobic002G049800 Sobic008G184400--Sobic005G177200 Sobic008G184400--Sobic008G181200 Sobic008G184400--Sobic010G137700 Sobic008G184400--Sobic001G323500 Sobic008G184400--Sobic006G139400 Sobic008G184400--Sobic008G069000 Sobic002G238900 Sobic002G238900 Sobic008G184400--Sobic002G238900 Sobic006G139400--Sobic009G210700 Sobic006G139400--Sobic003G238900 Sobic006G139400--Sobic005G177200 Sobic008G045700 Sobic008G045700 Sobic006G139400--Sobic008G045700 Sobic006G139400--Sobic008G069000 Sobic006G139400--Sobic008G181200 Sobic006G139400--Sobic005G037800 Sobic006G139400--Sobic001G323500 Sobic003G167566 Sobic003G167566 Sobic006G139400--Sobic003G167566 Sobic008G069000--Sobic010G029800 Sobic004G048300 Sobic004G048300 Sobic008G069000--Sobic004G048300 Sobic008G069000--Sobic006G139400 Sobic008G069000--Sobic003G238900 Sobic004G008700 Sobic004G008700 Sobic008G069000--Sobic004G008700 Sobic008G069000--Sobic002G238900 Sobic008G069000--Sobic005G177200 Sobic007G040900 Sobic007G040900 Sobic008G069000--Sobic007G040900 Sobic008G069000--Sobic008G181200 Sobic010G137700--Sobic009G006800 Sobic010G137700--Sobic002G049800 Sobic005G141500 Sobic005G141500 Sobic010G137700--Sobic005G141500 Sobic010G137700--Sobic003G135201 Sobic003G415800 Sobic003G415800 Sobic010G137700--Sobic003G415800 Sobic005G174600 Sobic005G174600 Sobic010G137700--Sobic005G174600 Sobic005G221200 Sobic005G221200 Sobic010G137700--Sobic005G221200 Sobic005G109900 Sobic005G109900 Sobic010G137700--Sobic005G109900 Sobic001G270600 Sobic001G270600 Sobic010G137700--Sobic001G270600 Sobic009G017732 Sobic009G017732 Sobic001G323500--Sobic009G017732 Sobic006G276401 Sobic006G276401 Sobic001G323500--Sobic006G276401 Sobic005G148700 Sobic005G148700 Sobic001G323500--Sobic005G148700 Sobic001G323500--Sobic005G177200 Sobic005G082400 Sobic005G082400 Sobic001G323500--Sobic005G082400 Sobic001G323500--Sobic008G045700 Sobic001G323500--Sobic006G139400 Sobic001G323500--Sobic005G141500 Sobic001G323500--Sobic005G221200 Sobic010G029800--Sobic004G008700 Sobic005G042400 Sobic005G042400 Sobic010G029800--Sobic005G042400 Sobic010G029800--Sobic008G069000 Sobic003G099800 Sobic003G099800 Sobic010G029800--Sobic003G099800 Sobic005G052200 Sobic005G052200 Sobic010G029800--Sobic005G052200 Sobic010G137600 Sobic010G137600 Sobic010G029800--Sobic010G137600 Sobic010G029800--Sobic008G181200 Sobic010G029800--Sobic007G040900 Sobic004G114700 Sobic004G114700 Sobic010G029800--Sobic004G114700
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.