Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G177200.1
Synonym Sb05g023670
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PT72
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g03810.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a056037
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G181200 - -
2 Sobic.005G037800 sialyltransferase family domain containing protein, expressed -
3 Sobic.006G139400 expressed protein -
4 Sobic.002G049800 pumilio-family RNA binding protein, putative, expressed K17943: pumilio RNA-binding family
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11 Sobic.008G045700 PHD-finger family protein, expressed -
12 Sobic.010G137700 - -
13 Sobic.001G307400 oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family domain containing family, expressed K19329: WW domain-containing oxidoreductase
14 Sobic.010G029800 - -
15 Sobic.002G238900 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.006G250200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@amino acid transporter, putative, expressed -
17 Sobic.005G141500 - -
18 Sobic.005G148700 - -
19 Sobic.001G183300 methyl-CpG binding domain containing protein, expressed -
20 Sobic.005G226800 pumilio-family RNA binding protein, putative, expressed K17943: pumilio RNA-binding family


Gene co-expression network
sample Sobic005G177200 Sobic005G177200 Sobic008G181200 Sobic008G181200 Sobic005G177200--Sobic008G181200 Sobic005G037800 Sobic005G037800 Sobic005G177200--Sobic005G037800 Sobic006G139400 Sobic006G139400 Sobic005G177200--Sobic006G139400 Sobic002G049800 Sobic002G049800 Sobic005G177200--Sobic002G049800 Sobic008G184400 Sobic008G184400 Sobic005G177200--Sobic008G184400 Sobic001G323500 Sobic001G323500 Sobic005G177200--Sobic001G323500 Sobic008G069000 Sobic008G069000 Sobic005G177200--Sobic008G069000 Sobic009G210700 Sobic009G210700 Sobic005G177200--Sobic009G210700 Sobic003G238900 Sobic003G238900 Sobic005G177200--Sobic003G238900 Sobic008G181200--Sobic005G177200 Sobic008G181200--Sobic005G037800 Sobic008G181200--Sobic002G049800 Sobic008G181200--Sobic008G184400 Sobic008G181200--Sobic008G069000 Sobic008G181200--Sobic006G139400 Sobic010G029800 Sobic010G029800 Sobic008G181200--Sobic010G029800 Sobic010G137700 Sobic010G137700 Sobic008G181200--Sobic010G137700 Sobic008G181200--Sobic001G323500 Sobic005G037800--Sobic005G177200 Sobic005G037800--Sobic008G181200 Sobic005G037800--Sobic002G049800 Sobic005G037800--Sobic008G184400 Sobic005G037800--Sobic006G139400 Sobic005G037800--Sobic008G069000 Sobic005G037800--Sobic010G137700 Sobic005G037800--Sobic001G323500 Sobic005G037800--Sobic010G029800 Sobic006G139400--Sobic009G210700 Sobic006G139400--Sobic003G238900 Sobic006G139400--Sobic005G177200 Sobic008G045700 Sobic008G045700 Sobic006G139400--Sobic008G045700 Sobic006G139400--Sobic008G069000 Sobic006G139400--Sobic008G181200 Sobic006G139400--Sobic005G037800 Sobic006G139400--Sobic001G323500 Sobic003G167566 Sobic003G167566 Sobic006G139400--Sobic003G167566 Sobic002G049800--Sobic005G037800 Sobic002G049800--Sobic008G184400 Sobic002G049800--Sobic008G181200 Sobic002G049800--Sobic010G137700 Sobic002G049800--Sobic005G177200 Sobic005G226800 Sobic005G226800 Sobic002G049800--Sobic005G226800 Sobic002G049800--Sobic001G323500 Sobic009G006800 Sobic009G006800 Sobic002G049800--Sobic009G006800 Sobic003G135201 Sobic003G135201 Sobic002G049800--Sobic003G135201 Sobic008G184400--Sobic005G037800 Sobic008G184400--Sobic002G049800 Sobic008G184400--Sobic005G177200 Sobic008G184400--Sobic008G181200 Sobic008G184400--Sobic010G137700 Sobic008G184400--Sobic001G323500 Sobic008G184400--Sobic006G139400 Sobic008G184400--Sobic008G069000 Sobic002G238900 Sobic002G238900 Sobic008G184400--Sobic002G238900 Sobic009G017732 Sobic009G017732 Sobic001G323500--Sobic009G017732 Sobic006G276401 Sobic006G276401 Sobic001G323500--Sobic006G276401 Sobic005G148700 Sobic005G148700 Sobic001G323500--Sobic005G148700 Sobic001G323500--Sobic005G177200 Sobic005G082400 Sobic005G082400 Sobic001G323500--Sobic005G082400 Sobic001G323500--Sobic008G045700 Sobic001G323500--Sobic006G139400 Sobic005G141500 Sobic005G141500 Sobic001G323500--Sobic005G141500 Sobic005G221200 Sobic005G221200 Sobic001G323500--Sobic005G221200 Sobic008G069000--Sobic010G029800 Sobic004G048300 Sobic004G048300 Sobic008G069000--Sobic004G048300 Sobic008G069000--Sobic006G139400 Sobic008G069000--Sobic003G238900 Sobic004G008700 Sobic004G008700 Sobic008G069000--Sobic004G008700 Sobic008G069000--Sobic002G238900 Sobic008G069000--Sobic005G177200 Sobic007G040900 Sobic007G040900 Sobic008G069000--Sobic007G040900 Sobic008G069000--Sobic008G181200 Sobic009G210700--Sobic006G139400 Sobic009G210700--Sobic003G238900 Sobic009G210700--Sobic008G045700 Sobic001G438300 Sobic001G438300 Sobic009G210700--Sobic001G438300 Sobic003G207800 Sobic003G207800 Sobic009G210700--Sobic003G207800 Sobic009G210700--Sobic003G167566 Sobic001G183300 Sobic001G183300 Sobic009G210700--Sobic001G183300 Sobic005G213900 Sobic005G213900 Sobic009G210700--Sobic005G213900 Sobic007G040500 Sobic007G040500 Sobic009G210700--Sobic007G040500 Sobic003G238900--Sobic009G210700 Sobic003G238900--Sobic006G139400 Sobic003G238900--Sobic003G167566 Sobic003G238900--Sobic008G069000 Sobic003G238900--Sobic008G045700 Sobic005G058400 Sobic005G058400 Sobic003G238900--Sobic005G058400 Sobic005G174800 Sobic005G174800 Sobic003G238900--Sobic005G174800 Sobic003G238900--Sobic003G207800 Sobic008G069600 Sobic008G069600 Sobic003G238900--Sobic008G069600
Octagon: transcription factors


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