Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G174000.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PT69
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G200900 LTPL160 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
2 Sobic.004G171600 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
3 Sobic.005G077900 OsFBX411 - F-box domain containing protein, expressed -
4 Sobic.001G489075 - -
5 Sobic.001G233600 expressed protein -
6 Sobic.002G293100 ZOS9-17 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
7 Sobic.008G088900 hypothetical protein -
8 Sobic.009G061900 BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1-associated receptor kinase 1 precursor, putative, expressed -
9 Sobic.005G146966 - -
10 Sobic.002G007700 nodulin family protein, putative, expressed -
11 Sobic.005G186300 - -
12 Sobic.005G021100 - -
13 Sobic.002G409300 expressed protein -
14 Sobic.002G108300 expressed protein -
15 Sobic.002G192600 no apical meristem protein, putative, expressed -
16 Sobic.002G089500 DEF8 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
17 Sobic.003G091500 expressed protein -
18 Sobic.008G184100 aspartic proteinase, putative, expressed -
19 Sobic.009G052400 inorganic H+ pyrophosphatase, putative, expressed K01507: inorganic pyrophosphatase
20 Sobic.007G205400 Not investigated(PubMedID : 23766026)@AP2 domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G174000 Sobic005G174000 Sobic001G200900 Sobic001G200900 Sobic005G174000--Sobic001G200900 Sobic004G171600 Sobic004G171600 Sobic005G174000--Sobic004G171600 Sobic005G077900 Sobic005G077900 Sobic005G174000--Sobic005G077900 Sobic001G489075 Sobic001G489075 Sobic005G174000--Sobic001G489075 Sobic001G233600 Sobic001G233600 Sobic005G174000--Sobic001G233600 Sobic002G293100 Sobic002G293100 Sobic005G174000--Sobic002G293100 Sobic008G088900 Sobic008G088900 Sobic005G174000--Sobic008G088900 Sobic009G061900 Sobic009G061900 Sobic005G174000--Sobic009G061900 Sobic005G146966 Sobic005G146966 Sobic005G174000--Sobic005G146966 Sobic001G200900--Sobic005G174000 Sobic001G200900--Sobic004G171600 Sobic001G200900--Sobic009G061900 Sobic001G200900--Sobic005G077900 Sobic005G186300 Sobic005G186300 Sobic001G200900--Sobic005G186300 Sobic002G192600 Sobic002G192600 Sobic001G200900--Sobic002G192600 Sobic001G200900--Sobic002G293100 Sobic009G052400 Sobic009G052400 Sobic001G200900--Sobic009G052400 Sobic001G200900--Sobic001G233600 Sobic004G171600--Sobic005G077900 Sobic004G171600--Sobic005G174000 Sobic004G171600--Sobic001G200900 Sobic004G171600--Sobic002G293100 Sobic002G007700 Sobic002G007700 Sobic004G171600--Sobic002G007700 Sobic004G171600--Sobic001G233600 Sobic005G021100 Sobic005G021100 Sobic004G171600--Sobic005G021100 Sobic004G171600--Sobic008G088900 Sobic002G089500 Sobic002G089500 Sobic004G171600--Sobic002G089500 Sobic005G077900--Sobic004G171600 Sobic005G077900--Sobic005G174000 Sobic005G077900--Sobic001G200900 Sobic005G077900--Sobic002G293100 Sobic005G077900--Sobic001G233600 Sobic005G077900--Sobic002G007700 Sobic005G077900--Sobic005G021100 Sobic005G077900--Sobic001G489075 Sobic005G077900--Sobic008G088900 Sobic001G489075--Sobic005G174000 Sobic001G489075--Sobic008G088900 Sobic001G489075--Sobic005G146966 Sobic001G489075--Sobic004G171600 Sobic002G409300 Sobic002G409300 Sobic001G489075--Sobic002G409300 Sobic006G264800 Sobic006G264800 Sobic001G489075--Sobic006G264800 Sobic002G108300 Sobic002G108300 Sobic001G489075--Sobic002G108300 Sobic001G489075--Sobic002G293100 Sobic001G489075--Sobic001G200900 Sobic001G233600--Sobic002G007700 Sobic001G233600--Sobic004G171600 Sobic001G233600--Sobic005G077900 Sobic001G233600--Sobic005G174000 Sobic001G233600--Sobic001G200900 Sobic001G233600--Sobic002G089500 Sobic001G233600--Sobic005G021100 Sobic001G233600--Sobic008G088900 Sobic001G233600--Sobic002G293100 Sobic002G293100--Sobic004G171600 Sobic002G293100--Sobic005G077900 Sobic002G293100--Sobic005G174000 Sobic002G293100--Sobic001G200900 Sobic002G293100--Sobic005G021100 Sobic002G293100--Sobic009G061900 Sobic002G293100--Sobic001G489075 Sobic002G293100--Sobic002G089500 Sobic002G293100--Sobic001G233600 Sobic008G088900--Sobic002G108300 Sobic003G091500 Sobic003G091500 Sobic008G088900--Sobic003G091500 Sobic008G184100 Sobic008G184100 Sobic008G088900--Sobic008G184100 Sobic008G088900--Sobic004G171600 Sobic008G088900--Sobic001G489075 Sobic008G088900--Sobic005G174000 Sobic008G088900--Sobic005G077900 Sobic008G088900--Sobic002G007700 Sobic008G088900--Sobic005G146966 Sobic007G187100 Sobic007G187100 Sobic009G061900--Sobic007G187100 Sobic009G061900--Sobic005G186300 Sobic009G061900--Sobic001G200900 Sobic009G061900--Sobic002G192600 Sobic009G061900--Sobic002G409300 Sobic009G061900--Sobic009G052400 Sobic001G129900 Sobic001G129900 Sobic009G061900--Sobic001G129900 Sobic004G133600 Sobic004G133600 Sobic009G061900--Sobic004G133600 Sobic009G061900--Sobic005G174000 Sobic005G146966--Sobic001G489075 Sobic005G146966--Sobic005G174000 Sobic005G146966--Sobic004G171600 Sobic005G146966--Sobic008G088900 Sobic005G146966--Sobic001G200900 Sobic005G146966--Sobic005G077900 Sobic005G146966--Sobic002G108300 Sobic005G146966--Sobic002G293100 Sobic005G146966--Sobic009G061900
Octagon: transcription factors


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