Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G358000.1
Synonym Sb02g037910
Functional annotation transmembrane receptor, putative, expressed
UniProt C5XD33
Pfam -
Panther DB PTHR32472 PTHR32472:SF11
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G23440 : Disease resistance protein (TIR-NBS class)
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g36760.1 : transmembrane receptor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a033886
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G082300 DEF3 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
2 Sobic.009G007100 glutelin, putative, expressed -
3 Sobic.007G131100 jmjC domain containing protein, expressed K15601: [histone H3]-dimethyl-L-lysine9 demethylase
4 Sobic.010G035000 - -
5 Sobic.005G184400 - -
6 Sobic.005G186250 - -
7 Sobic.005G184600 - -
8 Sobic.006G142850 - -
9 Sobic.007G049000 OsFBX382 - F-box domain containing protein, expressed -
10 Sobic.006G105300 expressed protein -
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12 Sobic.004G207500 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
13 Sobic.005G189000 - -
14 Sobic.001G297700 expressed protein -
15 Sobic.003G326300 LTPL29 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
16 Sobic.005G083220 - -
17 Sobic.007G025100 expressed protein -
18 Sobic.005G184500 - -
19 Sobic.010G195301 - -
20 Sobic.008G184000 aspartic proteinase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G358000 Sobic002G358000 Sobic008G082300 Sobic008G082300 Sobic002G358000--Sobic008G082300 Sobic009G007100 Sobic009G007100 Sobic002G358000--Sobic009G007100 Sobic007G131100 Sobic007G131100 Sobic002G358000--Sobic007G131100 Sobic010G035000 Sobic010G035000 Sobic002G358000--Sobic010G035000 Sobic005G184400 Sobic005G184400 Sobic002G358000--Sobic005G184400 Sobic005G186250 Sobic005G186250 Sobic002G358000--Sobic005G186250 Sobic005G184600 Sobic005G184600 Sobic002G358000--Sobic005G184600 Sobic006G142850 Sobic006G142850 Sobic002G358000--Sobic006G142850 Sobic007G049000 Sobic007G049000 Sobic002G358000--Sobic007G049000 Sobic008G082300--Sobic002G358000 Sobic008G082300--Sobic007G131100 Sobic008G082300--Sobic009G007100 Sobic008G082300--Sobic010G035000 Sobic003G415300 Sobic003G415300 Sobic008G082300--Sobic003G415300 Sobic008G082300--Sobic005G184400 Sobic006G105300 Sobic006G105300 Sobic008G082300--Sobic006G105300 Sobic008G082300--Sobic005G186250 Sobic008G082300--Sobic005G184600 Sobic009G007100--Sobic005G186250 Sobic009G007100--Sobic007G049000 Sobic009G007100--Sobic005G184400 Sobic009G007100--Sobic006G142850 Sobic009G007100--Sobic005G184600 Sobic004G207500 Sobic004G207500 Sobic009G007100--Sobic004G207500 Sobic005G189000 Sobic005G189000 Sobic009G007100--Sobic005G189000 Sobic009G007100--Sobic002G358000 Sobic009G007100--Sobic008G082300 Sobic007G025100 Sobic007G025100 Sobic007G131100--Sobic007G025100 Sobic007G131100--Sobic010G035000 Sobic001G297700 Sobic001G297700 Sobic007G131100--Sobic001G297700 Sobic007G131100--Sobic008G082300 Sobic007G131100--Sobic002G358000 Sobic002G300900 Sobic002G300900 Sobic007G131100--Sobic002G300900 Sobic007G131100--Sobic006G105300 Sobic008G184000 Sobic008G184000 Sobic007G131100--Sobic008G184000 Sobic007G131100--Sobic005G184400 Sobic010G035000--Sobic006G105300 Sobic010G035000--Sobic001G297700 Sobic010G035000--Sobic005G184400 Sobic010G035000--Sobic007G131100 Sobic010G035000--Sobic005G184600 Sobic005G184500 Sobic005G184500 Sobic010G035000--Sobic005G184500 Sobic010G035000--Sobic007G049000 Sobic010G035000--Sobic006G142850 Sobic005G185400 Sobic005G185400 Sobic010G035000--Sobic005G185400 Sobic005G184400--Sobic005G184600 Sobic005G184400--Sobic007G049000 Sobic005G184400--Sobic006G142850 Sobic005G184400--Sobic006G105300 Sobic005G184400--Sobic005G184500 Sobic005G184400--Sobic010G035000 Sobic005G184400--Sobic005G186250 Sobic005G184400--Sobic009G007100 Sobic005G184400--Sobic005G185400 Sobic005G186250--Sobic009G007100 Sobic005G186250--Sobic007G049000 Sobic005G186250--Sobic006G142850 Sobic005G186250--Sobic004G207500 Sobic005G186250--Sobic005G184400 Sobic005G186250--Sobic005G184600 Sobic005G186250--Sobic005G189000 Sobic005G083220 Sobic005G083220 Sobic005G186250--Sobic005G083220 Sobic005G186250--Sobic006G105300 Sobic005G184600--Sobic005G184400 Sobic005G184600--Sobic007G049000 Sobic005G184600--Sobic006G142850 Sobic005G184600--Sobic006G105300 Sobic005G184600--Sobic005G184500 Sobic005G184600--Sobic005G186250 Sobic005G184600--Sobic010G035000 Sobic005G184600--Sobic009G007100 Sobic005G184600--Sobic005G185400 Sobic006G142850--Sobic007G049000 Sobic006G142850--Sobic005G184600 Sobic006G142850--Sobic005G184400 Sobic006G142850--Sobic005G186250 Sobic006G142850--Sobic006G105300 Sobic006G142850--Sobic009G007100 Sobic006G142850--Sobic010G035000 Sobic006G142850--Sobic004G207500 Sobic006G142850--Sobic005G184500 Sobic007G049000--Sobic005G184600 Sobic007G049000--Sobic005G184400 Sobic007G049000--Sobic006G142850 Sobic007G049000--Sobic005G186250 Sobic007G049000--Sobic006G105300 Sobic007G049000--Sobic009G007100 Sobic007G049000--Sobic005G184500 Sobic007G049000--Sobic010G035000 Sobic007G049000--Sobic005G185400
Octagon: transcription factors


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