Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G199500.1
Synonym BPM1, ATBPM1
Functional annotation MBTB30 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed
UniProt Q95944 , A0A1B6PIR3
Pfam PF00651
Panther DB PTHR24413 PTHR24413:SF136
NCBI CDD -
KEGG Orthology K10523; speckle-type POZ protein
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G19000 : BTB-POZ and MATH domain 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g41150.1 : MBTB30 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.007G199500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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18 Sobic.005G185400 - -
19 Sobic.008G184000 aspartic proteinase, putative, expressed -
20 Sobic.005G033400 heavy-metal-associated domain-containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G199500 Sobic007G199500 Sobic002G097100 Sobic002G097100 Sobic007G199500--Sobic002G097100 Sobic003G319050 Sobic003G319050 Sobic007G199500--Sobic003G319050 Sobic001G297700 Sobic001G297700 Sobic007G199500--Sobic001G297700 Sobic002G015500 Sobic002G015500 Sobic007G199500--Sobic002G015500 Sobic002G300900 Sobic002G300900 Sobic007G199500--Sobic002G300900 Sobic001G495700 Sobic001G495700 Sobic007G199500--Sobic001G495700 Sobic004G071100 Sobic004G071100 Sobic007G199500--Sobic004G071100 Sobic009G057100 Sobic009G057100 Sobic007G199500--Sobic009G057100 Sobic002G007300 Sobic002G007300 Sobic007G199500--Sobic002G007300 Sobic002G097100--Sobic002G015500 Sobic002G097100--Sobic003G319050 Sobic002G097100--Sobic001G495700 Sobic010G133150 Sobic010G133150 Sobic002G097100--Sobic010G133150 Sobic002G097100--Sobic009G057100 Sobic002G097100--Sobic007G199500 Sobic002G097100--Sobic004G071100 Sobic002G097100--Sobic002G007300 Sobic005G147500 Sobic005G147500 Sobic002G097100--Sobic005G147500 Sobic003G319050--Sobic002G097100 Sobic003G319050--Sobic002G007300 Sobic003G319050--Sobic001G297700 Sobic003G319050--Sobic007G199500 Sobic003G319050--Sobic004G071100 Sobic006G105300 Sobic006G105300 Sobic003G319050--Sobic006G105300 Sobic008G184500 Sobic008G184500 Sobic003G319050--Sobic008G184500 Sobic003G319050--Sobic002G015500 Sobic004G029700 Sobic004G029700 Sobic003G319050--Sobic004G029700 Sobic010G035000 Sobic010G035000 Sobic001G297700--Sobic010G035000 Sobic001G297700--Sobic006G105300 Sobic007G025100 Sobic007G025100 Sobic001G297700--Sobic007G025100 Sobic001G297700--Sobic002G300900 Sobic005G184500 Sobic005G184500 Sobic001G297700--Sobic005G184500 Sobic005G185400 Sobic005G185400 Sobic001G297700--Sobic005G185400 Sobic007G131100 Sobic007G131100 Sobic001G297700--Sobic007G131100 Sobic001G297700--Sobic003G319050 Sobic005G184400 Sobic005G184400 Sobic001G297700--Sobic005G184400 Sobic002G015500--Sobic002G097100 Sobic002G015500--Sobic001G495700 Sobic002G015500--Sobic010G133150 Sobic002G015500--Sobic009G057100 Sobic007G032500 Sobic007G032500 Sobic002G015500--Sobic007G032500 Sobic002G015500--Sobic004G071100 Sobic001G511400 Sobic001G511400 Sobic002G015500--Sobic001G511400 Sobic002G015500--Sobic005G147500 Sobic009G058300 Sobic009G058300 Sobic002G015500--Sobic009G058300 Sobic002G300900--Sobic007G025100 Sobic006G040101 Sobic006G040101 Sobic002G300900--Sobic006G040101 Sobic002G059500 Sobic002G059500 Sobic002G300900--Sobic002G059500 Sobic002G300900--Sobic001G297700 Sobic002G300900--Sobic007G131100 Sobic002G300900--Sobic001G511400 Sobic002G300900--Sobic010G035000 Sobic002G172200 Sobic002G172200 Sobic002G300900--Sobic002G172200 Sobic003G266100 Sobic003G266100 Sobic002G300900--Sobic003G266100 Sobic001G495700--Sobic002G015500 Sobic001G495700--Sobic010G133150 Sobic001G495700--Sobic002G097100 Sobic001G495700--Sobic007G032500 Sobic005G174200 Sobic005G174200 Sobic001G495700--Sobic005G174200 Sobic001G495700--Sobic001G511400 Sobic002G015400 Sobic002G015400 Sobic001G495700--Sobic002G015400 Sobic001G495700--Sobic009G058300 Sobic001G495700--Sobic007G199500 Sobic004G071100--Sobic009G057100 Sobic005G033400 Sobic005G033400 Sobic004G071100--Sobic005G033400 Sobic006G081400 Sobic006G081400 Sobic004G071100--Sobic006G081400 Sobic004G071100--Sobic005G185400 Sobic004G071100--Sobic005G147500 Sobic004G071100--Sobic002G097100 Sobic004G071100--Sobic003G319050 Sobic004G071100--Sobic002G015500 Sobic004G071100--Sobic001G297700 Sobic009G057100--Sobic005G147500 Sobic009G057100--Sobic006G081400 Sobic009G057100--Sobic004G071100 Sobic005G188800 Sobic005G188800 Sobic009G057100--Sobic005G188800 Sobic009G057100--Sobic005G033400 Sobic001G284700 Sobic001G284700 Sobic009G057100--Sobic001G284700 Sobic009G057100--Sobic002G015500 Sobic004G029800 Sobic004G029800 Sobic009G057100--Sobic004G029800 Sobic003G294800 Sobic003G294800 Sobic009G057100--Sobic003G294800 Sobic002G007300--Sobic003G319050 Sobic002G007300--Sobic002G097100 Sobic002G007300--Sobic006G105300 Sobic002G007300--Sobic001G297700 Sobic002G007300--Sobic004G071100 Sobic002G007300--Sobic002G015500 Sobic002G007300--Sobic007G199500 Sobic002G007300--Sobic009G057100 Sobic002G007300--Sobic005G033400
Octagon: transcription factors


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