Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G029800.2
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VR95
Pfam -
Panther DB PTHR11064 PTHR11064:SF37
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G13570 : nuclear factor Y, subunit B7
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g49780.1 : histone-like transcription factor and archaeal histone, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G008700 - -
2 Sobic.005G042400 expressed protein -
3 Sobic.008G069000 protein kinase family protein, putative, expressed K14500: BR-signaling kinase
4 Sobic.003G099800 expressed protein -
5 Sobic.005G052200 expressed protein -
6 Sobic.010G137600 - -
7 Sobic.008G181200 - -
8 Sobic.007G040900 expressed protein -
9 Sobic.004G114700 - -
10 Sobic.004G048300 - -
11 Sobic.002G098100 - -
12 Sobic.003G103100 - -
13 Sobic.005G124400 - -
14 Sobic.005G037800 sialyltransferase family domain containing protein, expressed -
15 Sobic.009G062300 BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1-associated receptor kinase 1 precursor, putative, expressed -
16 Sobic.009G020000 - -
17 Sobic.005G226800 pumilio-family RNA binding protein, putative, expressed K17943: pumilio RNA-binding family
18 Sobic.005G177200 expressed protein -
19 Sobic.002G238900 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.003G179300 DEF9 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G029800 Sobic010G029800 Sobic004G008700 Sobic004G008700 Sobic010G029800--Sobic004G008700 Sobic005G042400 Sobic005G042400 Sobic010G029800--Sobic005G042400 Sobic008G069000 Sobic008G069000 Sobic010G029800--Sobic008G069000 Sobic003G099800 Sobic003G099800 Sobic010G029800--Sobic003G099800 Sobic005G052200 Sobic005G052200 Sobic010G029800--Sobic005G052200 Sobic010G137600 Sobic010G137600 Sobic010G029800--Sobic010G137600 Sobic008G181200 Sobic008G181200 Sobic010G029800--Sobic008G181200 Sobic007G040900 Sobic007G040900 Sobic010G029800--Sobic007G040900 Sobic004G114700 Sobic004G114700 Sobic010G029800--Sobic004G114700 Sobic004G008700--Sobic003G099800 Sobic004G008700--Sobic010G029800 Sobic004G008700--Sobic005G042400 Sobic004G008700--Sobic007G040900 Sobic004G008700--Sobic005G052200 Sobic002G098100 Sobic002G098100 Sobic004G008700--Sobic002G098100 Sobic004G008700--Sobic004G114700 Sobic009G020000 Sobic009G020000 Sobic004G008700--Sobic009G020000 Sobic004G008700--Sobic008G069000 Sobic005G042400--Sobic010G029800 Sobic003G103100 Sobic003G103100 Sobic005G042400--Sobic003G103100 Sobic005G042400--Sobic004G008700 Sobic005G042400--Sobic005G052200 Sobic005G124400 Sobic005G124400 Sobic005G042400--Sobic005G124400 Sobic009G062300 Sobic009G062300 Sobic005G042400--Sobic009G062300 Sobic005G042400--Sobic010G137600 Sobic005G042400--Sobic004G114700 Sobic005G226800 Sobic005G226800 Sobic005G042400--Sobic005G226800 Sobic008G069000--Sobic010G029800 Sobic004G048300 Sobic004G048300 Sobic008G069000--Sobic004G048300 Sobic006G139400 Sobic006G139400 Sobic008G069000--Sobic006G139400 Sobic003G238900 Sobic003G238900 Sobic008G069000--Sobic003G238900 Sobic008G069000--Sobic004G008700 Sobic002G238900 Sobic002G238900 Sobic008G069000--Sobic002G238900 Sobic005G177200 Sobic005G177200 Sobic008G069000--Sobic005G177200 Sobic008G069000--Sobic007G040900 Sobic008G069000--Sobic008G181200 Sobic003G099800--Sobic004G008700 Sobic003G099800--Sobic002G098100 Sobic003G099800--Sobic009G020000 Sobic003G099800--Sobic007G040900 Sobic003G099800--Sobic004G114700 Sobic003G099800--Sobic005G052200 Sobic004G316300 Sobic004G316300 Sobic003G099800--Sobic004G316300 Sobic010G258900 Sobic010G258900 Sobic003G099800--Sobic010G258900 Sobic005G150000 Sobic005G150000 Sobic003G099800--Sobic005G150000 Sobic005G052200--Sobic004G114700 Sobic005G052200--Sobic004G316300 Sobic005G052200--Sobic003G103100 Sobic005G052200--Sobic009G020000 Sobic005G052200--Sobic005G042400 Sobic005G052200--Sobic002G098100 Sobic005G052200--Sobic005G150000 Sobic005G052200--Sobic004G008700 Sobic005G052200--Sobic003G099800 Sobic010G137600--Sobic005G042400 Sobic010G137600--Sobic004G114700 Sobic010G137600--Sobic010G029800 Sobic010G137600--Sobic003G103100 Sobic010G137600--Sobic009G020000 Sobic010G137600--Sobic005G052200 Sobic010G137600--Sobic004G008700 Sobic003G076400 Sobic003G076400 Sobic010G137600--Sobic003G076400 Sobic010G137600--Sobic005G124400 Sobic008G181200--Sobic005G177200 Sobic005G037800 Sobic005G037800 Sobic008G181200--Sobic005G037800 Sobic002G049800 Sobic002G049800 Sobic008G181200--Sobic002G049800 Sobic008G184400 Sobic008G184400 Sobic008G181200--Sobic008G184400 Sobic008G181200--Sobic008G069000 Sobic008G181200--Sobic006G139400 Sobic008G181200--Sobic010G029800 Sobic010G137700 Sobic010G137700 Sobic008G181200--Sobic010G137700 Sobic001G323500 Sobic001G323500 Sobic008G181200--Sobic001G323500 Sobic003G179300 Sobic003G179300 Sobic007G040900--Sobic003G179300 Sobic007G040900--Sobic010G258900 Sobic008G182100 Sobic008G182100 Sobic007G040900--Sobic008G182100 Sobic007G040900--Sobic004G048300 Sobic008G070100 Sobic008G070100 Sobic007G040900--Sobic008G070100 Sobic003G330800 Sobic003G330800 Sobic007G040900--Sobic003G330800 Sobic004G316200 Sobic004G316200 Sobic007G040900--Sobic004G316200 Sobic003G010000 Sobic003G010000 Sobic007G040900--Sobic003G010000 Sobic007G040900--Sobic003G099800 Sobic004G114700--Sobic009G020000 Sobic004G114700--Sobic005G052200 Sobic004G114700--Sobic004G316300 Sobic004G114700--Sobic005G150000 Sobic004G114700--Sobic002G098100 Sobic004G114700--Sobic003G099800 Sobic004G114700--Sobic003G103100 Sobic005G148201 Sobic005G148201 Sobic004G114700--Sobic005G148201 Sobic004G114700--Sobic004G008700
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.