Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G183300.1
Synonym Sb01g015940, MBD13
Functional annotation methyl-CpG binding domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6QJM4
Pfam PF01429
Panther DB PTHR34067 PTHR34067:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005634; nucleus GO:0003677DNA binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G52230 : methyl-CPG-binding domain protein 13
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g20560.2 : methyl-CpG binding domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a007094
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic001G183300 Sobic001G183300 Sobic001G438300 Sobic001G438300 Sobic001G183300--Sobic001G438300 Sobic007G040500 Sobic007G040500 Sobic001G183300--Sobic007G040500 Sobic004G048400 Sobic004G048400 Sobic001G183300--Sobic004G048400 Sobic008G045700 Sobic008G045700 Sobic001G183300--Sobic008G045700 Sobic005G082400 Sobic005G082400 Sobic001G183300--Sobic005G082400 Sobic009G210700 Sobic009G210700 Sobic001G183300--Sobic009G210700 Sobic008G135800 Sobic008G135800 Sobic001G183300--Sobic008G135800 Sobic001G323500 Sobic001G323500 Sobic001G183300--Sobic001G323500 Sobic006G139400 Sobic006G139400 Sobic001G183300--Sobic006G139400 Sobic001G438300--Sobic007G040500 Sobic001G438300--Sobic004G048400 Sobic001G438300--Sobic001G183300 Sobic001G438300--Sobic008G135800 Sobic001G438300--Sobic008G045700 Sobic001G438300--Sobic009G210700 Sobic001G438300--Sobic005G082400 Sobic003G207800 Sobic003G207800 Sobic001G438300--Sobic003G207800 Sobic005G133100 Sobic005G133100 Sobic001G438300--Sobic005G133100 Sobic007G040500--Sobic004G048400 Sobic007G040500--Sobic001G438300 Sobic007G040500--Sobic005G082400 Sobic007G040500--Sobic001G183300 Sobic007G040500--Sobic008G135800 Sobic007G040500--Sobic005G133100 Sobic007G040500--Sobic008G045700 Sobic007G040500--Sobic009G210700 Sobic007G040500--Sobic001G323500 Sobic004G048400--Sobic007G040500 Sobic004G048400--Sobic001G438300 Sobic004G048400--Sobic008G135800 Sobic004G048400--Sobic005G133100 Sobic004G048400--Sobic005G082400 Sobic004G048400--Sobic001G183300 Sobic005G212000 Sobic005G212000 Sobic004G048400--Sobic005G212000 Sobic007G047000 Sobic007G047000 Sobic004G048400--Sobic007G047000 Sobic004G048400--Sobic008G045700 Sobic008G045700--Sobic009G210700 Sobic008G045700--Sobic001G438300 Sobic008G045700--Sobic006G139400 Sobic008G045700--Sobic007G040500 Sobic008G045700--Sobic001G183300 Sobic008G045700--Sobic001G323500 Sobic003G238900 Sobic003G238900 Sobic008G045700--Sobic003G238900 Sobic008G045700--Sobic004G048400 Sobic008G045700--Sobic005G082400 Sobic005G082400--Sobic007G040500 Sobic005G082400--Sobic004G048400 Sobic005G082400--Sobic005G133100 Sobic005G082400--Sobic001G438300 Sobic006G276401 Sobic006G276401 Sobic005G082400--Sobic006G276401 Sobic005G082400--Sobic001G183300 Sobic005G082400--Sobic001G323500 Sobic009G039000 Sobic009G039000 Sobic005G082400--Sobic009G039000 Sobic005G082400--Sobic008G045700 Sobic009G210700--Sobic006G139400 Sobic009G210700--Sobic003G238900 Sobic009G210700--Sobic008G045700 Sobic009G210700--Sobic001G438300 Sobic009G210700--Sobic003G207800 Sobic003G167566 Sobic003G167566 Sobic009G210700--Sobic003G167566 Sobic009G210700--Sobic001G183300 Sobic005G213900 Sobic005G213900 Sobic009G210700--Sobic005G213900 Sobic009G210700--Sobic007G040500 Sobic008G135800--Sobic004G048400 Sobic008G135800--Sobic001G438300 Sobic008G135800--Sobic007G040500 Sobic008G135800--Sobic005G133100 Sobic008G135800--Sobic005G212000 Sobic002G094900 Sobic002G094900 Sobic008G135800--Sobic002G094900 Sobic002G053201 Sobic002G053201 Sobic008G135800--Sobic002G053201 Sobic008G135800--Sobic001G183300 Sobic008G135800--Sobic003G207800 Sobic009G017732 Sobic009G017732 Sobic001G323500--Sobic009G017732 Sobic001G323500--Sobic006G276401 Sobic005G148700 Sobic005G148700 Sobic001G323500--Sobic005G148700 Sobic005G177200 Sobic005G177200 Sobic001G323500--Sobic005G177200 Sobic001G323500--Sobic005G082400 Sobic001G323500--Sobic008G045700 Sobic001G323500--Sobic006G139400 Sobic005G141500 Sobic005G141500 Sobic001G323500--Sobic005G141500 Sobic005G221200 Sobic005G221200 Sobic001G323500--Sobic005G221200 Sobic006G139400--Sobic009G210700 Sobic006G139400--Sobic003G238900 Sobic006G139400--Sobic005G177200 Sobic006G139400--Sobic008G045700 Sobic008G069000 Sobic008G069000 Sobic006G139400--Sobic008G069000 Sobic008G181200 Sobic008G181200 Sobic006G139400--Sobic008G181200 Sobic005G037800 Sobic005G037800 Sobic006G139400--Sobic005G037800 Sobic006G139400--Sobic001G323500 Sobic006G139400--Sobic003G167566
Octagon: transcription factors


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