Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G227151.3,Sobic.005G227151.2,Sobic.005G227151.1,Sobic.005G227151.4
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RK14 , A0A1Z5RK22
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g08730.1 : pumilio domain-containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G105900 OsFBD15 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
2 Sobic.003G099900 expressed protein -
3 Sobic.004G207500 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
4 Sobic.007G196100 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase family protein, expressed K11844: ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16/45
5 Sobic.003G326300 LTPL29 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
6 Sobic.006G142850 - -
7 Sobic.004G029700 expressed protein -
8 Sobic.008G184500 aspartic proteinase, putative, expressed -
9 Sobic.005G186250 - -
10 Sobic.008G184000 aspartic proteinase, putative, expressed -
11 Sobic.009G007100 glutelin, putative, expressed -
12 Sobic.002G273000 OsFBL7 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
13 Sobic.003G319050 - -
14 Sobic.007G049000 OsFBX382 - F-box domain containing protein, expressed -
15 Sobic.005G184400 - -
16 Sobic.005G189000 - -
17 Sobic.006G105300 expressed protein -
18 Sobic.005G184600 - -
19 Sobic.010G035000 - -
20 Sobic.005G083220 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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