Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G124400.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt C5Y2Q3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G062300 BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1-associated receptor kinase 1 precursor, putative, expressed -
2 Sobic.005G226800 pumilio-family RNA binding protein, putative, expressed K17943: pumilio RNA-binding family
3 Sobic.003G103100 - -
4 Sobic.005G042400 expressed protein -
5 Sobic.001G269650 - -
6 Sobic.007G066200 - -
7 Sobic.003G211600 - -
8 Sobic.004G029700 expressed protein -
9 Sobic.010G133150 - -
10 Sobic.001G495700 Core histone H2A/H2B/H3/H4 domain containing protein, putative, expressed K11251: histone H2A
11 Sobic.008G184500 aspartic proteinase, putative, expressed -
12 Sobic.002G097100 OsFBLD6 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
13 Sobic.010G137600 - -
14 Sobic.007G199500 MBTB30 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
15 Sobic.005G052200 expressed protein -
16 Sobic.002G015500 OsFBD13 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
17 Sobic.010G029800 - -
18 Sobic.003G319050 - -
19 Sobic.001G374600 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence./early senescence marker (common during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence)"(PubMedID : 27586543)@desiccation-related protein PCC13-62 precursor, putative, expressed -
20 Sobic.005G174200 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G124400 Sobic005G124400 Sobic009G062300 Sobic009G062300 Sobic005G124400--Sobic009G062300 Sobic005G226800 Sobic005G226800 Sobic005G124400--Sobic005G226800 Sobic003G103100 Sobic003G103100 Sobic005G124400--Sobic003G103100 Sobic005G042400 Sobic005G042400 Sobic005G124400--Sobic005G042400 Sobic001G269650 Sobic001G269650 Sobic005G124400--Sobic001G269650 Sobic007G066200 Sobic007G066200 Sobic005G124400--Sobic007G066200 Sobic003G211600 Sobic003G211600 Sobic005G124400--Sobic003G211600 Sobic004G029700 Sobic004G029700 Sobic005G124400--Sobic004G029700 Sobic010G133150 Sobic010G133150 Sobic005G124400--Sobic010G133150 Sobic009G062300--Sobic005G226800 Sobic009G062300--Sobic003G211600 Sobic009G062300--Sobic005G124400 Sobic009G062300--Sobic007G066200 Sobic009G062300--Sobic001G269650 Sobic009G062300--Sobic005G042400 Sobic009G062300--Sobic003G103100 Sobic001G495700 Sobic001G495700 Sobic009G062300--Sobic001G495700 Sobic009G062300--Sobic010G133150 Sobic005G226800--Sobic009G062300 Sobic005G226800--Sobic007G066200 Sobic005G226800--Sobic003G211600 Sobic005G226800--Sobic005G124400 Sobic005G226800--Sobic001G269650 Sobic001G374600 Sobic001G374600 Sobic005G226800--Sobic001G374600 Sobic005G226800--Sobic005G042400 Sobic005G226800--Sobic001G495700 Sobic005G174200 Sobic005G174200 Sobic005G226800--Sobic005G174200 Sobic003G103100--Sobic004G029700 Sobic008G184500 Sobic008G184500 Sobic003G103100--Sobic008G184500 Sobic005G052200 Sobic005G052200 Sobic003G103100--Sobic005G052200 Sobic003G103100--Sobic005G042400 Sobic004G114700 Sobic004G114700 Sobic003G103100--Sobic004G114700 Sobic003G103100--Sobic005G124400 Sobic008G184000 Sobic008G184000 Sobic003G103100--Sobic008G184000 Sobic003G103100--Sobic009G062300 Sobic002G105900 Sobic002G105900 Sobic003G103100--Sobic002G105900 Sobic010G029800 Sobic010G029800 Sobic005G042400--Sobic010G029800 Sobic005G042400--Sobic003G103100 Sobic004G008700 Sobic004G008700 Sobic005G042400--Sobic004G008700 Sobic005G042400--Sobic005G052200 Sobic005G042400--Sobic005G124400 Sobic005G042400--Sobic009G062300 Sobic010G137600 Sobic010G137600 Sobic005G042400--Sobic010G137600 Sobic005G042400--Sobic004G114700 Sobic005G042400--Sobic005G226800 Sobic001G269650--Sobic007G066200 Sobic001G269650--Sobic009G062300 Sobic005G176875 Sobic005G176875 Sobic001G269650--Sobic005G176875 Sobic001G269650--Sobic005G226800 Sobic001G269650--Sobic001G495700 Sobic001G269650--Sobic008G184500 Sobic001G269650--Sobic003G211600 Sobic002G015500 Sobic002G015500 Sobic001G269650--Sobic002G015500 Sobic001G269650--Sobic005G124400 Sobic007G066200--Sobic005G226800 Sobic007G066200--Sobic003G211600 Sobic007G066200--Sobic009G062300 Sobic007G066200--Sobic001G269650 Sobic007G066200--Sobic005G124400 Sobic007G066200--Sobic001G374600 Sobic005G033600 Sobic005G033600 Sobic007G066200--Sobic005G033600 Sobic007G066200--Sobic001G495700 Sobic007G066200--Sobic005G174200 Sobic003G211600--Sobic005G226800 Sobic003G211600--Sobic007G066200 Sobic003G211600--Sobic001G374600 Sobic003G211600--Sobic005G174200 Sobic003G211600--Sobic009G062300 Sobic007G032500 Sobic007G032500 Sobic003G211600--Sobic007G032500 Sobic005G173900 Sobic005G173900 Sobic003G211600--Sobic005G173900 Sobic003G211600--Sobic001G495700 Sobic003G211600--Sobic005G033600 Sobic004G029700--Sobic008G184500 Sobic004G029700--Sobic003G103100 Sobic004G029700--Sobic002G105900 Sobic005G227151 Sobic005G227151 Sobic004G029700--Sobic005G227151 Sobic003G319050 Sobic003G319050 Sobic004G029700--Sobic003G319050 Sobic004G029700--Sobic008G184000 Sobic002G097100 Sobic002G097100 Sobic004G029700--Sobic002G097100 Sobic002G007300 Sobic002G007300 Sobic004G029700--Sobic002G007300 Sobic003G099900 Sobic003G099900 Sobic004G029700--Sobic003G099900 Sobic010G133150--Sobic001G495700 Sobic010G133150--Sobic002G097100 Sobic010G133150--Sobic002G015500 Sobic010G133150--Sobic007G032500 Sobic010G133150--Sobic003G319050 Sobic010G133150--Sobic005G174200 Sobic009G057100 Sobic009G057100 Sobic010G133150--Sobic009G057100 Sobic001G511400 Sobic001G511400 Sobic010G133150--Sobic001G511400 Sobic007G199500 Sobic007G199500 Sobic010G133150--Sobic007G199500
Octagon: transcription factors


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