Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G415700.2
Synonym Sb03g044940, PDF1.5
Functional annotation gamma-thionin family domain containing protein, expressed
UniProt A0A1W0W1C6
Pfam PF00304
Panther DB PTHR33147:SF1 PTHR33147
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G55010 : plant defensin 1.5
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g70680.1 : DEF1 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G238300 - -
2 Sobic.005G152700 DEF3 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
3 Sobic.002G349600 ubiquitin-like protein SMT3, putative, expressed K12160: SUMO, small ubiquitin-related modifier
4 Sobic.004G090400 - -
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6 Sobic.002G352401 - -
7 Sobic.006G144101 - -
8 Sobic.004G221700 expressed protein -
9 Sobic.003G411100 transferase family protein, putative, expressed K15400: omega-hydroxypalmitate O-feruloyl transferase
10 Sobic.002G352501 - -
11 Sobic.005G200400 - -
12 Sobic.005G027100 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
13 Sobic.002G162100 DEFL34 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
14 Sobic.005G179700 OsMADS89 - MADS-box family gene with M-gamma type-box, expressed -
15 Sobic.005G153300 - -
16 Sobic.005G212000 LTPL33 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
17 Sobic.004G076400 zinc-binding protein, putative, expressed -
18 Sobic.002G151700 alpha-galactosidase precursor, putative, expressed K07407: E3.2.1.22B, galA, alpha-galactosidase
19 Sobic.005G150100 - -
20 Sobic.005G064400 eukaryotic aspartyl protease domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G415700 Sobic003G415700 Sobic006G238300 Sobic006G238300 Sobic003G415700--Sobic006G238300 Sobic005G152700 Sobic005G152700 Sobic003G415700--Sobic005G152700 Sobic002G349600 Sobic002G349600 Sobic003G415700--Sobic002G349600 Sobic004G090400 Sobic004G090400 Sobic003G415700--Sobic004G090400 Sobic002G345500 Sobic002G345500 Sobic003G415700--Sobic002G345500 Sobic002G352401 Sobic002G352401 Sobic003G415700--Sobic002G352401 Sobic006G144101 Sobic006G144101 Sobic003G415700--Sobic006G144101 Sobic004G221700 Sobic004G221700 Sobic003G415700--Sobic004G221700 Sobic003G411100 Sobic003G411100 Sobic003G415700--Sobic003G411100 Sobic006G238300--Sobic003G415700 Sobic006G238300--Sobic005G152700 Sobic005G200400 Sobic005G200400 Sobic006G238300--Sobic005G200400 Sobic002G162100 Sobic002G162100 Sobic006G238300--Sobic002G162100 Sobic006G238300--Sobic004G090400 Sobic006G238300--Sobic006G144101 Sobic006G238300--Sobic002G352401 Sobic005G153300 Sobic005G153300 Sobic006G238300--Sobic005G153300 Sobic006G238300--Sobic002G345500 Sobic007G024100 Sobic007G024100 Sobic005G152700--Sobic007G024100 Sobic008G182200 Sobic008G182200 Sobic005G152700--Sobic008G182200 Sobic002G162200 Sobic002G162200 Sobic005G152700--Sobic002G162200 Sobic008G071200 Sobic008G071200 Sobic005G152700--Sobic008G071200 Sobic005G152700--Sobic005G153300 Sobic002G053201 Sobic002G053201 Sobic005G152700--Sobic002G053201 Sobic004G015100 Sobic004G015100 Sobic005G152700--Sobic004G015100 Sobic003G245500 Sobic003G245500 Sobic005G152700--Sobic003G245500 Sobic008G073800 Sobic008G073800 Sobic005G152700--Sobic008G073800 Sobic005G141700 Sobic005G141700 Sobic002G349600--Sobic005G141700 Sobic006G194800 Sobic006G194800 Sobic002G349600--Sobic006G194800 Sobic001G345800 Sobic001G345800 Sobic002G349600--Sobic001G345800 Sobic002G349600--Sobic003G415700 Sobic007G041000 Sobic007G041000 Sobic002G349600--Sobic007G041000 Sobic002G349600--Sobic002G352401 Sobic002G332600 Sobic002G332600 Sobic002G349600--Sobic002G332600 Sobic005G147100 Sobic005G147100 Sobic002G349600--Sobic005G147100 Sobic010G010500 Sobic010G010500 Sobic002G349600--Sobic010G010500 Sobic004G090400--Sobic002G345500 Sobic004G090400--Sobic006G144101 Sobic004G090400--Sobic005G200400 Sobic004G090400--Sobic002G162100 Sobic004G090400--Sobic005G153300 Sobic002G352501 Sobic002G352501 Sobic004G090400--Sobic002G352501 Sobic005G179700 Sobic005G179700 Sobic004G090400--Sobic005G179700 Sobic004G090400--Sobic003G411100 Sobic004G090400--Sobic008G071200 Sobic002G345500--Sobic006G144101 Sobic002G345500--Sobic004G090400 Sobic002G345500--Sobic005G200400 Sobic002G345500--Sobic002G162100 Sobic002G345500--Sobic005G153300 Sobic002G345500--Sobic002G352501 Sobic002G345500--Sobic003G411100 Sobic002G345500--Sobic008G071200 Sobic002G345500--Sobic002G162200 Sobic005G064400 Sobic005G064400 Sobic002G352401--Sobic005G064400 Sobic006G007001 Sobic006G007001 Sobic002G352401--Sobic006G007001 Sobic010G129300 Sobic010G129300 Sobic002G352401--Sobic010G129300 Sobic005G081800 Sobic005G081800 Sobic002G352401--Sobic005G081800 Sobic006G006100 Sobic006G006100 Sobic002G352401--Sobic006G006100 Sobic002G095000 Sobic002G095000 Sobic002G352401--Sobic002G095000 Sobic004G029500 Sobic004G029500 Sobic002G352401--Sobic004G029500 Sobic004G316400 Sobic004G316400 Sobic002G352401--Sobic004G316400 Sobic002G058100 Sobic002G058100 Sobic002G352401--Sobic002G058100 Sobic006G144101--Sobic002G345500 Sobic006G144101--Sobic005G200400 Sobic006G144101--Sobic002G162100 Sobic006G144101--Sobic004G090400 Sobic006G144101--Sobic003G411100 Sobic006G144101--Sobic005G153300 Sobic006G144101--Sobic002G352501 Sobic006G144101--Sobic005G179700 Sobic006G144101--Sobic008G071200 Sobic004G076400 Sobic004G076400 Sobic004G221700--Sobic004G076400 Sobic005G098300 Sobic005G098300 Sobic004G221700--Sobic005G098300 Sobic002G151700 Sobic002G151700 Sobic004G221700--Sobic002G151700 Sobic004G221700--Sobic010G010500 Sobic005G027100 Sobic005G027100 Sobic004G221700--Sobic005G027100 Sobic004G221700--Sobic005G081800 Sobic004G221700--Sobic002G352501 Sobic004G221700--Sobic005G064400 Sobic004G221700--Sobic005G179700 Sobic003G411100--Sobic006G144101 Sobic008G048600 Sobic008G048600 Sobic003G411100--Sobic008G048600 Sobic003G411100--Sobic002G345500 Sobic003G411100--Sobic004G090400 Sobic003G411100--Sobic005G200400 Sobic003G411100--Sobic002G352501 Sobic003G411100--Sobic005G179700 Sobic003G411100--Sobic002G162100 Sobic004G014700 Sobic004G014700 Sobic003G411100--Sobic004G014700
Octagon: transcription factors


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