Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G200900.1
Synonym Sb01g017710
Functional annotation LTPL160 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed
UniProt C5WWD2
Pfam PF14368
Panther DB PTHR33214
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G18280 : Bifunctional inhibitor/lipid-transfer protein/seed storage 2S albumin superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g36170.1 : LTPL160 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.001G200900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic001G200900 Sobic001G200900 Sobic005G174000 Sobic005G174000 Sobic001G200900--Sobic005G174000 Sobic004G171600 Sobic004G171600 Sobic001G200900--Sobic004G171600 Sobic009G061900 Sobic009G061900 Sobic001G200900--Sobic009G061900 Sobic005G077900 Sobic005G077900 Sobic001G200900--Sobic005G077900 Sobic005G186300 Sobic005G186300 Sobic001G200900--Sobic005G186300 Sobic002G192600 Sobic002G192600 Sobic001G200900--Sobic002G192600 Sobic002G293100 Sobic002G293100 Sobic001G200900--Sobic002G293100 Sobic009G052400 Sobic009G052400 Sobic001G200900--Sobic009G052400 Sobic001G233600 Sobic001G233600 Sobic001G200900--Sobic001G233600 Sobic005G174000--Sobic001G200900 Sobic005G174000--Sobic004G171600 Sobic005G174000--Sobic005G077900 Sobic001G489075 Sobic001G489075 Sobic005G174000--Sobic001G489075 Sobic005G174000--Sobic001G233600 Sobic005G174000--Sobic002G293100 Sobic008G088900 Sobic008G088900 Sobic005G174000--Sobic008G088900 Sobic005G174000--Sobic009G061900 Sobic005G146966 Sobic005G146966 Sobic005G174000--Sobic005G146966 Sobic004G171600--Sobic005G077900 Sobic004G171600--Sobic005G174000 Sobic004G171600--Sobic001G200900 Sobic004G171600--Sobic002G293100 Sobic002G007700 Sobic002G007700 Sobic004G171600--Sobic002G007700 Sobic004G171600--Sobic001G233600 Sobic005G021100 Sobic005G021100 Sobic004G171600--Sobic005G021100 Sobic004G171600--Sobic008G088900 Sobic002G089500 Sobic002G089500 Sobic004G171600--Sobic002G089500 Sobic007G187100 Sobic007G187100 Sobic009G061900--Sobic007G187100 Sobic009G061900--Sobic005G186300 Sobic009G061900--Sobic001G200900 Sobic009G061900--Sobic002G192600 Sobic002G409300 Sobic002G409300 Sobic009G061900--Sobic002G409300 Sobic009G061900--Sobic009G052400 Sobic001G129900 Sobic001G129900 Sobic009G061900--Sobic001G129900 Sobic004G133600 Sobic004G133600 Sobic009G061900--Sobic004G133600 Sobic009G061900--Sobic005G174000 Sobic005G077900--Sobic004G171600 Sobic005G077900--Sobic005G174000 Sobic005G077900--Sobic001G200900 Sobic005G077900--Sobic002G293100 Sobic005G077900--Sobic001G233600 Sobic005G077900--Sobic002G007700 Sobic005G077900--Sobic005G021100 Sobic005G077900--Sobic001G489075 Sobic005G077900--Sobic008G088900 Sobic005G186300--Sobic002G192600 Sobic005G186300--Sobic009G061900 Sobic007G205400 Sobic007G205400 Sobic005G186300--Sobic007G205400 Sobic005G186300--Sobic002G409300 Sobic005G186300--Sobic001G200900 Sobic005G186300--Sobic007G187100 Sobic005G186300--Sobic004G133600 Sobic002G078800 Sobic002G078800 Sobic005G186300--Sobic002G078800 Sobic005G186300--Sobic005G174000 Sobic002G192600--Sobic004G133600 Sobic002G192600--Sobic005G186300 Sobic002G192600--Sobic009G052400 Sobic002G192600--Sobic002G078800 Sobic002G192600--Sobic001G129900 Sobic002G192600--Sobic009G061900 Sobic002G192600--Sobic007G205400 Sobic006G080500 Sobic006G080500 Sobic002G192600--Sobic006G080500 Sobic006G015750 Sobic006G015750 Sobic002G192600--Sobic006G015750 Sobic002G293100--Sobic004G171600 Sobic002G293100--Sobic005G077900 Sobic002G293100--Sobic005G174000 Sobic002G293100--Sobic001G200900 Sobic002G293100--Sobic005G021100 Sobic002G293100--Sobic009G061900 Sobic002G293100--Sobic001G489075 Sobic002G293100--Sobic002G089500 Sobic002G293100--Sobic001G233600 Sobic009G052400--Sobic001G129900 Sobic009G052400--Sobic006G080500 Sobic002G381600 Sobic002G381600 Sobic009G052400--Sobic002G381600 Sobic009G052400--Sobic002G192600 Sobic009G052400--Sobic004G133600 Sobic005G079300 Sobic005G079300 Sobic009G052400--Sobic005G079300 Sobic009G052400--Sobic002G078800 Sobic008G168400 Sobic008G168400 Sobic009G052400--Sobic008G168400 Sobic006G178400 Sobic006G178400 Sobic009G052400--Sobic006G178400 Sobic001G233600--Sobic002G007700 Sobic001G233600--Sobic004G171600 Sobic001G233600--Sobic005G077900 Sobic001G233600--Sobic005G174000 Sobic001G233600--Sobic001G200900 Sobic001G233600--Sobic002G089500 Sobic001G233600--Sobic005G021100 Sobic001G233600--Sobic008G088900 Sobic001G233600--Sobic002G293100
Octagon: transcription factors


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