Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G178200.1
Synonym
Functional annotation hypothetical protein
UniProt A0A1B6PT83
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) ChrUn.fgenesh.mRNA.41 : hypothetical protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G415300 DEF1 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
2 Sobic.008G188200 - -
3 Sobic.010G195301 - -
4 Sobic.005G058500 - -
5 Sobic.009G086100 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
6 Sobic.004G354500 expressed protein -
7 Sobic.003G326300 LTPL29 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
8 Sobic.008G082300 DEF3 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
9 Sobic.008G069200 OsMADS13 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed -
10 Sobic.005G189800 - -
11 Sobic.009G019700 - -
12 Sobic.002G358000 transmembrane receptor, putative, expressed -
13 Sobic.003G415200 DEF1 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
14 Sobic.007G024000 - -
15 Sobic.005G189000 - -
16 Sobic.008G144201 - -
17 Sobic.005G083220 - -
18 Sobic.005G148100 - -
19 Sobic.008G064100 flavin monooxygenase, putative, expressed K11816: indole-3-pyruvate monooxygenase
20 Sobic.009G007100 glutelin, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G178200 Sobic005G178200 Sobic003G415300 Sobic003G415300 Sobic005G178200--Sobic003G415300 Sobic008G188200 Sobic008G188200 Sobic005G178200--Sobic008G188200 Sobic010G195301 Sobic010G195301 Sobic005G178200--Sobic010G195301 Sobic005G058500 Sobic005G058500 Sobic005G178200--Sobic005G058500 Sobic009G086100 Sobic009G086100 Sobic005G178200--Sobic009G086100 Sobic004G354500 Sobic004G354500 Sobic005G178200--Sobic004G354500 Sobic003G326300 Sobic003G326300 Sobic005G178200--Sobic003G326300 Sobic008G082300 Sobic008G082300 Sobic005G178200--Sobic008G082300 Sobic008G069200 Sobic008G069200 Sobic005G178200--Sobic008G069200 Sobic003G415300--Sobic005G178200 Sobic003G415300--Sobic009G086100 Sobic003G415300--Sobic003G326300 Sobic003G415300--Sobic008G188200 Sobic003G415300--Sobic010G195301 Sobic003G415300--Sobic008G082300 Sobic005G189000 Sobic005G189000 Sobic003G415300--Sobic005G189000 Sobic005G083220 Sobic005G083220 Sobic003G415300--Sobic005G083220 Sobic002G358000 Sobic002G358000 Sobic003G415300--Sobic002G358000 Sobic008G188200--Sobic008G069200 Sobic008G188200--Sobic005G178200 Sobic008G188200--Sobic003G415300 Sobic008G188200--Sobic003G326300 Sobic008G188200--Sobic005G058500 Sobic008G188200--Sobic008G082300 Sobic008G188200--Sobic010G195301 Sobic008G188200--Sobic009G086100 Sobic008G184000 Sobic008G184000 Sobic008G188200--Sobic008G184000 Sobic010G195301--Sobic003G415300 Sobic010G195301--Sobic005G178200 Sobic010G195301--Sobic009G086100 Sobic010G195301--Sobic008G188200 Sobic010G195301--Sobic008G082300 Sobic010G195301--Sobic003G326300 Sobic010G195301--Sobic002G358000 Sobic010G195301--Sobic005G189000 Sobic008G144201 Sobic008G144201 Sobic010G195301--Sobic008G144201 Sobic005G058500--Sobic005G178200 Sobic005G189800 Sobic005G189800 Sobic005G058500--Sobic005G189800 Sobic005G058500--Sobic009G086100 Sobic005G058500--Sobic003G415300 Sobic009G019700 Sobic009G019700 Sobic005G058500--Sobic009G019700 Sobic010G136100 Sobic010G136100 Sobic005G058500--Sobic010G136100 Sobic005G058500--Sobic008G188200 Sobic005G058500--Sobic004G354500 Sobic005G148100 Sobic005G148100 Sobic005G058500--Sobic005G148100 Sobic009G086100--Sobic009G019700 Sobic003G415200 Sobic003G415200 Sobic009G086100--Sobic003G415200 Sobic009G086100--Sobic005G189800 Sobic009G086100--Sobic003G415300 Sobic009G086100--Sobic008G144201 Sobic009G086100--Sobic005G148100 Sobic009G086100--Sobic005G083220 Sobic009G086100--Sobic005G189000 Sobic009G086100--Sobic003G326300 Sobic004G354500--Sobic005G178200 Sobic007G024000 Sobic007G024000 Sobic004G354500--Sobic007G024000 Sobic004G354500--Sobic005G058500 Sobic004G354500--Sobic008G188200 Sobic004G354500--Sobic003G415300 Sobic004G354500--Sobic010G195301 Sobic004G354500--Sobic009G086100 Sobic004G354500--Sobic008G069200 Sobic004G090500 Sobic004G090500 Sobic004G354500--Sobic004G090500 Sobic007G196100 Sobic007G196100 Sobic003G326300--Sobic007G196100 Sobic002G105900 Sobic002G105900 Sobic003G326300--Sobic002G105900 Sobic003G326300--Sobic003G415300 Sobic005G227151 Sobic005G227151 Sobic003G326300--Sobic005G227151 Sobic003G326300--Sobic009G086100 Sobic004G207500 Sobic004G207500 Sobic003G326300--Sobic004G207500 Sobic003G099900 Sobic003G099900 Sobic003G326300--Sobic003G099900 Sobic003G326300--Sobic005G189000 Sobic005G146000 Sobic005G146000 Sobic003G326300--Sobic005G146000 Sobic008G082300--Sobic002G358000 Sobic007G131100 Sobic007G131100 Sobic008G082300--Sobic007G131100 Sobic009G007100 Sobic009G007100 Sobic008G082300--Sobic009G007100 Sobic010G035000 Sobic010G035000 Sobic008G082300--Sobic010G035000 Sobic008G082300--Sobic003G415300 Sobic005G184400 Sobic005G184400 Sobic008G082300--Sobic005G184400 Sobic006G105300 Sobic006G105300 Sobic008G082300--Sobic006G105300 Sobic005G186250 Sobic005G186250 Sobic008G082300--Sobic005G186250 Sobic005G184600 Sobic005G184600 Sobic008G082300--Sobic005G184600 Sobic008G069200--Sobic008G188200 Sobic008G069200--Sobic004G090500 Sobic008G069200--Sobic005G178200 Sobic008G069200--Sobic003G415300 Sobic008G069200--Sobic003G326300 Sobic008G069200--Sobic007G024000 Sobic008G069200--Sobic008G184000 Sobic008G069200--Sobic005G058500 Sobic008G069200--Sobic008G082300
Octagon: transcription factors


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