Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G184500.1
Synonym Sb08g022620
Functional annotation aspartic proteinase, putative, expressed
UniProt A0A1Z5R7L5
Pfam PF00026
Panther DB PTHR13683 PTHR13683:SF308
NCBI CDD KOG1339; Aspartyl protease
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006508; proteolysis GO:0004190aspartic-type endopeptidase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G01300 : Eukaryotic aspartyl protease family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g41550.1 : aspartic proteinase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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10 Sobic.001G269650 - -
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13 Sobic.003G099900 expressed protein -
14 Sobic.002G015500 OsFBD13 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
15 Sobic.005G052200 expressed protein -
16 Sobic.006G142850 - -
17 Sobic.010G133150 - -
18 Sobic.001G297700 expressed protein -
19 Sobic.001G495700 Core histone H2A/H2B/H3/H4 domain containing protein, putative, expressed K11251: histone H2A
20 Sobic.007G196100 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase family protein, expressed K11844: ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16/45


Gene co-expression network
sample Sobic008G184500 Sobic008G184500 Sobic004G029700 Sobic004G029700 Sobic008G184500--Sobic004G029700 Sobic003G103100 Sobic003G103100 Sobic008G184500--Sobic003G103100 Sobic002G105900 Sobic002G105900 Sobic008G184500--Sobic002G105900 Sobic003G319050 Sobic003G319050 Sobic008G184500--Sobic003G319050 Sobic005G227151 Sobic005G227151 Sobic008G184500--Sobic005G227151 Sobic008G184000 Sobic008G184000 Sobic008G184500--Sobic008G184000 Sobic005G176875 Sobic005G176875 Sobic008G184500--Sobic005G176875 Sobic002G097100 Sobic002G097100 Sobic008G184500--Sobic002G097100 Sobic002G007300 Sobic002G007300 Sobic008G184500--Sobic002G007300 Sobic004G029700--Sobic008G184500 Sobic004G029700--Sobic003G103100 Sobic004G029700--Sobic002G105900 Sobic004G029700--Sobic005G227151 Sobic004G029700--Sobic003G319050 Sobic004G029700--Sobic008G184000 Sobic004G029700--Sobic002G097100 Sobic004G029700--Sobic002G007300 Sobic003G099900 Sobic003G099900 Sobic004G029700--Sobic003G099900 Sobic003G103100--Sobic004G029700 Sobic003G103100--Sobic008G184500 Sobic005G052200 Sobic005G052200 Sobic003G103100--Sobic005G052200 Sobic005G042400 Sobic005G042400 Sobic003G103100--Sobic005G042400 Sobic004G114700 Sobic004G114700 Sobic003G103100--Sobic004G114700 Sobic005G124400 Sobic005G124400 Sobic003G103100--Sobic005G124400 Sobic003G103100--Sobic008G184000 Sobic009G062300 Sobic009G062300 Sobic003G103100--Sobic009G062300 Sobic003G103100--Sobic002G105900 Sobic002G105900--Sobic005G227151 Sobic002G105900--Sobic003G099900 Sobic007G196100 Sobic007G196100 Sobic002G105900--Sobic007G196100 Sobic004G207500 Sobic004G207500 Sobic002G105900--Sobic004G207500 Sobic003G326300 Sobic003G326300 Sobic002G105900--Sobic003G326300 Sobic002G105900--Sobic004G029700 Sobic002G105900--Sobic008G184500 Sobic002G273000 Sobic002G273000 Sobic002G105900--Sobic002G273000 Sobic006G142850 Sobic006G142850 Sobic002G105900--Sobic006G142850 Sobic003G319050--Sobic002G097100 Sobic003G319050--Sobic002G007300 Sobic001G297700 Sobic001G297700 Sobic003G319050--Sobic001G297700 Sobic007G199500 Sobic007G199500 Sobic003G319050--Sobic007G199500 Sobic004G071100 Sobic004G071100 Sobic003G319050--Sobic004G071100 Sobic006G105300 Sobic006G105300 Sobic003G319050--Sobic006G105300 Sobic003G319050--Sobic008G184500 Sobic002G015500 Sobic002G015500 Sobic003G319050--Sobic002G015500 Sobic003G319050--Sobic004G029700 Sobic005G227151--Sobic002G105900 Sobic005G227151--Sobic003G099900 Sobic005G227151--Sobic004G207500 Sobic005G227151--Sobic007G196100 Sobic005G227151--Sobic003G326300 Sobic005G227151--Sobic006G142850 Sobic005G227151--Sobic004G029700 Sobic005G227151--Sobic008G184500 Sobic005G186250 Sobic005G186250 Sobic005G227151--Sobic005G186250 Sobic008G184000--Sobic004G029700 Sobic008G184000--Sobic005G227151 Sobic008G184000--Sobic008G184500 Sobic008G184000--Sobic002G105900 Sobic007G131100 Sobic007G131100 Sobic008G184000--Sobic007G131100 Sobic008G184000--Sobic003G319050 Sobic010G035000 Sobic010G035000 Sobic008G184000--Sobic010G035000 Sobic007G025100 Sobic007G025100 Sobic008G184000--Sobic007G025100 Sobic008G184000--Sobic001G297700 Sobic005G176875--Sobic008G184500 Sobic001G269650 Sobic001G269650 Sobic005G176875--Sobic001G269650 Sobic005G176875--Sobic002G015500 Sobic005G176875--Sobic002G097100 Sobic001G495700 Sobic001G495700 Sobic005G176875--Sobic001G495700 Sobic005G176875--Sobic003G319050 Sobic005G176875--Sobic004G071100 Sobic010G133150 Sobic010G133150 Sobic005G176875--Sobic010G133150 Sobic005G176875--Sobic007G199500 Sobic002G097100--Sobic002G015500 Sobic002G097100--Sobic003G319050 Sobic002G097100--Sobic001G495700 Sobic002G097100--Sobic010G133150 Sobic009G057100 Sobic009G057100 Sobic002G097100--Sobic009G057100 Sobic002G097100--Sobic007G199500 Sobic002G097100--Sobic004G071100 Sobic002G097100--Sobic002G007300 Sobic005G147500 Sobic005G147500 Sobic002G097100--Sobic005G147500 Sobic002G007300--Sobic003G319050 Sobic002G007300--Sobic002G097100 Sobic002G007300--Sobic006G105300 Sobic002G007300--Sobic001G297700 Sobic002G007300--Sobic004G071100 Sobic002G007300--Sobic002G015500 Sobic002G007300--Sobic007G199500 Sobic002G007300--Sobic009G057100 Sobic005G033400 Sobic005G033400 Sobic002G007300--Sobic005G033400
Octagon: transcription factors


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