Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G184500.1
Synonym Sb05g024290
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PTC1
Pfam PF01559
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a029779 , Zm00025a029308 , Zm00025a029314 , Zm00025a029316 , Zm00025a029317 , Zm00025a029310 , Zm00025a029312 , Zm00025a029318
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.005G184500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G185400 - -
2 Sobic.006G105300 expressed protein -
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12 Sobic.004G071100 - -
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14 Sobic.003G319050 - -
15 Sobic.009G057100 - -
16 Sobic.005G186250 - -
17 Sobic.009G007100 glutelin, putative, expressed -
18 Sobic.005G188800 - -
19 Sobic.007G131100 jmjC domain containing protein, expressed K15601: [histone H3]-dimethyl-L-lysine9 demethylase
20 Sobic.002G300900 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G184500 Sobic005G184500 Sobic005G185400 Sobic005G185400 Sobic005G184500--Sobic005G185400 Sobic006G105300 Sobic006G105300 Sobic005G184500--Sobic006G105300 Sobic005G184600 Sobic005G184600 Sobic005G184500--Sobic005G184600 Sobic005G184400 Sobic005G184400 Sobic005G184500--Sobic005G184400 Sobic007G049000 Sobic007G049000 Sobic005G184500--Sobic007G049000 Sobic010G035000 Sobic010G035000 Sobic005G184500--Sobic010G035000 Sobic001G297700 Sobic001G297700 Sobic005G184500--Sobic001G297700 Sobic006G142850 Sobic006G142850 Sobic005G184500--Sobic006G142850 Sobic010G031400 Sobic010G031400 Sobic005G184500--Sobic010G031400 Sobic005G185400--Sobic005G184500 Sobic005G185400--Sobic006G105300 Sobic006G081400 Sobic006G081400 Sobic005G185400--Sobic006G081400 Sobic005G185400--Sobic001G297700 Sobic005G185400--Sobic005G184600 Sobic005G033400 Sobic005G033400 Sobic005G185400--Sobic005G033400 Sobic005G185400--Sobic005G184400 Sobic005G185400--Sobic010G031400 Sobic005G185400--Sobic010G035000 Sobic006G105300--Sobic010G035000 Sobic006G105300--Sobic005G184400 Sobic006G105300--Sobic005G184600 Sobic006G105300--Sobic005G184500 Sobic006G105300--Sobic007G049000 Sobic006G105300--Sobic006G142850 Sobic006G105300--Sobic001G297700 Sobic006G105300--Sobic005G185400 Sobic009G007100 Sobic009G007100 Sobic006G105300--Sobic009G007100 Sobic005G184600--Sobic005G184400 Sobic005G184600--Sobic007G049000 Sobic005G184600--Sobic006G142850 Sobic005G184600--Sobic006G105300 Sobic005G184600--Sobic005G184500 Sobic005G186250 Sobic005G186250 Sobic005G184600--Sobic005G186250 Sobic005G184600--Sobic010G035000 Sobic005G184600--Sobic009G007100 Sobic005G184600--Sobic005G185400 Sobic005G184400--Sobic005G184600 Sobic005G184400--Sobic007G049000 Sobic005G184400--Sobic006G142850 Sobic005G184400--Sobic006G105300 Sobic005G184400--Sobic005G184500 Sobic005G184400--Sobic010G035000 Sobic005G184400--Sobic005G186250 Sobic005G184400--Sobic009G007100 Sobic005G184400--Sobic005G185400 Sobic007G049000--Sobic005G184600 Sobic007G049000--Sobic005G184400 Sobic007G049000--Sobic006G142850 Sobic007G049000--Sobic005G186250 Sobic007G049000--Sobic006G105300 Sobic007G049000--Sobic009G007100 Sobic007G049000--Sobic005G184500 Sobic007G049000--Sobic010G035000 Sobic007G049000--Sobic005G185400 Sobic010G035000--Sobic006G105300 Sobic010G035000--Sobic001G297700 Sobic010G035000--Sobic005G184400 Sobic007G131100 Sobic007G131100 Sobic010G035000--Sobic007G131100 Sobic010G035000--Sobic005G184600 Sobic010G035000--Sobic005G184500 Sobic010G035000--Sobic007G049000 Sobic010G035000--Sobic006G142850 Sobic010G035000--Sobic005G185400 Sobic001G297700--Sobic010G035000 Sobic001G297700--Sobic006G105300 Sobic007G025100 Sobic007G025100 Sobic001G297700--Sobic007G025100 Sobic002G300900 Sobic002G300900 Sobic001G297700--Sobic002G300900 Sobic001G297700--Sobic005G184500 Sobic001G297700--Sobic005G185400 Sobic001G297700--Sobic007G131100 Sobic003G319050 Sobic003G319050 Sobic001G297700--Sobic003G319050 Sobic001G297700--Sobic005G184400 Sobic006G142850--Sobic007G049000 Sobic006G142850--Sobic005G184600 Sobic006G142850--Sobic005G184400 Sobic006G142850--Sobic005G186250 Sobic006G142850--Sobic006G105300 Sobic006G142850--Sobic009G007100 Sobic006G142850--Sobic010G035000 Sobic004G207500 Sobic004G207500 Sobic006G142850--Sobic004G207500 Sobic006G142850--Sobic005G184500 Sobic010G031400--Sobic005G185400 Sobic010G031400--Sobic005G184500 Sobic010G031400--Sobic001G297700 Sobic009G057100 Sobic009G057100 Sobic010G031400--Sobic009G057100 Sobic010G031400--Sobic006G081400 Sobic010G031400--Sobic005G033400 Sobic010G031400--Sobic006G105300 Sobic004G071100 Sobic004G071100 Sobic010G031400--Sobic004G071100 Sobic010G031400--Sobic010G035000
Octagon: transcription factors


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