Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G415200.1
Synonym PDF2.3, LCR68
Functional annotation DEF1 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed
UniProt A0A1B6Q808
Pfam PF00304
Panther DB PTHR33147 PTHR33147:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G02130 : low-molecular-weight cysteine-rich 68
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g70680.1 : DEF1 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.003G415200


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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20 Sobic.005G071200 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G415200 Sobic003G415200 Sobic009G019700 Sobic009G019700 Sobic003G415200--Sobic009G019700 Sobic008G144201 Sobic008G144201 Sobic003G415200--Sobic008G144201 Sobic005G148100 Sobic005G148100 Sobic003G415200--Sobic005G148100 Sobic005G189800 Sobic005G189800 Sobic003G415200--Sobic005G189800 Sobic008G181250 Sobic008G181250 Sobic003G415200--Sobic008G181250 Sobic009G086100 Sobic009G086100 Sobic003G415200--Sobic009G086100 Sobic005G083220 Sobic005G083220 Sobic003G415200--Sobic005G083220 Sobic010G136100 Sobic010G136100 Sobic003G415200--Sobic010G136100 Sobic005G189000 Sobic005G189000 Sobic003G415200--Sobic005G189000 Sobic009G019700--Sobic005G189800 Sobic009G019700--Sobic003G415200 Sobic009G019700--Sobic005G148100 Sobic009G019700--Sobic008G144201 Sobic009G019700--Sobic008G181250 Sobic009G019700--Sobic009G086100 Sobic009G019700--Sobic010G136100 Sobic009G019700--Sobic005G083220 Sobic009G019700--Sobic005G189000 Sobic008G144201--Sobic003G415200 Sobic008G144201--Sobic009G019700 Sobic008G144201--Sobic005G083220 Sobic008G144201--Sobic005G148100 Sobic008G144201--Sobic005G189000 Sobic008G144201--Sobic005G189800 Sobic008G144201--Sobic008G181250 Sobic008G144201--Sobic009G086100 Sobic008G144201--Sobic010G136100 Sobic005G148100--Sobic009G019700 Sobic005G148100--Sobic003G415200 Sobic005G148100--Sobic005G189800 Sobic005G148100--Sobic008G144201 Sobic005G148100--Sobic008G181250 Sobic005G148100--Sobic010G136100 Sobic005G148100--Sobic009G086100 Sobic005G148100--Sobic005G083220 Sobic005G146000 Sobic005G146000 Sobic005G148100--Sobic005G146000 Sobic005G189800--Sobic009G019700 Sobic005G189800--Sobic005G148100 Sobic005G189800--Sobic003G415200 Sobic005G189800--Sobic008G181250 Sobic005G189800--Sobic010G136100 Sobic005G189800--Sobic009G086100 Sobic005G189800--Sobic008G144201 Sobic009G196600 Sobic009G196600 Sobic005G189800--Sobic009G196600 Sobic005G189800--Sobic005G083220 Sobic008G181250--Sobic009G019700 Sobic008G181250--Sobic005G148100 Sobic008G181250--Sobic003G415200 Sobic008G181250--Sobic005G189800 Sobic008G181250--Sobic010G136100 Sobic008G181250--Sobic008G144201 Sobic008G181250--Sobic009G086100 Sobic008G181250--Sobic009G196600 Sobic008G181250--Sobic005G083220 Sobic009G086100--Sobic009G019700 Sobic009G086100--Sobic003G415200 Sobic009G086100--Sobic005G189800 Sobic003G415300 Sobic003G415300 Sobic009G086100--Sobic003G415300 Sobic009G086100--Sobic008G144201 Sobic009G086100--Sobic005G148100 Sobic009G086100--Sobic005G083220 Sobic009G086100--Sobic005G189000 Sobic003G326300 Sobic003G326300 Sobic009G086100--Sobic003G326300 Sobic005G083220--Sobic005G189000 Sobic005G083220--Sobic008G144201 Sobic005G083220--Sobic003G415200 Sobic004G207500 Sobic004G207500 Sobic005G083220--Sobic004G207500 Sobic005G083220--Sobic009G086100 Sobic005G083220--Sobic009G019700 Sobic005G083220--Sobic005G148100 Sobic005G186250 Sobic005G186250 Sobic005G083220--Sobic005G186250 Sobic009G007100 Sobic009G007100 Sobic005G083220--Sobic009G007100 Sobic010G136100--Sobic009G196600 Sobic010G136100--Sobic005G189800 Sobic010G136100--Sobic009G019700 Sobic010G136100--Sobic008G181250 Sobic010G136100--Sobic005G148100 Sobic001G220132 Sobic001G220132 Sobic010G136100--Sobic001G220132 Sobic005G189000--Sobic005G083220 Sobic005G189000--Sobic008G144201 Sobic005G189000--Sobic004G207500 Sobic005G189000--Sobic005G186250 Sobic005G189000--Sobic009G007100 Sobic005G189000--Sobic003G415200 Sobic005G189000--Sobic009G086100 Sobic005G189000--Sobic009G019700 Sobic005G189000--Sobic003G326300
Octagon: transcription factors


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