Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G083220.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RHY4
Pfam PF01852
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008289; lipid binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G61150 : homeodomain GLABROUS 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g45250.1 : homeobox and START domains containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G189000 - -
2 Sobic.008G144201 - -
3 Sobic.003G415200 DEF1 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
4 Sobic.004G207500 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
5 Sobic.009G086100 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
6 Sobic.009G019700 - -
7 Sobic.005G148100 - -
8 Sobic.005G186250 - -
9 Sobic.009G007100 glutelin, putative, expressed -
10 Sobic.005G189800 - -
11 Sobic.008G181250 - -
12 Sobic.003G326300 LTPL29 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
13 Sobic.003G415300 DEF1 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
14 Sobic.007G196100 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase family protein, expressed K11844: ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16/45
15 Sobic.003G099900 expressed protein -
16 Sobic.006G142850 - -
17 Sobic.005G227151 - -
18 Sobic.007G049000 OsFBX382 - F-box domain containing protein, expressed -
19 Sobic.002G105900 OsFBD15 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
20 Sobic.005G146000 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G083220 Sobic005G083220 Sobic005G189000 Sobic005G189000 Sobic005G083220--Sobic005G189000 Sobic008G144201 Sobic008G144201 Sobic005G083220--Sobic008G144201 Sobic003G415200 Sobic003G415200 Sobic005G083220--Sobic003G415200 Sobic004G207500 Sobic004G207500 Sobic005G083220--Sobic004G207500 Sobic009G086100 Sobic009G086100 Sobic005G083220--Sobic009G086100 Sobic009G019700 Sobic009G019700 Sobic005G083220--Sobic009G019700 Sobic005G148100 Sobic005G148100 Sobic005G083220--Sobic005G148100 Sobic005G186250 Sobic005G186250 Sobic005G083220--Sobic005G186250 Sobic009G007100 Sobic009G007100 Sobic005G083220--Sobic009G007100 Sobic005G189000--Sobic005G083220 Sobic005G189000--Sobic008G144201 Sobic005G189000--Sobic004G207500 Sobic005G189000--Sobic005G186250 Sobic005G189000--Sobic009G007100 Sobic005G189000--Sobic003G415200 Sobic005G189000--Sobic009G086100 Sobic005G189000--Sobic009G019700 Sobic003G326300 Sobic003G326300 Sobic005G189000--Sobic003G326300 Sobic008G144201--Sobic003G415200 Sobic008G144201--Sobic009G019700 Sobic008G144201--Sobic005G083220 Sobic008G144201--Sobic005G148100 Sobic008G144201--Sobic005G189000 Sobic005G189800 Sobic005G189800 Sobic008G144201--Sobic005G189800 Sobic008G181250 Sobic008G181250 Sobic008G144201--Sobic008G181250 Sobic008G144201--Sobic009G086100 Sobic010G136100 Sobic010G136100 Sobic008G144201--Sobic010G136100 Sobic003G415200--Sobic009G019700 Sobic003G415200--Sobic008G144201 Sobic003G415200--Sobic005G148100 Sobic003G415200--Sobic005G189800 Sobic003G415200--Sobic008G181250 Sobic003G415200--Sobic009G086100 Sobic003G415200--Sobic005G083220 Sobic003G415200--Sobic010G136100 Sobic003G415200--Sobic005G189000 Sobic004G207500--Sobic005G186250 Sobic004G207500--Sobic009G007100 Sobic004G207500--Sobic005G189000 Sobic005G227151 Sobic005G227151 Sobic004G207500--Sobic005G227151 Sobic006G142850 Sobic006G142850 Sobic004G207500--Sobic006G142850 Sobic004G207500--Sobic005G083220 Sobic002G105900 Sobic002G105900 Sobic004G207500--Sobic002G105900 Sobic007G049000 Sobic007G049000 Sobic004G207500--Sobic007G049000 Sobic003G099900 Sobic003G099900 Sobic004G207500--Sobic003G099900 Sobic009G086100--Sobic009G019700 Sobic009G086100--Sobic003G415200 Sobic009G086100--Sobic005G189800 Sobic003G415300 Sobic003G415300 Sobic009G086100--Sobic003G415300 Sobic009G086100--Sobic008G144201 Sobic009G086100--Sobic005G148100 Sobic009G086100--Sobic005G083220 Sobic009G086100--Sobic005G189000 Sobic009G086100--Sobic003G326300 Sobic009G019700--Sobic005G189800 Sobic009G019700--Sobic003G415200 Sobic009G019700--Sobic005G148100 Sobic009G019700--Sobic008G144201 Sobic009G019700--Sobic008G181250 Sobic009G019700--Sobic009G086100 Sobic009G019700--Sobic010G136100 Sobic009G019700--Sobic005G083220 Sobic009G019700--Sobic005G189000 Sobic005G148100--Sobic009G019700 Sobic005G148100--Sobic003G415200 Sobic005G148100--Sobic005G189800 Sobic005G148100--Sobic008G144201 Sobic005G148100--Sobic008G181250 Sobic005G148100--Sobic010G136100 Sobic005G148100--Sobic009G086100 Sobic005G148100--Sobic005G083220 Sobic005G146000 Sobic005G146000 Sobic005G148100--Sobic005G146000 Sobic005G186250--Sobic009G007100 Sobic005G186250--Sobic007G049000 Sobic005G186250--Sobic006G142850 Sobic005G186250--Sobic004G207500 Sobic005G184400 Sobic005G184400 Sobic005G186250--Sobic005G184400 Sobic005G184600 Sobic005G184600 Sobic005G186250--Sobic005G184600 Sobic005G186250--Sobic005G189000 Sobic005G186250--Sobic005G083220 Sobic006G105300 Sobic006G105300 Sobic005G186250--Sobic006G105300 Sobic009G007100--Sobic005G186250 Sobic009G007100--Sobic007G049000 Sobic009G007100--Sobic005G184400 Sobic009G007100--Sobic006G142850 Sobic009G007100--Sobic005G184600 Sobic009G007100--Sobic004G207500 Sobic009G007100--Sobic005G189000 Sobic002G358000 Sobic002G358000 Sobic009G007100--Sobic002G358000 Sobic008G082300 Sobic008G082300 Sobic009G007100--Sobic008G082300
Octagon: transcription factors


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