Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G511400.1
Synonym Sb01g047720, BEH2
Functional annotation BES1/BZR1 homolog protein, putative, expressed
UniProt C5WYY1
Pfam PF05687
Panther DB PTHR31506 PTHR31506:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G36780 : BES1/BZR1 homolog 2
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g35900.1 : BES1/BZR1 homolog protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a022988 , Zm00025a051082 , Zm00025a048509 , Zm00025a000535 , Zm00025a014997
Brachypodium KQJ94168 , KQK15538
Barley HORVU0Hr1G040070.6 , HORVU0Hr1G040070.3 , HORVU0Hr1G040070.2 , HORVU0Hr1G040070.1 , HORVU6Hr1G081650.2 , HORVU6Hr1G081650.1
Wheat TraesCS6B02G368700 , TraesCS6D02G318800 , TraesCS2A02G187800 , TraesCS2B02G219300 , TraesCS2D02G199900 , TraesCS6A02G338000
Populus -


JBrowse

Open New Page


cDNA sequences
Sobic.001G511400


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G015400 OsFBD13 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
2 Sobic.002G172200 receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed -
3 Sobic.008G159300 KUN1 - Kunitz-type trypsin inhibitor precursor, expressed -
4 Sobic.002G172100 receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed -
5 Sobic.003G266100 ESP4, putative, expressed K06100: symplekin
6 Sobic.005G147500 - -
7 Sobic.001G284700 - -
8 Sobic.009G058300 expressed protein -
9 Sobic.005G082300 - -
10 Sobic.002G059500 OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed -
11 Sobic.009G057100 - -
12 Sobic.001G495700 Core histone H2A/H2B/H3/H4 domain containing protein, putative, expressed K11251: histone H2A
13 Sobic.002G300900 - -
14 Sobic.002G015500 OsFBD13 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
15 Sobic.003G294800 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.006G040101 - -
17 Sobic.002G097100 OsFBLD6 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
18 Sobic.005G188800 - -
19 Sobic.002G058900 OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.007G032500 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K11462: polycomb protein EED


Gene co-expression network
sample Sobic001G511400 Sobic001G511400 Sobic002G015400 Sobic002G015400 Sobic001G511400--Sobic002G015400 Sobic002G172200 Sobic002G172200 Sobic001G511400--Sobic002G172200 Sobic008G159300 Sobic008G159300 Sobic001G511400--Sobic008G159300 Sobic002G172100 Sobic002G172100 Sobic001G511400--Sobic002G172100 Sobic003G266100 Sobic003G266100 Sobic001G511400--Sobic003G266100 Sobic005G147500 Sobic005G147500 Sobic001G511400--Sobic005G147500 Sobic001G284700 Sobic001G284700 Sobic001G511400--Sobic001G284700 Sobic009G058300 Sobic009G058300 Sobic001G511400--Sobic009G058300 Sobic005G082300 Sobic005G082300 Sobic001G511400--Sobic005G082300 Sobic002G015400--Sobic008G159300 Sobic002G015400--Sobic001G511400 Sobic002G015400--Sobic003G266100 Sobic002G015400--Sobic002G172200 Sobic002G015400--Sobic002G172100 Sobic002G058900 Sobic002G058900 Sobic002G015400--Sobic002G058900 Sobic002G015400--Sobic009G058300 Sobic001G495700 Sobic001G495700 Sobic002G015400--Sobic001G495700 Sobic002G059500 Sobic002G059500 Sobic002G015400--Sobic002G059500 Sobic002G172200--Sobic005G082300 Sobic002G172200--Sobic002G172100 Sobic002G172200--Sobic003G266100 Sobic002G172200--Sobic001G511400 Sobic003G294800 Sobic003G294800 Sobic002G172200--Sobic003G294800 Sobic002G172200--Sobic005G147500 Sobic002G172200--Sobic002G015400 Sobic005G188800 Sobic005G188800 Sobic002G172200--Sobic005G188800 Sobic002G172200--Sobic001G284700 Sobic008G159300--Sobic002G015400 Sobic008G159300--Sobic002G058900 Sobic008G159300--Sobic001G511400 Sobic008G159300--Sobic003G266100 Sobic007G037200 Sobic007G037200 Sobic008G159300--Sobic007G037200 Sobic005G032500 Sobic005G032500 Sobic008G159300--Sobic005G032500 Sobic008G159300--Sobic002G172200 Sobic008G159300--Sobic002G172100 Sobic004G220900 Sobic004G220900 Sobic008G159300--Sobic004G220900 Sobic002G172100--Sobic003G294800 Sobic006G264800 Sobic006G264800 Sobic002G172100--Sobic006G264800 Sobic002G172100--Sobic002G172200 Sobic002G172100--Sobic005G147500 Sobic002G172100--Sobic005G082300 Sobic002G172100--Sobic003G266100 Sobic002G172100--Sobic009G058300 Sobic002G172100--Sobic001G284700 Sobic001G274025 Sobic001G274025 Sobic002G172100--Sobic001G274025 Sobic003G266100--Sobic002G172200 Sobic003G266100--Sobic004G220900 Sobic003G266100--Sobic002G172100 Sobic003G266100--Sobic003G294800 Sobic003G266100--Sobic008G159300 Sobic006G004100 Sobic006G004100 Sobic003G266100--Sobic006G004100 Sobic003G266100--Sobic005G082300 Sobic003G266100--Sobic002G059500 Sobic003G266100--Sobic001G511400 Sobic009G057100 Sobic009G057100 Sobic005G147500--Sobic009G057100 Sobic005G147500--Sobic005G188800 Sobic005G147500--Sobic001G284700 Sobic006G081400 Sobic006G081400 Sobic005G147500--Sobic006G081400 Sobic005G147500--Sobic002G172100 Sobic005G147500--Sobic003G294800 Sobic005G147500--Sobic009G058300 Sobic005G147500--Sobic002G172200 Sobic005G147500--Sobic005G082300 Sobic001G284700--Sobic005G147500 Sobic001G284700--Sobic009G058300 Sobic001G284700--Sobic002G172100 Sobic001G284700--Sobic006G264800 Sobic001G284700--Sobic009G057100 Sobic001G284700--Sobic001G511400 Sobic001G284700--Sobic003G294800 Sobic009G112200 Sobic009G112200 Sobic001G284700--Sobic009G112200 Sobic001G284700--Sobic005G188800 Sobic002G108300 Sobic002G108300 Sobic009G058300--Sobic002G108300 Sobic009G058300--Sobic001G284700 Sobic009G058300--Sobic002G172100 Sobic009G058300--Sobic005G147500 Sobic007G032500 Sobic007G032500 Sobic009G058300--Sobic007G032500 Sobic009G058300--Sobic006G264800 Sobic008G088900 Sobic008G088900 Sobic009G058300--Sobic008G088900 Sobic009G058300--Sobic001G511400 Sobic009G058300--Sobic002G015400 Sobic005G082300--Sobic002G172200 Sobic005G082300--Sobic003G294800 Sobic005G082300--Sobic002G172100 Sobic005G082300--Sobic005G188800 Sobic005G082300--Sobic003G266100 Sobic005G082300--Sobic005G147500 Sobic005G082300--Sobic001G511400 Sobic005G082300--Sobic009G057100 Sobic005G082300--Sobic006G081400
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.