Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G007300.1
Synonym Sb02g000850
Functional annotation WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed
UniProt C5X781
Pfam PF00400
Panther DB PTHR19861 PTHR19861:SF3
NCBI CDD KOG1446; Histone H3 (Lys4) methyltransferase complex and RNA cleavage factor II complex, subunit SWD2
KEGG Orthology K14962; WDR82, SWD2, COMPASS component SWD2
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G66240 : Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g40030.1 : WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a010015 , Zm00025a044874
Brachypodium -
Barley HORVU4Hr1G012500.1 , HORVU4Hr1G012500.3 , HORVU4Hr1G012500.8 , HORVU4Hr1G012500.5 , HORVU4Hr1G012500.16 , HORVU4Hr1G012500.17 , HORVU4Hr1G012500.14 , HORVU4Hr1G012500.15 , HORVU4Hr1G012500.12 , HORVU4Hr1G012500.13 , HORVU4Hr1G012500.10
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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16 Sobic.004G029700 expressed protein -
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18 Sobic.006G142850 - -
19 Sobic.008G184000 aspartic proteinase, putative, expressed -
20 Sobic.001G511400 BES1/BZR1 homolog protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G007300 Sobic002G007300 Sobic003G319050 Sobic003G319050 Sobic002G007300--Sobic003G319050 Sobic002G097100 Sobic002G097100 Sobic002G007300--Sobic002G097100 Sobic006G105300 Sobic006G105300 Sobic002G007300--Sobic006G105300 Sobic001G297700 Sobic001G297700 Sobic002G007300--Sobic001G297700 Sobic004G071100 Sobic004G071100 Sobic002G007300--Sobic004G071100 Sobic002G015500 Sobic002G015500 Sobic002G007300--Sobic002G015500 Sobic007G199500 Sobic007G199500 Sobic002G007300--Sobic007G199500 Sobic009G057100 Sobic009G057100 Sobic002G007300--Sobic009G057100 Sobic005G033400 Sobic005G033400 Sobic002G007300--Sobic005G033400 Sobic003G319050--Sobic002G097100 Sobic003G319050--Sobic002G007300 Sobic003G319050--Sobic001G297700 Sobic003G319050--Sobic007G199500 Sobic003G319050--Sobic004G071100 Sobic003G319050--Sobic006G105300 Sobic008G184500 Sobic008G184500 Sobic003G319050--Sobic008G184500 Sobic003G319050--Sobic002G015500 Sobic004G029700 Sobic004G029700 Sobic003G319050--Sobic004G029700 Sobic002G097100--Sobic002G015500 Sobic002G097100--Sobic003G319050 Sobic001G495700 Sobic001G495700 Sobic002G097100--Sobic001G495700 Sobic010G133150 Sobic010G133150 Sobic002G097100--Sobic010G133150 Sobic002G097100--Sobic009G057100 Sobic002G097100--Sobic007G199500 Sobic002G097100--Sobic004G071100 Sobic002G097100--Sobic002G007300 Sobic005G147500 Sobic005G147500 Sobic002G097100--Sobic005G147500 Sobic010G035000 Sobic010G035000 Sobic006G105300--Sobic010G035000 Sobic005G184400 Sobic005G184400 Sobic006G105300--Sobic005G184400 Sobic005G184600 Sobic005G184600 Sobic006G105300--Sobic005G184600 Sobic005G184500 Sobic005G184500 Sobic006G105300--Sobic005G184500 Sobic007G049000 Sobic007G049000 Sobic006G105300--Sobic007G049000 Sobic006G142850 Sobic006G142850 Sobic006G105300--Sobic006G142850 Sobic006G105300--Sobic001G297700 Sobic005G185400 Sobic005G185400 Sobic006G105300--Sobic005G185400 Sobic009G007100 Sobic009G007100 Sobic006G105300--Sobic009G007100 Sobic001G297700--Sobic010G035000 Sobic001G297700--Sobic006G105300 Sobic007G025100 Sobic007G025100 Sobic001G297700--Sobic007G025100 Sobic002G300900 Sobic002G300900 Sobic001G297700--Sobic002G300900 Sobic001G297700--Sobic005G184500 Sobic001G297700--Sobic005G185400 Sobic007G131100 Sobic007G131100 Sobic001G297700--Sobic007G131100 Sobic001G297700--Sobic003G319050 Sobic001G297700--Sobic005G184400 Sobic004G071100--Sobic009G057100 Sobic004G071100--Sobic005G033400 Sobic006G081400 Sobic006G081400 Sobic004G071100--Sobic006G081400 Sobic004G071100--Sobic005G185400 Sobic004G071100--Sobic005G147500 Sobic004G071100--Sobic002G097100 Sobic004G071100--Sobic003G319050 Sobic004G071100--Sobic002G015500 Sobic004G071100--Sobic001G297700 Sobic002G015500--Sobic002G097100 Sobic002G015500--Sobic001G495700 Sobic002G015500--Sobic010G133150 Sobic002G015500--Sobic009G057100 Sobic007G032500 Sobic007G032500 Sobic002G015500--Sobic007G032500 Sobic002G015500--Sobic004G071100 Sobic001G511400 Sobic001G511400 Sobic002G015500--Sobic001G511400 Sobic002G015500--Sobic005G147500 Sobic009G058300 Sobic009G058300 Sobic002G015500--Sobic009G058300 Sobic007G199500--Sobic002G097100 Sobic007G199500--Sobic003G319050 Sobic007G199500--Sobic001G297700 Sobic007G199500--Sobic002G015500 Sobic007G199500--Sobic002G300900 Sobic007G199500--Sobic001G495700 Sobic007G199500--Sobic004G071100 Sobic007G199500--Sobic009G057100 Sobic007G199500--Sobic002G007300 Sobic009G057100--Sobic005G147500 Sobic009G057100--Sobic006G081400 Sobic009G057100--Sobic004G071100 Sobic005G188800 Sobic005G188800 Sobic009G057100--Sobic005G188800 Sobic009G057100--Sobic005G033400 Sobic001G284700 Sobic001G284700 Sobic009G057100--Sobic001G284700 Sobic009G057100--Sobic002G015500 Sobic004G029800 Sobic004G029800 Sobic009G057100--Sobic004G029800 Sobic003G294800 Sobic003G294800 Sobic009G057100--Sobic003G294800 Sobic005G033400--Sobic006G081400 Sobic005G033400--Sobic009G057100 Sobic005G033400--Sobic004G071100 Sobic005G033400--Sobic005G185400 Sobic005G033400--Sobic005G188800 Sobic005G033400--Sobic005G147500 Sobic005G033400--Sobic004G029800 Sobic005G033400--Sobic005G184500 Sobic010G031400 Sobic010G031400 Sobic005G033400--Sobic010G031400
Octagon: transcription factors


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