Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G074600.1
Synonym
Functional annotation LTPL33 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed
UniProt A0A1B6PQR6
Pfam PF14368
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g13960.1 : LTPL33 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G162200 DEFL34 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
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12 Sobic.005G152700 DEF3 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
13 Sobic.006G144101 - -
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15 Sobic.005G200400 - -
16 Sobic.007G024100 - -
17 Sobic.009G078600 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
18 Sobic.003G411100 transferase family protein, putative, expressed K15400: omega-hydroxypalmitate O-feruloyl transferase
19 Sobic.001G324600 cysteine proteinase inhibitor 8 precursor, putative, expressed -
20 Sobic.002G352501 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G074600 Sobic005G074600 Sobic002G162200 Sobic002G162200 Sobic005G074600--Sobic002G162200 Sobic008G071200 Sobic008G071200 Sobic005G074600--Sobic008G071200 Sobic008G182200 Sobic008G182200 Sobic005G074600--Sobic008G182200 Sobic005G153300 Sobic005G153300 Sobic005G074600--Sobic005G153300 Sobic004G015100 Sobic004G015100 Sobic005G074600--Sobic004G015100 Sobic003G245500 Sobic003G245500 Sobic005G074600--Sobic003G245500 Sobic002G162100 Sobic002G162100 Sobic005G074600--Sobic002G162100 Sobic002G053201 Sobic002G053201 Sobic005G074600--Sobic002G053201 Sobic008G073800 Sobic008G073800 Sobic005G074600--Sobic008G073800 Sobic002G162200--Sobic008G071200 Sobic002G162200--Sobic005G153300 Sobic002G162200--Sobic008G182200 Sobic002G162200--Sobic004G015100 Sobic002G162200--Sobic002G162100 Sobic002G162200--Sobic003G245500 Sobic005G200400 Sobic005G200400 Sobic002G162200--Sobic005G200400 Sobic006G144101 Sobic006G144101 Sobic002G162200--Sobic006G144101 Sobic002G345500 Sobic002G345500 Sobic002G162200--Sobic002G345500 Sobic008G071200--Sobic002G162200 Sobic008G071200--Sobic005G153300 Sobic008G071200--Sobic008G182200 Sobic008G071200--Sobic004G015100 Sobic008G071200--Sobic002G162100 Sobic008G071200--Sobic003G245500 Sobic008G071200--Sobic005G200400 Sobic008G071200--Sobic006G144101 Sobic008G071200--Sobic002G345500 Sobic008G182200--Sobic002G162200 Sobic008G182200--Sobic008G071200 Sobic008G182200--Sobic004G015100 Sobic008G182200--Sobic003G245500 Sobic008G182200--Sobic005G153300 Sobic008G182200--Sobic002G162100 Sobic008G182200--Sobic002G053201 Sobic008G182200--Sobic008G073800 Sobic007G024100 Sobic007G024100 Sobic008G182200--Sobic007G024100 Sobic005G153300--Sobic008G071200 Sobic005G153300--Sobic002G162200 Sobic005G153300--Sobic002G162100 Sobic005G153300--Sobic004G015100 Sobic005G153300--Sobic008G182200 Sobic005G153300--Sobic005G200400 Sobic005G153300--Sobic006G144101 Sobic005G153300--Sobic002G345500 Sobic004G090400 Sobic004G090400 Sobic005G153300--Sobic004G090400 Sobic004G015100--Sobic008G071200 Sobic004G015100--Sobic002G162200 Sobic004G015100--Sobic005G153300 Sobic004G015100--Sobic008G182200 Sobic004G015100--Sobic002G162100 Sobic004G015100--Sobic003G245500 Sobic004G015100--Sobic005G200400 Sobic004G015100--Sobic006G144101 Sobic004G015100--Sobic002G345500 Sobic003G245500--Sobic008G182200 Sobic009G078600 Sobic009G078600 Sobic003G245500--Sobic009G078600 Sobic003G245500--Sobic002G053201 Sobic003G245500--Sobic002G162200 Sobic003G245500--Sobic008G071200 Sobic003G245500--Sobic007G024100 Sobic003G245500--Sobic004G015100 Sobic002G094900 Sobic002G094900 Sobic003G245500--Sobic002G094900 Sobic003G245500--Sobic008G073800 Sobic002G162100--Sobic005G153300 Sobic002G162100--Sobic005G200400 Sobic002G162100--Sobic008G071200 Sobic002G162100--Sobic002G162200 Sobic002G162100--Sobic006G144101 Sobic002G162100--Sobic002G345500 Sobic002G162100--Sobic004G015100 Sobic002G162100--Sobic004G090400 Sobic002G162100--Sobic008G182200 Sobic002G053201--Sobic002G094900 Sobic002G053201--Sobic003G245500 Sobic002G053201--Sobic008G073800 Sobic002G053201--Sobic007G024100 Sobic002G053201--Sobic009G078600 Sobic002G053201--Sobic008G182200 Sobic003G207800 Sobic003G207800 Sobic002G053201--Sobic003G207800 Sobic002G053201--Sobic002G162200 Sobic002G053201--Sobic008G071200 Sobic008G073800--Sobic002G053201 Sobic008G073800--Sobic002G094900 Sobic008G073800--Sobic008G182200 Sobic008G073800--Sobic003G245500 Sobic008G073800--Sobic002G162200 Sobic008G073800--Sobic008G071200 Sobic008G073800--Sobic004G015100 Sobic008G073800--Sobic005G153300 Sobic008G073800--Sobic007G024100
Octagon: transcription factors


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