Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G171600.1
Synonym RGE1, Sb04g022270, ZOU
Functional annotation helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed
UniProt A0A1Z5RMY2
Pfam PF00010
Panther DB PTHR11514 PTHR11514:SF57
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G49770 : basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g35010.1 : helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.004G171600


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic004G171600 Sobic004G171600 Sobic005G077900 Sobic005G077900 Sobic004G171600--Sobic005G077900 Sobic005G174000 Sobic005G174000 Sobic004G171600--Sobic005G174000 Sobic001G200900 Sobic001G200900 Sobic004G171600--Sobic001G200900 Sobic002G293100 Sobic002G293100 Sobic004G171600--Sobic002G293100 Sobic002G007700 Sobic002G007700 Sobic004G171600--Sobic002G007700 Sobic001G233600 Sobic001G233600 Sobic004G171600--Sobic001G233600 Sobic005G021100 Sobic005G021100 Sobic004G171600--Sobic005G021100 Sobic008G088900 Sobic008G088900 Sobic004G171600--Sobic008G088900 Sobic002G089500 Sobic002G089500 Sobic004G171600--Sobic002G089500 Sobic005G077900--Sobic004G171600 Sobic005G077900--Sobic005G174000 Sobic005G077900--Sobic001G200900 Sobic005G077900--Sobic002G293100 Sobic005G077900--Sobic001G233600 Sobic005G077900--Sobic002G007700 Sobic005G077900--Sobic005G021100 Sobic001G489075 Sobic001G489075 Sobic005G077900--Sobic001G489075 Sobic005G077900--Sobic008G088900 Sobic005G174000--Sobic001G200900 Sobic005G174000--Sobic004G171600 Sobic005G174000--Sobic005G077900 Sobic005G174000--Sobic001G489075 Sobic005G174000--Sobic001G233600 Sobic005G174000--Sobic002G293100 Sobic005G174000--Sobic008G088900 Sobic009G061900 Sobic009G061900 Sobic005G174000--Sobic009G061900 Sobic005G146966 Sobic005G146966 Sobic005G174000--Sobic005G146966 Sobic001G200900--Sobic005G174000 Sobic001G200900--Sobic004G171600 Sobic001G200900--Sobic009G061900 Sobic001G200900--Sobic005G077900 Sobic005G186300 Sobic005G186300 Sobic001G200900--Sobic005G186300 Sobic002G192600 Sobic002G192600 Sobic001G200900--Sobic002G192600 Sobic001G200900--Sobic002G293100 Sobic009G052400 Sobic009G052400 Sobic001G200900--Sobic009G052400 Sobic001G200900--Sobic001G233600 Sobic002G293100--Sobic004G171600 Sobic002G293100--Sobic005G077900 Sobic002G293100--Sobic005G174000 Sobic002G293100--Sobic001G200900 Sobic002G293100--Sobic005G021100 Sobic002G293100--Sobic009G061900 Sobic002G293100--Sobic001G489075 Sobic002G293100--Sobic002G089500 Sobic002G293100--Sobic001G233600 Sobic002G007700--Sobic001G233600 Sobic002G007700--Sobic004G171600 Sobic002G007700--Sobic002G089500 Sobic002G007700--Sobic005G077900 Sobic002G007700--Sobic005G174000 Sobic003G091500 Sobic003G091500 Sobic002G007700--Sobic003G091500 Sobic008G184100 Sobic008G184100 Sobic002G007700--Sobic008G184100 Sobic002G007700--Sobic005G021100 Sobic002G007700--Sobic008G088900 Sobic001G233600--Sobic002G007700 Sobic001G233600--Sobic004G171600 Sobic001G233600--Sobic005G077900 Sobic001G233600--Sobic005G174000 Sobic001G233600--Sobic001G200900 Sobic001G233600--Sobic002G089500 Sobic001G233600--Sobic005G021100 Sobic001G233600--Sobic008G088900 Sobic001G233600--Sobic002G293100 Sobic005G021100--Sobic002G089500 Sobic001G392900 Sobic001G392900 Sobic005G021100--Sobic001G392900 Sobic005G021100--Sobic004G171600 Sobic002G381600 Sobic002G381600 Sobic005G021100--Sobic002G381600 Sobic008G168400 Sobic008G168400 Sobic005G021100--Sobic008G168400 Sobic005G021100--Sobic002G293100 Sobic005G021100--Sobic009G052400 Sobic001G129900 Sobic001G129900 Sobic005G021100--Sobic001G129900 Sobic005G021100--Sobic005G077900 Sobic002G108300 Sobic002G108300 Sobic008G088900--Sobic002G108300 Sobic008G088900--Sobic003G091500 Sobic008G088900--Sobic008G184100 Sobic008G088900--Sobic004G171600 Sobic008G088900--Sobic001G489075 Sobic008G088900--Sobic005G174000 Sobic008G088900--Sobic005G077900 Sobic008G088900--Sobic002G007700 Sobic008G088900--Sobic005G146966 Sobic002G089500--Sobic005G021100 Sobic002G089500--Sobic001G392900 Sobic002G089500--Sobic002G007700 Sobic002G089500--Sobic004G171600 Sobic002G089500--Sobic001G233600 Sobic002G089500--Sobic002G293100 Sobic002G089500--Sobic005G077900 Sobic002G089500--Sobic001G200900 Sobic002G089500--Sobic005G174000
Octagon: transcription factors


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