Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G297700.2
Synonym Sb01g029040
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5S8S8
Pfam -
Panther DB PTHR33527 PTHR33527:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g10320.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.001G297700


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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15 Sobic.007G049000 OsFBX382 - F-box domain containing protein, expressed -
16 Sobic.005G033400 heavy-metal-associated domain-containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.006G081400 - -
18 Sobic.007G199500 MBTB30 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
19 Sobic.009G057100 - -
20 Sobic.002G097100 OsFBLD6 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G297700 Sobic001G297700 Sobic010G035000 Sobic010G035000 Sobic001G297700--Sobic010G035000 Sobic006G105300 Sobic006G105300 Sobic001G297700--Sobic006G105300 Sobic007G025100 Sobic007G025100 Sobic001G297700--Sobic007G025100 Sobic002G300900 Sobic002G300900 Sobic001G297700--Sobic002G300900 Sobic005G184500 Sobic005G184500 Sobic001G297700--Sobic005G184500 Sobic005G185400 Sobic005G185400 Sobic001G297700--Sobic005G185400 Sobic007G131100 Sobic007G131100 Sobic001G297700--Sobic007G131100 Sobic003G319050 Sobic003G319050 Sobic001G297700--Sobic003G319050 Sobic005G184400 Sobic005G184400 Sobic001G297700--Sobic005G184400 Sobic010G035000--Sobic006G105300 Sobic010G035000--Sobic001G297700 Sobic010G035000--Sobic005G184400 Sobic010G035000--Sobic007G131100 Sobic005G184600 Sobic005G184600 Sobic010G035000--Sobic005G184600 Sobic010G035000--Sobic005G184500 Sobic007G049000 Sobic007G049000 Sobic010G035000--Sobic007G049000 Sobic006G142850 Sobic006G142850 Sobic010G035000--Sobic006G142850 Sobic010G035000--Sobic005G185400 Sobic006G105300--Sobic010G035000 Sobic006G105300--Sobic005G184400 Sobic006G105300--Sobic005G184600 Sobic006G105300--Sobic005G184500 Sobic006G105300--Sobic007G049000 Sobic006G105300--Sobic006G142850 Sobic006G105300--Sobic001G297700 Sobic006G105300--Sobic005G185400 Sobic009G007100 Sobic009G007100 Sobic006G105300--Sobic009G007100 Sobic007G025100--Sobic002G300900 Sobic007G025100--Sobic007G131100 Sobic007G025100--Sobic001G297700 Sobic006G040101 Sobic006G040101 Sobic007G025100--Sobic006G040101 Sobic007G025100--Sobic010G035000 Sobic002G059500 Sobic002G059500 Sobic007G025100--Sobic002G059500 Sobic005G035500 Sobic005G035500 Sobic007G025100--Sobic005G035500 Sobic007G025100--Sobic006G105300 Sobic008G082300 Sobic008G082300 Sobic007G025100--Sobic008G082300 Sobic002G300900--Sobic007G025100 Sobic002G300900--Sobic006G040101 Sobic002G300900--Sobic002G059500 Sobic002G300900--Sobic001G297700 Sobic002G300900--Sobic007G131100 Sobic001G511400 Sobic001G511400 Sobic002G300900--Sobic001G511400 Sobic002G300900--Sobic010G035000 Sobic002G172200 Sobic002G172200 Sobic002G300900--Sobic002G172200 Sobic003G266100 Sobic003G266100 Sobic002G300900--Sobic003G266100 Sobic005G184500--Sobic005G185400 Sobic005G184500--Sobic006G105300 Sobic005G184500--Sobic005G184600 Sobic005G184500--Sobic005G184400 Sobic005G184500--Sobic007G049000 Sobic005G184500--Sobic010G035000 Sobic005G184500--Sobic001G297700 Sobic005G184500--Sobic006G142850 Sobic010G031400 Sobic010G031400 Sobic005G184500--Sobic010G031400 Sobic005G185400--Sobic005G184500 Sobic005G185400--Sobic006G105300 Sobic006G081400 Sobic006G081400 Sobic005G185400--Sobic006G081400 Sobic005G185400--Sobic001G297700 Sobic005G185400--Sobic005G184600 Sobic005G033400 Sobic005G033400 Sobic005G185400--Sobic005G033400 Sobic005G185400--Sobic005G184400 Sobic005G185400--Sobic010G031400 Sobic005G185400--Sobic010G035000 Sobic007G131100--Sobic007G025100 Sobic007G131100--Sobic010G035000 Sobic007G131100--Sobic001G297700 Sobic007G131100--Sobic008G082300 Sobic002G358000 Sobic002G358000 Sobic007G131100--Sobic002G358000 Sobic007G131100--Sobic002G300900 Sobic007G131100--Sobic006G105300 Sobic008G184000 Sobic008G184000 Sobic007G131100--Sobic008G184000 Sobic007G131100--Sobic005G184400 Sobic002G097100 Sobic002G097100 Sobic003G319050--Sobic002G097100 Sobic002G007300 Sobic002G007300 Sobic003G319050--Sobic002G007300 Sobic003G319050--Sobic001G297700 Sobic007G199500 Sobic007G199500 Sobic003G319050--Sobic007G199500 Sobic004G071100 Sobic004G071100 Sobic003G319050--Sobic004G071100 Sobic003G319050--Sobic006G105300 Sobic008G184500 Sobic008G184500 Sobic003G319050--Sobic008G184500 Sobic002G015500 Sobic002G015500 Sobic003G319050--Sobic002G015500 Sobic004G029700 Sobic004G029700 Sobic003G319050--Sobic004G029700 Sobic005G184400--Sobic005G184600 Sobic005G184400--Sobic007G049000 Sobic005G184400--Sobic006G142850 Sobic005G184400--Sobic006G105300 Sobic005G184400--Sobic005G184500 Sobic005G184400--Sobic010G035000 Sobic005G186250 Sobic005G186250 Sobic005G184400--Sobic005G186250 Sobic005G184400--Sobic009G007100 Sobic005G184400--Sobic005G185400
Octagon: transcription factors


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