Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G188800.1
Synonym Sb05g024600
Functional annotation -
UniProt C5Y6F8 , P14690 , P14692
Pfam PF01559
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a029779 , Zm00025a029314 , Zm00025a029316 , Zm00025a029317 , Zm00025a029313 , Zm00025a029318
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.005G188800


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G294800 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
2 Sobic.006G081400 - -
3 Sobic.005G147500 - -
4 Sobic.004G029800 expressed protein -
5 Sobic.009G057100 - -
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12 Sobic.001G284700 - -
13 Sobic.009G112200 OsFBX361 - F-box domain containing protein, expressed -
14 Sobic.001G274025 - -
15 Sobic.003G266100 ESP4, putative, expressed K06100: symplekin
16 Sobic.005G185400 - -
17 Sobic.004G071100 - -
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19 Sobic.010G031400 early nodulin 93 ENOD93 protein, putative, expressed -
20 Sobic.009G021400 Jacalin-like lectin domain containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G188800 Sobic005G188800 Sobic003G294800 Sobic003G294800 Sobic005G188800--Sobic003G294800 Sobic006G081400 Sobic006G081400 Sobic005G188800--Sobic006G081400 Sobic005G147500 Sobic005G147500 Sobic005G188800--Sobic005G147500 Sobic004G029800 Sobic004G029800 Sobic005G188800--Sobic004G029800 Sobic009G057100 Sobic009G057100 Sobic005G188800--Sobic009G057100 Sobic005G082300 Sobic005G082300 Sobic005G188800--Sobic005G082300 Sobic002G172100 Sobic002G172100 Sobic005G188800--Sobic002G172100 Sobic008G109600 Sobic008G109600 Sobic005G188800--Sobic008G109600 Sobic005G033400 Sobic005G033400 Sobic005G188800--Sobic005G033400 Sobic003G294800--Sobic005G188800 Sobic003G294800--Sobic002G172100 Sobic003G294800--Sobic005G082300 Sobic003G294800--Sobic005G147500 Sobic006G264800 Sobic006G264800 Sobic003G294800--Sobic006G264800 Sobic003G266100 Sobic003G266100 Sobic003G294800--Sobic003G266100 Sobic002G172200 Sobic002G172200 Sobic003G294800--Sobic002G172200 Sobic001G274025 Sobic001G274025 Sobic003G294800--Sobic001G274025 Sobic003G294800--Sobic008G109600 Sobic006G081400--Sobic005G188800 Sobic006G081400--Sobic009G057100 Sobic006G081400--Sobic005G147500 Sobic006G081400--Sobic004G029800 Sobic006G081400--Sobic005G033400 Sobic005G185400 Sobic005G185400 Sobic006G081400--Sobic005G185400 Sobic004G071100 Sobic004G071100 Sobic006G081400--Sobic004G071100 Sobic006G081400--Sobic003G294800 Sobic005G184500 Sobic005G184500 Sobic006G081400--Sobic005G184500 Sobic005G147500--Sobic009G057100 Sobic005G147500--Sobic005G188800 Sobic001G284700 Sobic001G284700 Sobic005G147500--Sobic001G284700 Sobic005G147500--Sobic006G081400 Sobic005G147500--Sobic002G172100 Sobic005G147500--Sobic003G294800 Sobic009G058300 Sobic009G058300 Sobic005G147500--Sobic009G058300 Sobic005G147500--Sobic002G172200 Sobic005G147500--Sobic005G082300 Sobic004G029800--Sobic006G081400 Sobic004G029800--Sobic005G188800 Sobic004G029800--Sobic005G185400 Sobic004G029800--Sobic005G147500 Sobic004G029800--Sobic009G057100 Sobic004G029800--Sobic005G033400 Sobic004G029800--Sobic003G294800 Sobic004G029800--Sobic005G184500 Sobic004G029800--Sobic004G071100 Sobic009G057100--Sobic005G147500 Sobic009G057100--Sobic006G081400 Sobic009G057100--Sobic004G071100 Sobic009G057100--Sobic005G188800 Sobic009G057100--Sobic005G033400 Sobic009G057100--Sobic001G284700 Sobic002G015500 Sobic002G015500 Sobic009G057100--Sobic002G015500 Sobic009G057100--Sobic004G029800 Sobic009G057100--Sobic003G294800 Sobic005G082300--Sobic002G172200 Sobic005G082300--Sobic003G294800 Sobic005G082300--Sobic002G172100 Sobic005G082300--Sobic005G188800 Sobic005G082300--Sobic003G266100 Sobic005G082300--Sobic005G147500 Sobic001G511400 Sobic001G511400 Sobic005G082300--Sobic001G511400 Sobic005G082300--Sobic009G057100 Sobic005G082300--Sobic006G081400 Sobic002G172100--Sobic003G294800 Sobic002G172100--Sobic006G264800 Sobic002G172100--Sobic002G172200 Sobic002G172100--Sobic005G147500 Sobic002G172100--Sobic005G082300 Sobic002G172100--Sobic003G266100 Sobic002G172100--Sobic009G058300 Sobic002G172100--Sobic001G284700 Sobic002G172100--Sobic001G274025 Sobic008G109600--Sobic003G294800 Sobic008G109600--Sobic005G188800 Sobic008G109600--Sobic002G172100 Sobic008G109600--Sobic003G266100 Sobic008G109600--Sobic006G264800 Sobic008G109600--Sobic002G172200 Sobic008G109600--Sobic001G274025 Sobic008G109600--Sobic005G082300 Sobic009G021400 Sobic009G021400 Sobic008G109600--Sobic009G021400 Sobic005G033400--Sobic006G081400 Sobic005G033400--Sobic009G057100 Sobic005G033400--Sobic004G071100 Sobic005G033400--Sobic005G185400 Sobic005G033400--Sobic005G188800 Sobic005G033400--Sobic005G147500 Sobic005G033400--Sobic004G029800 Sobic005G033400--Sobic005G184500 Sobic010G031400 Sobic010G031400 Sobic005G033400--Sobic010G031400
Octagon: transcription factors


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