Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G184000.1
Synonym Sb08g022570
Functional annotation aspartic proteinase, putative, expressed
UniProt C5YSW1
Pfam PF00026
Panther DB PTHR13683 PTHR13683:SF308
NCBI CDD KOG1339; Aspartyl protease
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006508; proteolysis GO:0004190aspartic-type endopeptidase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G01300 : Eukaryotic aspartyl protease family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g41550.1 : aspartic proteinase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G029700 expressed protein -
2 Sobic.005G227151 - -
3 Sobic.008G184500 aspartic proteinase, putative, expressed -
4 Sobic.002G105900 OsFBD15 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
5 Sobic.007G131100 jmjC domain containing protein, expressed K15601: [histone H3]-dimethyl-L-lysine9 demethylase
6 Sobic.003G319050 - -
7 Sobic.010G035000 - -
8 Sobic.007G025100 expressed protein -
9 Sobic.001G297700 expressed protein -
10 Sobic.003G326300 LTPL29 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
11 Sobic.003G103100 - -
12 Sobic.008G082300 DEF3 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
13 Sobic.007G199500 MBTB30 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
14 Sobic.006G105300 expressed protein -
15 Sobic.002G007300 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K14962: WDR82, SWD2, COMPASS component SWD2
16 Sobic.003G099900 expressed protein -
17 Sobic.002G300900 - -
18 Sobic.002G358000 transmembrane receptor, putative, expressed -
19 Sobic.006G142850 - -
20 Sobic.004G207500 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G184000 Sobic008G184000 Sobic004G029700 Sobic004G029700 Sobic008G184000--Sobic004G029700 Sobic005G227151 Sobic005G227151 Sobic008G184000--Sobic005G227151 Sobic008G184500 Sobic008G184500 Sobic008G184000--Sobic008G184500 Sobic002G105900 Sobic002G105900 Sobic008G184000--Sobic002G105900 Sobic007G131100 Sobic007G131100 Sobic008G184000--Sobic007G131100 Sobic003G319050 Sobic003G319050 Sobic008G184000--Sobic003G319050 Sobic010G035000 Sobic010G035000 Sobic008G184000--Sobic010G035000 Sobic007G025100 Sobic007G025100 Sobic008G184000--Sobic007G025100 Sobic001G297700 Sobic001G297700 Sobic008G184000--Sobic001G297700 Sobic004G029700--Sobic008G184500 Sobic003G103100 Sobic003G103100 Sobic004G029700--Sobic003G103100 Sobic004G029700--Sobic002G105900 Sobic004G029700--Sobic005G227151 Sobic004G029700--Sobic003G319050 Sobic004G029700--Sobic008G184000 Sobic002G097100 Sobic002G097100 Sobic004G029700--Sobic002G097100 Sobic002G007300 Sobic002G007300 Sobic004G029700--Sobic002G007300 Sobic003G099900 Sobic003G099900 Sobic004G029700--Sobic003G099900 Sobic005G227151--Sobic002G105900 Sobic005G227151--Sobic003G099900 Sobic004G207500 Sobic004G207500 Sobic005G227151--Sobic004G207500 Sobic007G196100 Sobic007G196100 Sobic005G227151--Sobic007G196100 Sobic003G326300 Sobic003G326300 Sobic005G227151--Sobic003G326300 Sobic006G142850 Sobic006G142850 Sobic005G227151--Sobic006G142850 Sobic005G227151--Sobic004G029700 Sobic005G227151--Sobic008G184500 Sobic005G186250 Sobic005G186250 Sobic005G227151--Sobic005G186250 Sobic008G184500--Sobic004G029700 Sobic008G184500--Sobic003G103100 Sobic008G184500--Sobic002G105900 Sobic008G184500--Sobic003G319050 Sobic008G184500--Sobic005G227151 Sobic008G184500--Sobic008G184000 Sobic005G176875 Sobic005G176875 Sobic008G184500--Sobic005G176875 Sobic008G184500--Sobic002G097100 Sobic008G184500--Sobic002G007300 Sobic002G105900--Sobic005G227151 Sobic002G105900--Sobic003G099900 Sobic002G105900--Sobic007G196100 Sobic002G105900--Sobic004G207500 Sobic002G105900--Sobic003G326300 Sobic002G105900--Sobic004G029700 Sobic002G105900--Sobic008G184500 Sobic002G273000 Sobic002G273000 Sobic002G105900--Sobic002G273000 Sobic002G105900--Sobic006G142850 Sobic007G131100--Sobic007G025100 Sobic007G131100--Sobic010G035000 Sobic007G131100--Sobic001G297700 Sobic008G082300 Sobic008G082300 Sobic007G131100--Sobic008G082300 Sobic002G358000 Sobic002G358000 Sobic007G131100--Sobic002G358000 Sobic002G300900 Sobic002G300900 Sobic007G131100--Sobic002G300900 Sobic006G105300 Sobic006G105300 Sobic007G131100--Sobic006G105300 Sobic007G131100--Sobic008G184000 Sobic005G184400 Sobic005G184400 Sobic007G131100--Sobic005G184400 Sobic003G319050--Sobic002G097100 Sobic003G319050--Sobic002G007300 Sobic003G319050--Sobic001G297700 Sobic007G199500 Sobic007G199500 Sobic003G319050--Sobic007G199500 Sobic004G071100 Sobic004G071100 Sobic003G319050--Sobic004G071100 Sobic003G319050--Sobic006G105300 Sobic003G319050--Sobic008G184500 Sobic002G015500 Sobic002G015500 Sobic003G319050--Sobic002G015500 Sobic003G319050--Sobic004G029700 Sobic010G035000--Sobic006G105300 Sobic010G035000--Sobic001G297700 Sobic010G035000--Sobic005G184400 Sobic010G035000--Sobic007G131100 Sobic005G184600 Sobic005G184600 Sobic010G035000--Sobic005G184600 Sobic005G184500 Sobic005G184500 Sobic010G035000--Sobic005G184500 Sobic007G049000 Sobic007G049000 Sobic010G035000--Sobic007G049000 Sobic010G035000--Sobic006G142850 Sobic005G185400 Sobic005G185400 Sobic010G035000--Sobic005G185400 Sobic007G025100--Sobic002G300900 Sobic007G025100--Sobic007G131100 Sobic007G025100--Sobic001G297700 Sobic006G040101 Sobic006G040101 Sobic007G025100--Sobic006G040101 Sobic007G025100--Sobic010G035000 Sobic002G059500 Sobic002G059500 Sobic007G025100--Sobic002G059500 Sobic005G035500 Sobic005G035500 Sobic007G025100--Sobic005G035500 Sobic007G025100--Sobic006G105300 Sobic007G025100--Sobic008G082300 Sobic001G297700--Sobic010G035000 Sobic001G297700--Sobic006G105300 Sobic001G297700--Sobic007G025100 Sobic001G297700--Sobic002G300900 Sobic001G297700--Sobic005G184500 Sobic001G297700--Sobic005G185400 Sobic001G297700--Sobic007G131100 Sobic001G297700--Sobic003G319050 Sobic001G297700--Sobic005G184400
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.