Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G052200.1
Synonym Sb05g004230
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Y5L1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G37440 : Chaperone DnaJ-domain superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g28440.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G114700 - -
2 Sobic.004G316300 - -
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10 Sobic.005G148201 - -
11 Sobic.004G029700 expressed protein -
12 Sobic.008G184500 aspartic proteinase, putative, expressed -
13 Sobic.010G029800 - -
14 Sobic.004G132200 - -
15 Sobic.002G105900 OsFBD15 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
16 Sobic.007G196100 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase family protein, expressed K11844: ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16/45
17 Sobic.010G137600 - -
18 Sobic.005G227151 - -
19 Sobic.008G184000 aspartic proteinase, putative, expressed -
20 Sobic.005G124400 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G052200 Sobic005G052200 Sobic004G114700 Sobic004G114700 Sobic005G052200--Sobic004G114700 Sobic004G316300 Sobic004G316300 Sobic005G052200--Sobic004G316300 Sobic003G103100 Sobic003G103100 Sobic005G052200--Sobic003G103100 Sobic009G020000 Sobic009G020000 Sobic005G052200--Sobic009G020000 Sobic005G042400 Sobic005G042400 Sobic005G052200--Sobic005G042400 Sobic002G098100 Sobic002G098100 Sobic005G052200--Sobic002G098100 Sobic005G150000 Sobic005G150000 Sobic005G052200--Sobic005G150000 Sobic004G008700 Sobic004G008700 Sobic005G052200--Sobic004G008700 Sobic003G099800 Sobic003G099800 Sobic005G052200--Sobic003G099800 Sobic004G114700--Sobic009G020000 Sobic004G114700--Sobic005G052200 Sobic004G114700--Sobic004G316300 Sobic004G114700--Sobic005G150000 Sobic004G114700--Sobic002G098100 Sobic004G114700--Sobic003G099800 Sobic004G114700--Sobic003G103100 Sobic005G148201 Sobic005G148201 Sobic004G114700--Sobic005G148201 Sobic004G114700--Sobic004G008700 Sobic004G316300--Sobic005G150000 Sobic004G316300--Sobic005G148201 Sobic004G316300--Sobic004G114700 Sobic004G132200 Sobic004G132200 Sobic004G316300--Sobic004G132200 Sobic004G316300--Sobic005G052200 Sobic004G316300--Sobic009G020000 Sobic004G316300--Sobic002G098100 Sobic005G146000 Sobic005G146000 Sobic004G316300--Sobic005G146000 Sobic007G196100 Sobic007G196100 Sobic004G316300--Sobic007G196100 Sobic004G029700 Sobic004G029700 Sobic003G103100--Sobic004G029700 Sobic008G184500 Sobic008G184500 Sobic003G103100--Sobic008G184500 Sobic003G103100--Sobic005G052200 Sobic003G103100--Sobic005G042400 Sobic003G103100--Sobic004G114700 Sobic005G124400 Sobic005G124400 Sobic003G103100--Sobic005G124400 Sobic008G184000 Sobic008G184000 Sobic003G103100--Sobic008G184000 Sobic009G062300 Sobic009G062300 Sobic003G103100--Sobic009G062300 Sobic002G105900 Sobic002G105900 Sobic003G103100--Sobic002G105900 Sobic009G020000--Sobic004G114700 Sobic009G020000--Sobic004G316300 Sobic009G020000--Sobic005G150000 Sobic009G020000--Sobic005G052200 Sobic009G020000--Sobic003G099800 Sobic009G020000--Sobic002G098100 Sobic009G020000--Sobic005G148201 Sobic009G020000--Sobic004G008700 Sobic007G083900 Sobic007G083900 Sobic009G020000--Sobic007G083900 Sobic010G029800 Sobic010G029800 Sobic005G042400--Sobic010G029800 Sobic005G042400--Sobic003G103100 Sobic005G042400--Sobic004G008700 Sobic005G042400--Sobic005G052200 Sobic005G042400--Sobic005G124400 Sobic005G042400--Sobic009G062300 Sobic010G137600 Sobic010G137600 Sobic005G042400--Sobic010G137600 Sobic005G042400--Sobic004G114700 Sobic005G226800 Sobic005G226800 Sobic005G042400--Sobic005G226800 Sobic002G098100--Sobic004G114700 Sobic002G098100--Sobic003G099800 Sobic002G098100--Sobic004G316300 Sobic002G098100--Sobic009G020000 Sobic002G098100--Sobic005G052200 Sobic002G098100--Sobic005G150000 Sobic002G098100--Sobic004G008700 Sobic002G098100--Sobic005G148201 Sobic008G068900 Sobic008G068900 Sobic002G098100--Sobic008G068900 Sobic005G150000--Sobic004G316300 Sobic005G150000--Sobic005G148201 Sobic005G150000--Sobic004G132200 Sobic005G150000--Sobic008G068900 Sobic006G034900 Sobic006G034900 Sobic005G150000--Sobic006G034900 Sobic005G150000--Sobic005G146000 Sobic005G150000--Sobic004G114700 Sobic005G150000--Sobic009G020000 Sobic005G150000--Sobic007G196100 Sobic004G008700--Sobic003G099800 Sobic004G008700--Sobic010G029800 Sobic004G008700--Sobic005G042400 Sobic007G040900 Sobic007G040900 Sobic004G008700--Sobic007G040900 Sobic004G008700--Sobic005G052200 Sobic004G008700--Sobic002G098100 Sobic004G008700--Sobic004G114700 Sobic004G008700--Sobic009G020000 Sobic008G069000 Sobic008G069000 Sobic004G008700--Sobic008G069000 Sobic003G099800--Sobic004G008700 Sobic003G099800--Sobic002G098100 Sobic003G099800--Sobic009G020000 Sobic003G099800--Sobic007G040900 Sobic003G099800--Sobic004G114700 Sobic003G099800--Sobic005G052200 Sobic003G099800--Sobic004G316300 Sobic010G258900 Sobic010G258900 Sobic003G099800--Sobic010G258900 Sobic003G099800--Sobic005G150000
Octagon: transcription factors


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