Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G071100.2,Sobic.004G071100.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YN88
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G057100 - -
2 Sobic.005G033400 heavy-metal-associated domain-containing protein, putative, expressed -
3 Sobic.006G081400 - -
4 Sobic.005G185400 - -
5 Sobic.005G147500 - -
6 Sobic.002G097100 OsFBLD6 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
7 Sobic.003G319050 - -
8 Sobic.002G015500 OsFBD13 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
9 Sobic.001G297700 expressed protein -
10 Sobic.005G184500 - -
11 Sobic.005G188800 - -
12 Sobic.004G029800 expressed protein -
13 Sobic.010G031400 early nodulin 93 ENOD93 protein, putative, expressed -
14 Sobic.006G105300 expressed protein -
15 Sobic.002G300900 - -
16 Sobic.001G511400 BES1/BZR1 homolog protein, putative, expressed -
17 Sobic.001G284700 - -
18 Sobic.002G007300 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K14962: WDR82, SWD2, COMPASS component SWD2
19 Sobic.002G172200 receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed -
20 Sobic.010G035000 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G071100 Sobic004G071100 Sobic009G057100 Sobic009G057100 Sobic004G071100--Sobic009G057100 Sobic005G033400 Sobic005G033400 Sobic004G071100--Sobic005G033400 Sobic006G081400 Sobic006G081400 Sobic004G071100--Sobic006G081400 Sobic005G185400 Sobic005G185400 Sobic004G071100--Sobic005G185400 Sobic005G147500 Sobic005G147500 Sobic004G071100--Sobic005G147500 Sobic002G097100 Sobic002G097100 Sobic004G071100--Sobic002G097100 Sobic003G319050 Sobic003G319050 Sobic004G071100--Sobic003G319050 Sobic002G015500 Sobic002G015500 Sobic004G071100--Sobic002G015500 Sobic001G297700 Sobic001G297700 Sobic004G071100--Sobic001G297700 Sobic009G057100--Sobic005G147500 Sobic009G057100--Sobic006G081400 Sobic009G057100--Sobic004G071100 Sobic005G188800 Sobic005G188800 Sobic009G057100--Sobic005G188800 Sobic009G057100--Sobic005G033400 Sobic001G284700 Sobic001G284700 Sobic009G057100--Sobic001G284700 Sobic009G057100--Sobic002G015500 Sobic004G029800 Sobic004G029800 Sobic009G057100--Sobic004G029800 Sobic003G294800 Sobic003G294800 Sobic009G057100--Sobic003G294800 Sobic005G033400--Sobic006G081400 Sobic005G033400--Sobic009G057100 Sobic005G033400--Sobic004G071100 Sobic005G033400--Sobic005G185400 Sobic005G033400--Sobic005G188800 Sobic005G033400--Sobic005G147500 Sobic005G033400--Sobic004G029800 Sobic005G184500 Sobic005G184500 Sobic005G033400--Sobic005G184500 Sobic010G031400 Sobic010G031400 Sobic005G033400--Sobic010G031400 Sobic006G081400--Sobic005G188800 Sobic006G081400--Sobic009G057100 Sobic006G081400--Sobic005G147500 Sobic006G081400--Sobic004G029800 Sobic006G081400--Sobic005G033400 Sobic006G081400--Sobic005G185400 Sobic006G081400--Sobic004G071100 Sobic006G081400--Sobic003G294800 Sobic006G081400--Sobic005G184500 Sobic005G185400--Sobic005G184500 Sobic006G105300 Sobic006G105300 Sobic005G185400--Sobic006G105300 Sobic005G185400--Sobic006G081400 Sobic005G185400--Sobic001G297700 Sobic005G184600 Sobic005G184600 Sobic005G185400--Sobic005G184600 Sobic005G185400--Sobic005G033400 Sobic005G184400 Sobic005G184400 Sobic005G185400--Sobic005G184400 Sobic005G185400--Sobic010G031400 Sobic010G035000 Sobic010G035000 Sobic005G185400--Sobic010G035000 Sobic005G147500--Sobic009G057100 Sobic005G147500--Sobic005G188800 Sobic005G147500--Sobic001G284700 Sobic005G147500--Sobic006G081400 Sobic002G172100 Sobic002G172100 Sobic005G147500--Sobic002G172100 Sobic005G147500--Sobic003G294800 Sobic009G058300 Sobic009G058300 Sobic005G147500--Sobic009G058300 Sobic002G172200 Sobic002G172200 Sobic005G147500--Sobic002G172200 Sobic005G082300 Sobic005G082300 Sobic005G147500--Sobic005G082300 Sobic002G097100--Sobic002G015500 Sobic002G097100--Sobic003G319050 Sobic001G495700 Sobic001G495700 Sobic002G097100--Sobic001G495700 Sobic010G133150 Sobic010G133150 Sobic002G097100--Sobic010G133150 Sobic002G097100--Sobic009G057100 Sobic007G199500 Sobic007G199500 Sobic002G097100--Sobic007G199500 Sobic002G097100--Sobic004G071100 Sobic002G007300 Sobic002G007300 Sobic002G097100--Sobic002G007300 Sobic002G097100--Sobic005G147500 Sobic003G319050--Sobic002G097100 Sobic003G319050--Sobic002G007300 Sobic003G319050--Sobic001G297700 Sobic003G319050--Sobic007G199500 Sobic003G319050--Sobic004G071100 Sobic003G319050--Sobic006G105300 Sobic008G184500 Sobic008G184500 Sobic003G319050--Sobic008G184500 Sobic003G319050--Sobic002G015500 Sobic004G029700 Sobic004G029700 Sobic003G319050--Sobic004G029700 Sobic002G015500--Sobic002G097100 Sobic002G015500--Sobic001G495700 Sobic002G015500--Sobic010G133150 Sobic002G015500--Sobic009G057100 Sobic007G032500 Sobic007G032500 Sobic002G015500--Sobic007G032500 Sobic002G015500--Sobic004G071100 Sobic001G511400 Sobic001G511400 Sobic002G015500--Sobic001G511400 Sobic002G015500--Sobic005G147500 Sobic002G015500--Sobic009G058300 Sobic001G297700--Sobic010G035000 Sobic001G297700--Sobic006G105300 Sobic007G025100 Sobic007G025100 Sobic001G297700--Sobic007G025100 Sobic002G300900 Sobic002G300900 Sobic001G297700--Sobic002G300900 Sobic001G297700--Sobic005G184500 Sobic001G297700--Sobic005G185400 Sobic007G131100 Sobic007G131100 Sobic001G297700--Sobic007G131100 Sobic001G297700--Sobic003G319050 Sobic001G297700--Sobic005G184400
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.