Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G284700.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt C5WQP3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley HORVU3Hr1G097200.5
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G147500 - -
2 Sobic.009G058300 expressed protein -
3 Sobic.002G172100 receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed -
4 Sobic.006G264800 GASR6 - Gibberellin-regulated GASA/GAST/Snakin family protein precursor, expressed -
5 Sobic.009G057100 - -
6 Sobic.001G511400 BES1/BZR1 homolog protein, putative, expressed -
7 Sobic.003G294800 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
8 Sobic.009G112200 OsFBX361 - F-box domain containing protein, expressed -
9 Sobic.005G188800 - -
10 Sobic.002G172200 receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed -
11 Sobic.005G082300 - -
12 Sobic.006G081400 - -
13 Sobic.001G274025 - -
14 Sobic.002G108300 expressed protein -
15 Sobic.005G033400 heavy-metal-associated domain-containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.002G015400 OsFBD13 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
17 Sobic.002G015500 OsFBD13 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
18 Sobic.008G109600 oxidoreductase, 2OG-Fe oxygenase family protein, putative, expressed -
19 Sobic.001G489075 - -
20 Sobic.003G266100 ESP4, putative, expressed K06100: symplekin


Gene co-expression network
sample Sobic001G284700 Sobic001G284700 Sobic005G147500 Sobic005G147500 Sobic001G284700--Sobic005G147500 Sobic009G058300 Sobic009G058300 Sobic001G284700--Sobic009G058300 Sobic002G172100 Sobic002G172100 Sobic001G284700--Sobic002G172100 Sobic006G264800 Sobic006G264800 Sobic001G284700--Sobic006G264800 Sobic009G057100 Sobic009G057100 Sobic001G284700--Sobic009G057100 Sobic001G511400 Sobic001G511400 Sobic001G284700--Sobic001G511400 Sobic003G294800 Sobic003G294800 Sobic001G284700--Sobic003G294800 Sobic009G112200 Sobic009G112200 Sobic001G284700--Sobic009G112200 Sobic005G188800 Sobic005G188800 Sobic001G284700--Sobic005G188800 Sobic005G147500--Sobic009G057100 Sobic005G147500--Sobic005G188800 Sobic005G147500--Sobic001G284700 Sobic006G081400 Sobic006G081400 Sobic005G147500--Sobic006G081400 Sobic005G147500--Sobic002G172100 Sobic005G147500--Sobic003G294800 Sobic005G147500--Sobic009G058300 Sobic002G172200 Sobic002G172200 Sobic005G147500--Sobic002G172200 Sobic005G082300 Sobic005G082300 Sobic005G147500--Sobic005G082300 Sobic002G108300 Sobic002G108300 Sobic009G058300--Sobic002G108300 Sobic009G058300--Sobic001G284700 Sobic009G058300--Sobic002G172100 Sobic009G058300--Sobic005G147500 Sobic007G032500 Sobic007G032500 Sobic009G058300--Sobic007G032500 Sobic009G058300--Sobic006G264800 Sobic008G088900 Sobic008G088900 Sobic009G058300--Sobic008G088900 Sobic009G058300--Sobic001G511400 Sobic002G015400 Sobic002G015400 Sobic009G058300--Sobic002G015400 Sobic002G172100--Sobic003G294800 Sobic002G172100--Sobic006G264800 Sobic002G172100--Sobic002G172200 Sobic002G172100--Sobic005G147500 Sobic002G172100--Sobic005G082300 Sobic003G266100 Sobic003G266100 Sobic002G172100--Sobic003G266100 Sobic002G172100--Sobic009G058300 Sobic002G172100--Sobic001G284700 Sobic001G274025 Sobic001G274025 Sobic002G172100--Sobic001G274025 Sobic006G264800--Sobic001G274025 Sobic006G264800--Sobic002G172100 Sobic009G021400 Sobic009G021400 Sobic006G264800--Sobic009G021400 Sobic001G489075 Sobic001G489075 Sobic006G264800--Sobic001G489075 Sobic006G264800--Sobic003G294800 Sobic006G264800--Sobic009G112200 Sobic003G106400 Sobic003G106400 Sobic006G264800--Sobic003G106400 Sobic006G264800--Sobic009G058300 Sobic006G264800--Sobic001G284700 Sobic009G057100--Sobic005G147500 Sobic009G057100--Sobic006G081400 Sobic004G071100 Sobic004G071100 Sobic009G057100--Sobic004G071100 Sobic009G057100--Sobic005G188800 Sobic005G033400 Sobic005G033400 Sobic009G057100--Sobic005G033400 Sobic009G057100--Sobic001G284700 Sobic002G015500 Sobic002G015500 Sobic009G057100--Sobic002G015500 Sobic004G029800 Sobic004G029800 Sobic009G057100--Sobic004G029800 Sobic009G057100--Sobic003G294800 Sobic001G511400--Sobic002G015400 Sobic001G511400--Sobic002G172200 Sobic008G159300 Sobic008G159300 Sobic001G511400--Sobic008G159300 Sobic001G511400--Sobic002G172100 Sobic001G511400--Sobic003G266100 Sobic001G511400--Sobic005G147500 Sobic001G511400--Sobic001G284700 Sobic001G511400--Sobic009G058300 Sobic001G511400--Sobic005G082300 Sobic003G294800--Sobic005G188800 Sobic003G294800--Sobic002G172100 Sobic003G294800--Sobic005G082300 Sobic003G294800--Sobic005G147500 Sobic003G294800--Sobic006G264800 Sobic003G294800--Sobic003G266100 Sobic003G294800--Sobic002G172200 Sobic003G294800--Sobic001G274025 Sobic008G109600 Sobic008G109600 Sobic003G294800--Sobic008G109600 Sobic009G112200--Sobic006G264800 Sobic009G112200--Sobic001G274025 Sobic009G112200--Sobic003G294800 Sobic009G112200--Sobic002G172100 Sobic009G112200--Sobic001G284700 Sobic009G112200--Sobic005G188800 Sobic009G112200--Sobic005G147500 Sobic009G112200--Sobic009G021400 Sobic009G112200--Sobic005G082300 Sobic005G188800--Sobic003G294800 Sobic005G188800--Sobic006G081400 Sobic005G188800--Sobic005G147500 Sobic005G188800--Sobic004G029800 Sobic005G188800--Sobic009G057100 Sobic005G188800--Sobic005G082300 Sobic005G188800--Sobic002G172100 Sobic005G188800--Sobic008G109600 Sobic005G188800--Sobic005G033400
Octagon: transcription factors


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