Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G489075.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5SB46
Pfam -
Panther DB PTHR32212 PTHR32212:SF140
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g36000.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G174000 - -
2 Sobic.008G088900 hypothetical protein -
3 Sobic.005G146966 - -
4 Sobic.004G171600 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
5 Sobic.002G409300 expressed protein -
6 Sobic.006G264800 GASR6 - Gibberellin-regulated GASA/GAST/Snakin family protein precursor, expressed -
7 Sobic.002G108300 expressed protein -
8 Sobic.002G293100 ZOS9-17 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
9 Sobic.001G200900 LTPL160 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
10 Sobic.009G061900 BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1-associated receptor kinase 1 precursor, putative, expressed -
11 Sobic.005G077900 OsFBX411 - F-box domain containing protein, expressed -
12 Sobic.009G021400 Jacalin-like lectin domain containing protein, putative, expressed -
13 Sobic.001G274025 - -
14 Sobic.003G106400 3-beta-hydroxysteroid-Delta-isomerase, putative, expressed K01824: cholestenol Delta-isomerase
15 Sobic.005G186300 - -
16 Sobic.008G031400 OsSub63 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
17 Sobic.002G172100 receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed -
18 Sobic.009G058300 expressed protein -
19 Sobic.007G187100 terpene synthase, putative, expressed -
20 Sobic.003G091500 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic001G489075 Sobic001G489075 Sobic005G174000 Sobic005G174000 Sobic001G489075--Sobic005G174000 Sobic008G088900 Sobic008G088900 Sobic001G489075--Sobic008G088900 Sobic005G146966 Sobic005G146966 Sobic001G489075--Sobic005G146966 Sobic004G171600 Sobic004G171600 Sobic001G489075--Sobic004G171600 Sobic002G409300 Sobic002G409300 Sobic001G489075--Sobic002G409300 Sobic006G264800 Sobic006G264800 Sobic001G489075--Sobic006G264800 Sobic002G108300 Sobic002G108300 Sobic001G489075--Sobic002G108300 Sobic002G293100 Sobic002G293100 Sobic001G489075--Sobic002G293100 Sobic001G200900 Sobic001G200900 Sobic001G489075--Sobic001G200900 Sobic005G174000--Sobic001G200900 Sobic005G174000--Sobic004G171600 Sobic005G077900 Sobic005G077900 Sobic005G174000--Sobic005G077900 Sobic005G174000--Sobic001G489075 Sobic001G233600 Sobic001G233600 Sobic005G174000--Sobic001G233600 Sobic005G174000--Sobic002G293100 Sobic005G174000--Sobic008G088900 Sobic009G061900 Sobic009G061900 Sobic005G174000--Sobic009G061900 Sobic005G174000--Sobic005G146966 Sobic008G088900--Sobic002G108300 Sobic003G091500 Sobic003G091500 Sobic008G088900--Sobic003G091500 Sobic008G184100 Sobic008G184100 Sobic008G088900--Sobic008G184100 Sobic008G088900--Sobic004G171600 Sobic008G088900--Sobic001G489075 Sobic008G088900--Sobic005G174000 Sobic008G088900--Sobic005G077900 Sobic002G007700 Sobic002G007700 Sobic008G088900--Sobic002G007700 Sobic008G088900--Sobic005G146966 Sobic005G146966--Sobic001G489075 Sobic005G146966--Sobic005G174000 Sobic005G146966--Sobic004G171600 Sobic005G146966--Sobic008G088900 Sobic005G146966--Sobic001G200900 Sobic005G146966--Sobic005G077900 Sobic005G146966--Sobic002G108300 Sobic005G146966--Sobic002G293100 Sobic005G146966--Sobic009G061900 Sobic004G171600--Sobic005G077900 Sobic004G171600--Sobic005G174000 Sobic004G171600--Sobic001G200900 Sobic004G171600--Sobic002G293100 Sobic004G171600--Sobic002G007700 Sobic004G171600--Sobic001G233600 Sobic005G021100 Sobic005G021100 Sobic004G171600--Sobic005G021100 Sobic004G171600--Sobic008G088900 Sobic002G089500 Sobic002G089500 Sobic004G171600--Sobic002G089500 Sobic009G021400 Sobic009G021400 Sobic002G409300--Sobic009G021400 Sobic002G409300--Sobic009G061900 Sobic005G186300 Sobic005G186300 Sobic002G409300--Sobic005G186300 Sobic003G106400 Sobic003G106400 Sobic002G409300--Sobic003G106400 Sobic001G274025 Sobic001G274025 Sobic002G409300--Sobic001G274025 Sobic007G187100 Sobic007G187100 Sobic002G409300--Sobic007G187100 Sobic002G409300--Sobic001G489075 Sobic002G409300--Sobic001G200900 Sobic007G205400 Sobic007G205400 Sobic002G409300--Sobic007G205400 Sobic006G264800--Sobic001G274025 Sobic002G172100 Sobic002G172100 Sobic006G264800--Sobic002G172100 Sobic006G264800--Sobic009G021400 Sobic006G264800--Sobic001G489075 Sobic003G294800 Sobic003G294800 Sobic006G264800--Sobic003G294800 Sobic009G112200 Sobic009G112200 Sobic006G264800--Sobic009G112200 Sobic006G264800--Sobic003G106400 Sobic009G058300 Sobic009G058300 Sobic006G264800--Sobic009G058300 Sobic001G284700 Sobic001G284700 Sobic006G264800--Sobic001G284700 Sobic002G108300--Sobic008G088900 Sobic002G108300--Sobic003G091500 Sobic002G108300--Sobic008G184100 Sobic002G108300--Sobic009G058300 Sobic002G108300--Sobic001G489075 Sobic007G032500 Sobic007G032500 Sobic002G108300--Sobic007G032500 Sobic002G108300--Sobic004G171600 Sobic002G108300--Sobic005G146966 Sobic002G108300--Sobic005G174000 Sobic002G293100--Sobic004G171600 Sobic002G293100--Sobic005G077900 Sobic002G293100--Sobic005G174000 Sobic002G293100--Sobic001G200900 Sobic002G293100--Sobic005G021100 Sobic002G293100--Sobic009G061900 Sobic002G293100--Sobic001G489075 Sobic002G293100--Sobic002G089500 Sobic002G293100--Sobic001G233600 Sobic001G200900--Sobic005G174000 Sobic001G200900--Sobic004G171600 Sobic001G200900--Sobic009G061900 Sobic001G200900--Sobic005G077900 Sobic001G200900--Sobic005G186300 Sobic002G192600 Sobic002G192600 Sobic001G200900--Sobic002G192600 Sobic001G200900--Sobic002G293100 Sobic009G052400 Sobic009G052400 Sobic001G200900--Sobic009G052400 Sobic001G200900--Sobic001G233600
Octagon: transcription factors


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