Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G042500.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PFI4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
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Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G152800 - -
2 Sobic.003G211266 - -
3 Sobic.005G108900 - -
4 Sobic.004G046300 DUF584 domain containing protein, putative, expressed -
5 Sobic.001G027000 expressed protein -
6 Sobic.004G076900 - -
7 Sobic.007G095700 Brix domain containing protein, putative, expressed -
8 Sobic.001G220132 - -
9 Sobic.001G220132 - -
10 Sobic.001G220132 - -
11 Sobic.001G220132 - -
12 Sobic.001G220132 - -
13 Sobic.001G220132 - -
14 Sobic.001G220132 - -
15 Sobic.001G220132 - -
16 Sobic.009G196600 expressed protein -
17 Sobic.010G136100 "kafirin seed storage protein, delta-kafirin precursor"(PubMedID : 21853065)@- -
18 Sobic.002G091100 - -
19 Sobic.002G234200 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
20 Sobic.008G181250 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G042500 Sobic007G042500 Sobic010G152800 Sobic010G152800 Sobic007G042500--Sobic010G152800 Sobic003G211266 Sobic003G211266 Sobic007G042500--Sobic003G211266 Sobic005G108900 Sobic005G108900 Sobic007G042500--Sobic005G108900 Sobic004G046300 Sobic004G046300 Sobic007G042500--Sobic004G046300 Sobic001G027000 Sobic001G027000 Sobic007G042500--Sobic001G027000 Sobic004G076900 Sobic004G076900 Sobic007G042500--Sobic004G076900 Sobic007G095700 Sobic007G095700 Sobic007G042500--Sobic007G095700 Sobic001G220132 Sobic001G220132 Sobic007G042500--Sobic001G220132 Sobic010G152800--Sobic003G211266 Sobic010G152800--Sobic001G220132 Sobic003G211266--Sobic001G220132 Sobic009G196600 Sobic009G196600 Sobic003G211266--Sobic009G196600 Sobic005G083220 Sobic005G083220 Sobic005G108900--Sobic005G083220 Sobic005G189000 Sobic005G189000 Sobic005G108900--Sobic005G189000 Sobic008G144201 Sobic008G144201 Sobic005G108900--Sobic008G144201 Sobic003G415200 Sobic003G415200 Sobic005G108900--Sobic003G415200 Sobic009G086100 Sobic009G086100 Sobic005G108900--Sobic009G086100 Sobic009G019700 Sobic009G019700 Sobic005G108900--Sobic009G019700 Sobic005G148100 Sobic005G148100 Sobic005G108900--Sobic005G148100 Sobic005G186250 Sobic005G186250 Sobic005G108900--Sobic005G186250 Sobic004G207500 Sobic004G207500 Sobic005G108900--Sobic004G207500 Sobic004G046300--Sobic001G027000 Sobic004G046300--Sobic001G220132 Sobic001G027000--Sobic004G046300 Sobic001G027000--Sobic001G220132 Sobic010G136100 Sobic010G136100 Sobic004G076900--Sobic010G136100 Sobic004G076900--Sobic009G196600 Sobic005G189800 Sobic005G189800 Sobic004G076900--Sobic005G189800 Sobic004G076900--Sobic005G148100 Sobic004G076900--Sobic001G220132 Sobic002G286800 Sobic002G286800 Sobic007G095700--Sobic002G286800 Sobic007G126000 Sobic007G126000 Sobic007G095700--Sobic007G126000 Sobic007G199500 Sobic007G199500 Sobic007G095700--Sobic007G199500 Sobic001G371600 Sobic001G371600 Sobic007G095700--Sobic001G371600 Sobic003G099900 Sobic003G099900 Sobic007G095700--Sobic003G099900 Sobic004G322901 Sobic004G322901 Sobic007G095700--Sobic004G322901 Sobic004G029800 Sobic004G029800 Sobic007G095700--Sobic004G029800 Sobic006G142850 Sobic006G142850 Sobic007G095700--Sobic006G142850 Sobic003G319050 Sobic003G319050 Sobic007G095700--Sobic003G319050 Sobic001G220132--Sobic001G220132 Sobic001G220132--Sobic009G196600 Sobic001G220132--Sobic010G136100
Octagon: transcription factors


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