Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G238900.1
Synonym ENODL5, AtENODL5, Sb02g027670
Functional annotation plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed
UniProt C5X3P6
Pfam PF02298
Panther DB PTHR33021 PTHR33021:SF15
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0009055; electron transfer activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G18590 : early nodulin-like protein 5
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g17730.1 : plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


cDNA sequences
Sobic.002G238900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G069000 protein kinase family protein, putative, expressed K14500: BR-signaling kinase
2 Sobic.005G177200 expressed protein -
3 Sobic.006G139400 expressed protein -
4 Sobic.005G037800 sialyltransferase family domain containing protein, expressed -
5 Sobic.010G029800 - -
6 Sobic.003G238900 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
7 Sobic.008G181200 - -
8 Sobic.004G048300 - -
9 Sobic.001G307400 oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family domain containing family, expressed K19329: WW domain-containing oxidoreductase
10 Sobic.008G184400 aspartic proteinase, putative, expressed -
11 Sobic.004G008700 - -
12 Sobic.007G040900 expressed protein -
13 Sobic.006G250200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@amino acid transporter, putative, expressed -
14 Sobic.009G210700 LTPL29 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
15 Sobic.008G069600 CRP10 - Cysteine-rich family protein precursor, expressed -
16 Sobic.002G049800 pumilio-family RNA binding protein, putative, expressed K17943: pumilio RNA-binding family
17 Sobic.005G042400 expressed protein -
18 Sobic.003G179300 DEF9 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
19 Sobic.003G010000 cytochrome P450, putative, expressed -
20 Sobic.003G167566 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G238900 Sobic002G238900 Sobic008G069000 Sobic008G069000 Sobic002G238900--Sobic008G069000 Sobic005G177200 Sobic005G177200 Sobic002G238900--Sobic005G177200 Sobic006G139400 Sobic006G139400 Sobic002G238900--Sobic006G139400 Sobic005G037800 Sobic005G037800 Sobic002G238900--Sobic005G037800 Sobic010G029800 Sobic010G029800 Sobic002G238900--Sobic010G029800 Sobic003G238900 Sobic003G238900 Sobic002G238900--Sobic003G238900 Sobic008G181200 Sobic008G181200 Sobic002G238900--Sobic008G181200 Sobic004G048300 Sobic004G048300 Sobic002G238900--Sobic004G048300 Sobic001G307400 Sobic001G307400 Sobic002G238900--Sobic001G307400 Sobic008G069000--Sobic010G029800 Sobic008G069000--Sobic004G048300 Sobic008G069000--Sobic006G139400 Sobic008G069000--Sobic003G238900 Sobic004G008700 Sobic004G008700 Sobic008G069000--Sobic004G008700 Sobic008G069000--Sobic002G238900 Sobic008G069000--Sobic005G177200 Sobic007G040900 Sobic007G040900 Sobic008G069000--Sobic007G040900 Sobic008G069000--Sobic008G181200 Sobic005G177200--Sobic008G181200 Sobic005G177200--Sobic005G037800 Sobic005G177200--Sobic006G139400 Sobic002G049800 Sobic002G049800 Sobic005G177200--Sobic002G049800 Sobic008G184400 Sobic008G184400 Sobic005G177200--Sobic008G184400 Sobic001G323500 Sobic001G323500 Sobic005G177200--Sobic001G323500 Sobic005G177200--Sobic008G069000 Sobic009G210700 Sobic009G210700 Sobic005G177200--Sobic009G210700 Sobic005G177200--Sobic003G238900 Sobic006G139400--Sobic009G210700 Sobic006G139400--Sobic003G238900 Sobic006G139400--Sobic005G177200 Sobic008G045700 Sobic008G045700 Sobic006G139400--Sobic008G045700 Sobic006G139400--Sobic008G069000 Sobic006G139400--Sobic008G181200 Sobic006G139400--Sobic005G037800 Sobic006G139400--Sobic001G323500 Sobic003G167566 Sobic003G167566 Sobic006G139400--Sobic003G167566 Sobic005G037800--Sobic005G177200 Sobic005G037800--Sobic008G181200 Sobic005G037800--Sobic002G049800 Sobic005G037800--Sobic008G184400 Sobic005G037800--Sobic006G139400 Sobic005G037800--Sobic008G069000 Sobic010G137700 Sobic010G137700 Sobic005G037800--Sobic010G137700 Sobic005G037800--Sobic001G323500 Sobic005G037800--Sobic010G029800 Sobic010G029800--Sobic004G008700 Sobic005G042400 Sobic005G042400 Sobic010G029800--Sobic005G042400 Sobic010G029800--Sobic008G069000 Sobic003G099800 Sobic003G099800 Sobic010G029800--Sobic003G099800 Sobic005G052200 Sobic005G052200 Sobic010G029800--Sobic005G052200 Sobic010G137600 Sobic010G137600 Sobic010G029800--Sobic010G137600 Sobic010G029800--Sobic008G181200 Sobic010G029800--Sobic007G040900 Sobic004G114700 Sobic004G114700 Sobic010G029800--Sobic004G114700 Sobic003G238900--Sobic009G210700 Sobic003G238900--Sobic006G139400 Sobic003G238900--Sobic003G167566 Sobic003G238900--Sobic008G069000 Sobic003G238900--Sobic008G045700 Sobic005G058400 Sobic005G058400 Sobic003G238900--Sobic005G058400 Sobic005G174800 Sobic005G174800 Sobic003G238900--Sobic005G174800 Sobic003G207800 Sobic003G207800 Sobic003G238900--Sobic003G207800 Sobic008G069600 Sobic008G069600 Sobic003G238900--Sobic008G069600 Sobic008G181200--Sobic005G177200 Sobic008G181200--Sobic005G037800 Sobic008G181200--Sobic002G049800 Sobic008G181200--Sobic008G184400 Sobic008G181200--Sobic008G069000 Sobic008G181200--Sobic006G139400 Sobic008G181200--Sobic010G029800 Sobic008G181200--Sobic010G137700 Sobic008G181200--Sobic001G323500 Sobic003G179300 Sobic003G179300 Sobic004G048300--Sobic003G179300 Sobic008G070100 Sobic008G070100 Sobic004G048300--Sobic008G070100 Sobic004G048300--Sobic007G040900 Sobic003G010000 Sobic003G010000 Sobic004G048300--Sobic003G010000 Sobic004G316200 Sobic004G316200 Sobic004G048300--Sobic004G316200 Sobic004G048300--Sobic005G174800 Sobic006G144201 Sobic006G144201 Sobic004G048300--Sobic006G144201 Sobic010G258900 Sobic010G258900 Sobic004G048300--Sobic010G258900 Sobic008G182100 Sobic008G182100 Sobic004G048300--Sobic008G182100 Sobic001G307400--Sobic005G177200 Sobic001G307400--Sobic008G181200 Sobic001G307400--Sobic008G069000 Sobic001G307400--Sobic005G037800 Sobic001G307400--Sobic010G029800 Sobic001G307400--Sobic002G238900 Sobic001G307400--Sobic006G139400 Sobic001G307400--Sobic002G049800 Sobic001G307400--Sobic008G184400
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.