Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G176875.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PT74
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g03810.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a056037
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G184500 aspartic proteinase, putative, expressed -
2 Sobic.001G269650 - -
3 Sobic.002G015500 OsFBD13 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
4 Sobic.002G097100 OsFBLD6 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
5 Sobic.001G495700 Core histone H2A/H2B/H3/H4 domain containing protein, putative, expressed K11251: histone H2A
6 Sobic.003G319050 - -
7 Sobic.004G071100 - -
8 Sobic.010G133150 - -
9 Sobic.007G199500 MBTB30 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
10 Sobic.004G029700 expressed protein -
11 Sobic.002G007300 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K14962: WDR82, SWD2, COMPASS component SWD2
12 Sobic.009G057100 - -
13 Sobic.001G297700 expressed protein -
14 Sobic.007G066200 - -
15 Sobic.002G300900 - -
16 Sobic.008G184000 aspartic proteinase, putative, expressed -
17 Sobic.005G033400 heavy-metal-associated domain-containing protein, putative, expressed -
18 Sobic.003G103100 - -
19 Sobic.001G511400 BES1/BZR1 homolog protein, putative, expressed -
20 Sobic.010G047300 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G176875 Sobic005G176875 Sobic008G184500 Sobic008G184500 Sobic005G176875--Sobic008G184500 Sobic001G269650 Sobic001G269650 Sobic005G176875--Sobic001G269650 Sobic002G015500 Sobic002G015500 Sobic005G176875--Sobic002G015500 Sobic002G097100 Sobic002G097100 Sobic005G176875--Sobic002G097100 Sobic001G495700 Sobic001G495700 Sobic005G176875--Sobic001G495700 Sobic003G319050 Sobic003G319050 Sobic005G176875--Sobic003G319050 Sobic004G071100 Sobic004G071100 Sobic005G176875--Sobic004G071100 Sobic010G133150 Sobic010G133150 Sobic005G176875--Sobic010G133150 Sobic007G199500 Sobic007G199500 Sobic005G176875--Sobic007G199500 Sobic004G029700 Sobic004G029700 Sobic008G184500--Sobic004G029700 Sobic003G103100 Sobic003G103100 Sobic008G184500--Sobic003G103100 Sobic002G105900 Sobic002G105900 Sobic008G184500--Sobic002G105900 Sobic008G184500--Sobic003G319050 Sobic005G227151 Sobic005G227151 Sobic008G184500--Sobic005G227151 Sobic008G184000 Sobic008G184000 Sobic008G184500--Sobic008G184000 Sobic008G184500--Sobic005G176875 Sobic008G184500--Sobic002G097100 Sobic002G007300 Sobic002G007300 Sobic008G184500--Sobic002G007300 Sobic007G066200 Sobic007G066200 Sobic001G269650--Sobic007G066200 Sobic009G062300 Sobic009G062300 Sobic001G269650--Sobic009G062300 Sobic001G269650--Sobic005G176875 Sobic005G226800 Sobic005G226800 Sobic001G269650--Sobic005G226800 Sobic001G269650--Sobic001G495700 Sobic001G269650--Sobic008G184500 Sobic003G211600 Sobic003G211600 Sobic001G269650--Sobic003G211600 Sobic001G269650--Sobic002G015500 Sobic005G124400 Sobic005G124400 Sobic001G269650--Sobic005G124400 Sobic002G015500--Sobic002G097100 Sobic002G015500--Sobic001G495700 Sobic002G015500--Sobic010G133150 Sobic009G057100 Sobic009G057100 Sobic002G015500--Sobic009G057100 Sobic007G032500 Sobic007G032500 Sobic002G015500--Sobic007G032500 Sobic002G015500--Sobic004G071100 Sobic001G511400 Sobic001G511400 Sobic002G015500--Sobic001G511400 Sobic005G147500 Sobic005G147500 Sobic002G015500--Sobic005G147500 Sobic009G058300 Sobic009G058300 Sobic002G015500--Sobic009G058300 Sobic002G097100--Sobic002G015500 Sobic002G097100--Sobic003G319050 Sobic002G097100--Sobic001G495700 Sobic002G097100--Sobic010G133150 Sobic002G097100--Sobic009G057100 Sobic002G097100--Sobic007G199500 Sobic002G097100--Sobic004G071100 Sobic002G097100--Sobic002G007300 Sobic002G097100--Sobic005G147500 Sobic001G495700--Sobic002G015500 Sobic001G495700--Sobic010G133150 Sobic001G495700--Sobic002G097100 Sobic001G495700--Sobic007G032500 Sobic005G174200 Sobic005G174200 Sobic001G495700--Sobic005G174200 Sobic001G495700--Sobic001G511400 Sobic002G015400 Sobic002G015400 Sobic001G495700--Sobic002G015400 Sobic001G495700--Sobic009G058300 Sobic001G495700--Sobic007G199500 Sobic003G319050--Sobic002G097100 Sobic003G319050--Sobic002G007300 Sobic001G297700 Sobic001G297700 Sobic003G319050--Sobic001G297700 Sobic003G319050--Sobic007G199500 Sobic003G319050--Sobic004G071100 Sobic006G105300 Sobic006G105300 Sobic003G319050--Sobic006G105300 Sobic003G319050--Sobic008G184500 Sobic003G319050--Sobic002G015500 Sobic003G319050--Sobic004G029700 Sobic004G071100--Sobic009G057100 Sobic005G033400 Sobic005G033400 Sobic004G071100--Sobic005G033400 Sobic006G081400 Sobic006G081400 Sobic004G071100--Sobic006G081400 Sobic005G185400 Sobic005G185400 Sobic004G071100--Sobic005G185400 Sobic004G071100--Sobic005G147500 Sobic004G071100--Sobic002G097100 Sobic004G071100--Sobic003G319050 Sobic004G071100--Sobic002G015500 Sobic004G071100--Sobic001G297700 Sobic010G133150--Sobic001G495700 Sobic010G133150--Sobic002G097100 Sobic010G133150--Sobic002G015500 Sobic010G133150--Sobic007G032500 Sobic010G133150--Sobic003G319050 Sobic010G133150--Sobic005G174200 Sobic010G133150--Sobic009G057100 Sobic010G133150--Sobic001G511400 Sobic010G133150--Sobic007G199500 Sobic007G199500--Sobic002G097100 Sobic007G199500--Sobic003G319050 Sobic007G199500--Sobic001G297700 Sobic007G199500--Sobic002G015500 Sobic002G300900 Sobic002G300900 Sobic007G199500--Sobic002G300900 Sobic007G199500--Sobic001G495700 Sobic007G199500--Sobic004G071100 Sobic007G199500--Sobic009G057100 Sobic007G199500--Sobic002G007300
Octagon: transcription factors


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