Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G091500.1
Synonym Sb03g007650
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XE56
Pfam -
Panther DB PTHR10315 PTHR10315:SF46
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0007275; multicellular organism development GO:0006511ubiquitin-dependent protein catabolic process GO:0005634nucleus


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G62800 : Protein with RING/U-box and TRAF-like domains
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g03190.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G184100 aspartic proteinase, putative, expressed -
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15 Sobic.005G146966 - -
16 Sobic.005G174500 - -
17 Sobic.005G174200 - -
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19 Sobic.009G058300 expressed protein -
20 Sobic.001G200900 LTPL160 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G091500 Sobic003G091500 Sobic008G184100 Sobic008G184100 Sobic003G091500--Sobic008G184100 Sobic008G088900 Sobic008G088900 Sobic003G091500--Sobic008G088900 Sobic002G108300 Sobic002G108300 Sobic003G091500--Sobic002G108300 Sobic002G007700 Sobic002G007700 Sobic003G091500--Sobic002G007700 Sobic004G171600 Sobic004G171600 Sobic003G091500--Sobic004G171600 Sobic003G207100 Sobic003G207100 Sobic003G091500--Sobic003G207100 Sobic001G233600 Sobic001G233600 Sobic003G091500--Sobic001G233600 Sobic008G031400 Sobic008G031400 Sobic003G091500--Sobic008G031400 Sobic005G077900 Sobic005G077900 Sobic003G091500--Sobic005G077900 Sobic008G184100--Sobic003G091500 Sobic008G184100--Sobic008G088900 Sobic008G184100--Sobic002G108300 Sobic008G184100--Sobic002G007700 Sobic008G184100--Sobic004G171600 Sobic008G184100--Sobic008G031400 Sobic008G184100--Sobic001G233600 Sobic008G184100--Sobic003G207100 Sobic005G174000 Sobic005G174000 Sobic008G184100--Sobic005G174000 Sobic008G088900--Sobic002G108300 Sobic008G088900--Sobic003G091500 Sobic008G088900--Sobic008G184100 Sobic008G088900--Sobic004G171600 Sobic001G489075 Sobic001G489075 Sobic008G088900--Sobic001G489075 Sobic008G088900--Sobic005G174000 Sobic008G088900--Sobic005G077900 Sobic008G088900--Sobic002G007700 Sobic005G146966 Sobic005G146966 Sobic008G088900--Sobic005G146966 Sobic002G108300--Sobic008G088900 Sobic002G108300--Sobic003G091500 Sobic002G108300--Sobic008G184100 Sobic009G058300 Sobic009G058300 Sobic002G108300--Sobic009G058300 Sobic002G108300--Sobic001G489075 Sobic007G032500 Sobic007G032500 Sobic002G108300--Sobic007G032500 Sobic002G108300--Sobic004G171600 Sobic002G108300--Sobic005G146966 Sobic002G108300--Sobic005G174000 Sobic002G007700--Sobic001G233600 Sobic002G007700--Sobic004G171600 Sobic002G089500 Sobic002G089500 Sobic002G007700--Sobic002G089500 Sobic002G007700--Sobic005G077900 Sobic002G007700--Sobic005G174000 Sobic002G007700--Sobic003G091500 Sobic002G007700--Sobic008G184100 Sobic005G021100 Sobic005G021100 Sobic002G007700--Sobic005G021100 Sobic002G007700--Sobic008G088900 Sobic004G171600--Sobic005G077900 Sobic004G171600--Sobic005G174000 Sobic001G200900 Sobic001G200900 Sobic004G171600--Sobic001G200900 Sobic002G293100 Sobic002G293100 Sobic004G171600--Sobic002G293100 Sobic004G171600--Sobic002G007700 Sobic004G171600--Sobic001G233600 Sobic004G171600--Sobic005G021100 Sobic004G171600--Sobic008G088900 Sobic004G171600--Sobic002G089500 Sobic003G207100--Sobic002G007700 Sobic003G207100--Sobic003G091500 Sobic003G207100--Sobic008G184100 Sobic003G207100--Sobic002G089500 Sobic003G207100--Sobic001G233600 Sobic003G207100--Sobic004G171600 Sobic003G207100--Sobic005G077900 Sobic005G174500 Sobic005G174500 Sobic003G207100--Sobic005G174500 Sobic003G207100--Sobic008G088900 Sobic001G233600--Sobic002G007700 Sobic001G233600--Sobic004G171600 Sobic001G233600--Sobic005G077900 Sobic001G233600--Sobic005G174000 Sobic001G233600--Sobic001G200900 Sobic001G233600--Sobic002G089500 Sobic001G233600--Sobic005G021100 Sobic001G233600--Sobic008G088900 Sobic001G233600--Sobic002G293100 Sobic008G031400--Sobic008G184100 Sobic008G031400--Sobic003G091500 Sobic005G032500 Sobic005G032500 Sobic008G031400--Sobic005G032500 Sobic008G031400--Sobic008G088900 Sobic007G037200 Sobic007G037200 Sobic008G031400--Sobic007G037200 Sobic008G031400--Sobic001G489075 Sobic008G031400--Sobic004G171600 Sobic008G031400--Sobic002G108300 Sobic008G031400--Sobic002G293100 Sobic005G077900--Sobic004G171600 Sobic005G077900--Sobic005G174000 Sobic005G077900--Sobic001G200900 Sobic005G077900--Sobic002G293100 Sobic005G077900--Sobic001G233600 Sobic005G077900--Sobic002G007700 Sobic005G077900--Sobic005G021100 Sobic005G077900--Sobic001G489075 Sobic005G077900--Sobic008G088900
Octagon: transcription factors


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