Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G058500.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PQE7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G178200 hypothetical protein -
2 Sobic.005G189800 - -
3 Sobic.009G086100 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
4 Sobic.003G415300 DEF1 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
5 Sobic.009G019700 - -
6 Sobic.010G136100 "kafirin seed storage protein, delta-kafirin precursor"(PubMedID : 21853065)@- -
7 Sobic.008G188200 - -
8 Sobic.004G354500 expressed protein -
9 Sobic.005G148100 - -
10 Sobic.003G415200 DEF1 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
11 Sobic.005G146000 - -
12 Sobic.008G181250 - -
13 Sobic.004G076900 - -
14 Sobic.003G326300 LTPL29 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
15 Sobic.010G195301 - -
16 Sobic.009G196600 expressed protein -
17 Sobic.007G024000 - -
18 Sobic.008G144201 - -
19 Sobic.004G132200 - -
20 Sobic.001G220132 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G058500 Sobic005G058500 Sobic005G178200 Sobic005G178200 Sobic005G058500--Sobic005G178200 Sobic005G189800 Sobic005G189800 Sobic005G058500--Sobic005G189800 Sobic009G086100 Sobic009G086100 Sobic005G058500--Sobic009G086100 Sobic003G415300 Sobic003G415300 Sobic005G058500--Sobic003G415300 Sobic009G019700 Sobic009G019700 Sobic005G058500--Sobic009G019700 Sobic010G136100 Sobic010G136100 Sobic005G058500--Sobic010G136100 Sobic008G188200 Sobic008G188200 Sobic005G058500--Sobic008G188200 Sobic004G354500 Sobic004G354500 Sobic005G058500--Sobic004G354500 Sobic005G148100 Sobic005G148100 Sobic005G058500--Sobic005G148100 Sobic005G178200--Sobic003G415300 Sobic005G178200--Sobic008G188200 Sobic010G195301 Sobic010G195301 Sobic005G178200--Sobic010G195301 Sobic005G178200--Sobic005G058500 Sobic005G178200--Sobic009G086100 Sobic005G178200--Sobic004G354500 Sobic003G326300 Sobic003G326300 Sobic005G178200--Sobic003G326300 Sobic008G082300 Sobic008G082300 Sobic005G178200--Sobic008G082300 Sobic008G069200 Sobic008G069200 Sobic005G178200--Sobic008G069200 Sobic005G189800--Sobic009G019700 Sobic005G189800--Sobic005G148100 Sobic003G415200 Sobic003G415200 Sobic005G189800--Sobic003G415200 Sobic008G181250 Sobic008G181250 Sobic005G189800--Sobic008G181250 Sobic005G189800--Sobic010G136100 Sobic005G189800--Sobic009G086100 Sobic008G144201 Sobic008G144201 Sobic005G189800--Sobic008G144201 Sobic009G196600 Sobic009G196600 Sobic005G189800--Sobic009G196600 Sobic005G083220 Sobic005G083220 Sobic005G189800--Sobic005G083220 Sobic009G086100--Sobic009G019700 Sobic009G086100--Sobic003G415200 Sobic009G086100--Sobic005G189800 Sobic009G086100--Sobic003G415300 Sobic009G086100--Sobic008G144201 Sobic009G086100--Sobic005G148100 Sobic009G086100--Sobic005G083220 Sobic005G189000 Sobic005G189000 Sobic009G086100--Sobic005G189000 Sobic009G086100--Sobic003G326300 Sobic003G415300--Sobic005G178200 Sobic003G415300--Sobic009G086100 Sobic003G415300--Sobic003G326300 Sobic003G415300--Sobic008G188200 Sobic003G415300--Sobic010G195301 Sobic003G415300--Sobic008G082300 Sobic003G415300--Sobic005G189000 Sobic003G415300--Sobic005G083220 Sobic002G358000 Sobic002G358000 Sobic003G415300--Sobic002G358000 Sobic009G019700--Sobic005G189800 Sobic009G019700--Sobic003G415200 Sobic009G019700--Sobic005G148100 Sobic009G019700--Sobic008G144201 Sobic009G019700--Sobic008G181250 Sobic009G019700--Sobic009G086100 Sobic009G019700--Sobic010G136100 Sobic009G019700--Sobic005G083220 Sobic009G019700--Sobic005G189000 Sobic010G136100--Sobic009G196600 Sobic010G136100--Sobic005G189800 Sobic010G136100--Sobic009G019700 Sobic010G136100--Sobic008G181250 Sobic010G136100--Sobic005G148100 Sobic001G220132 Sobic001G220132 Sobic010G136100--Sobic001G220132 Sobic008G188200--Sobic008G069200 Sobic008G188200--Sobic005G178200 Sobic008G188200--Sobic003G415300 Sobic008G188200--Sobic003G326300 Sobic008G188200--Sobic005G058500 Sobic008G188200--Sobic008G082300 Sobic008G188200--Sobic010G195301 Sobic008G188200--Sobic009G086100 Sobic008G184000 Sobic008G184000 Sobic008G188200--Sobic008G184000 Sobic004G354500--Sobic005G178200 Sobic007G024000 Sobic007G024000 Sobic004G354500--Sobic007G024000 Sobic004G354500--Sobic005G058500 Sobic004G354500--Sobic008G188200 Sobic004G354500--Sobic003G415300 Sobic004G354500--Sobic010G195301 Sobic004G354500--Sobic009G086100 Sobic004G354500--Sobic008G069200 Sobic004G090500 Sobic004G090500 Sobic004G354500--Sobic004G090500 Sobic005G148100--Sobic009G019700 Sobic005G148100--Sobic003G415200 Sobic005G148100--Sobic005G189800 Sobic005G148100--Sobic008G144201 Sobic005G148100--Sobic008G181250 Sobic005G148100--Sobic010G136100 Sobic005G148100--Sobic009G086100 Sobic005G148100--Sobic005G083220 Sobic005G146000 Sobic005G146000 Sobic005G148100--Sobic005G146000
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.