Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G345500.1
Synonym LCR79, LCR75
Functional annotation DEF3 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed
UniProt A0A1B6QF20
Pfam PF00304
Panther DB PTHR33147 PTHR33147:SF7
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G31957 : low-molecular-weight cysteine-rich 75
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g07624.1 : gamma-thionin family domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic002G345500 Sobic002G345500 Sobic006G144101 Sobic006G144101 Sobic002G345500--Sobic006G144101 Sobic004G090400 Sobic004G090400 Sobic002G345500--Sobic004G090400 Sobic005G200400 Sobic005G200400 Sobic002G345500--Sobic005G200400 Sobic002G162100 Sobic002G162100 Sobic002G345500--Sobic002G162100 Sobic005G153300 Sobic005G153300 Sobic002G345500--Sobic005G153300 Sobic002G352501 Sobic002G352501 Sobic002G345500--Sobic002G352501 Sobic003G411100 Sobic003G411100 Sobic002G345500--Sobic003G411100 Sobic008G071200 Sobic008G071200 Sobic002G345500--Sobic008G071200 Sobic002G162200 Sobic002G162200 Sobic002G345500--Sobic002G162200 Sobic006G144101--Sobic002G345500 Sobic006G144101--Sobic005G200400 Sobic006G144101--Sobic002G162100 Sobic006G144101--Sobic004G090400 Sobic006G144101--Sobic003G411100 Sobic006G144101--Sobic005G153300 Sobic006G144101--Sobic002G352501 Sobic005G179700 Sobic005G179700 Sobic006G144101--Sobic005G179700 Sobic006G144101--Sobic008G071200 Sobic004G090400--Sobic002G345500 Sobic004G090400--Sobic006G144101 Sobic004G090400--Sobic005G200400 Sobic004G090400--Sobic002G162100 Sobic004G090400--Sobic005G153300 Sobic004G090400--Sobic002G352501 Sobic004G090400--Sobic005G179700 Sobic004G090400--Sobic003G411100 Sobic004G090400--Sobic008G071200 Sobic005G200400--Sobic002G162100 Sobic005G200400--Sobic006G144101 Sobic005G200400--Sobic005G179700 Sobic005G200400--Sobic002G345500 Sobic005G200400--Sobic004G090400 Sobic005G200400--Sobic002G352501 Sobic005G200400--Sobic005G153300 Sobic005G200400--Sobic008G071200 Sobic005G200400--Sobic002G162200 Sobic002G162100--Sobic005G153300 Sobic002G162100--Sobic005G200400 Sobic002G162100--Sobic008G071200 Sobic002G162100--Sobic002G162200 Sobic002G162100--Sobic006G144101 Sobic002G162100--Sobic002G345500 Sobic004G015100 Sobic004G015100 Sobic002G162100--Sobic004G015100 Sobic002G162100--Sobic004G090400 Sobic008G182200 Sobic008G182200 Sobic002G162100--Sobic008G182200 Sobic005G153300--Sobic008G071200 Sobic005G153300--Sobic002G162200 Sobic005G153300--Sobic002G162100 Sobic005G153300--Sobic004G015100 Sobic005G153300--Sobic008G182200 Sobic005G153300--Sobic005G200400 Sobic005G153300--Sobic006G144101 Sobic005G153300--Sobic002G345500 Sobic005G153300--Sobic004G090400 Sobic002G352501--Sobic005G179700 Sobic002G352501--Sobic005G200400 Sobic005G027100 Sobic005G027100 Sobic002G352501--Sobic005G027100 Sobic005G064400 Sobic005G064400 Sobic002G352501--Sobic005G064400 Sobic006G194900 Sobic006G194900 Sobic002G352501--Sobic006G194900 Sobic002G352501--Sobic006G144101 Sobic002G352501--Sobic002G345500 Sobic002G352401 Sobic002G352401 Sobic002G352501--Sobic002G352401 Sobic002G352501--Sobic004G090400 Sobic003G411100--Sobic006G144101 Sobic008G048600 Sobic008G048600 Sobic003G411100--Sobic008G048600 Sobic003G411100--Sobic002G345500 Sobic003G411100--Sobic004G090400 Sobic003G411100--Sobic005G200400 Sobic003G411100--Sobic002G352501 Sobic003G411100--Sobic005G179700 Sobic003G411100--Sobic002G162100 Sobic004G014700 Sobic004G014700 Sobic003G411100--Sobic004G014700 Sobic008G071200--Sobic002G162200 Sobic008G071200--Sobic005G153300 Sobic008G071200--Sobic008G182200 Sobic008G071200--Sobic004G015100 Sobic008G071200--Sobic002G162100 Sobic003G245500 Sobic003G245500 Sobic008G071200--Sobic003G245500 Sobic008G071200--Sobic005G200400 Sobic008G071200--Sobic006G144101 Sobic008G071200--Sobic002G345500 Sobic002G162200--Sobic008G071200 Sobic002G162200--Sobic005G153300 Sobic002G162200--Sobic008G182200 Sobic002G162200--Sobic004G015100 Sobic002G162200--Sobic002G162100 Sobic002G162200--Sobic003G245500 Sobic002G162200--Sobic005G200400 Sobic002G162200--Sobic006G144101 Sobic002G162200--Sobic002G345500
Octagon: transcription factors


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