Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G095700.1
Synonym
Functional annotation Brix domain containing protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6PH22
Pfam -
Panther DB PTHR13634
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G15460 : Ribosomal RNA processing Brix domain protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g37870.1 : Brix domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a031798
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G286800 MATE efflux protein, putative, expressed -
2 Sobic.007G126000 - -
3 Sobic.007G199500 MBTB30 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
4 Sobic.001G371600 - -
5 Sobic.003G099900 expressed protein -
6 Sobic.004G322901 - -
7 Sobic.004G029800 expressed protein -
8 Sobic.006G142850 - -
9 Sobic.003G319050 - -
10 Sobic.005G082300 - -
11 Sobic.005G184500 - -
12 Sobic.009G202200 expressed protein -
13 Sobic.005G185400 - -
14 Sobic.006G105300 expressed protein -
15 Sobic.005G184600 - -
16 Sobic.007G049000 OsFBX382 - F-box domain containing protein, expressed -
17 Sobic.005G184400 - -
18 Sobic.001G297700 expressed protein -
19 Sobic.010G035000 - -
20 Sobic.009G056100 splicing factor, arginine/serine-rich, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G095700 Sobic007G095700 Sobic002G286800 Sobic002G286800 Sobic007G095700--Sobic002G286800 Sobic007G126000 Sobic007G126000 Sobic007G095700--Sobic007G126000 Sobic007G199500 Sobic007G199500 Sobic007G095700--Sobic007G199500 Sobic001G371600 Sobic001G371600 Sobic007G095700--Sobic001G371600 Sobic003G099900 Sobic003G099900 Sobic007G095700--Sobic003G099900 Sobic004G322901 Sobic004G322901 Sobic007G095700--Sobic004G322901 Sobic004G029800 Sobic004G029800 Sobic007G095700--Sobic004G029800 Sobic006G142850 Sobic006G142850 Sobic007G095700--Sobic006G142850 Sobic003G319050 Sobic003G319050 Sobic007G095700--Sobic003G319050 Sobic010G035000 Sobic010G035000 Sobic002G286800--Sobic010G035000 Sobic002G286800--Sobic007G199500 Sobic001G297700 Sobic001G297700 Sobic002G286800--Sobic001G297700 Sobic007G131100 Sobic007G131100 Sobic002G286800--Sobic007G131100 Sobic006G105300 Sobic006G105300 Sobic002G286800--Sobic006G105300 Sobic005G184500 Sobic005G184500 Sobic002G286800--Sobic005G184500 Sobic005G185400 Sobic005G185400 Sobic002G286800--Sobic005G185400 Sobic005G184400 Sobic005G184400 Sobic002G286800--Sobic005G184400 Sobic007G025100 Sobic007G025100 Sobic002G286800--Sobic007G025100 Sobic010G207900 Sobic010G207900 Sobic007G126000--Sobic010G207900 Sobic006G018751 Sobic006G018751 Sobic007G126000--Sobic006G018751 Sobic007G126000--Sobic004G322901 Sobic009G056100 Sobic009G056100 Sobic007G126000--Sobic009G056100 Sobic005G083280 Sobic005G083280 Sobic007G126000--Sobic005G083280 Sobic007G126000--Sobic002G286800 Sobic007G086701 Sobic007G086701 Sobic007G126000--Sobic007G086701 Sobic009G202200 Sobic009G202200 Sobic007G126000--Sobic009G202200 Sobic007G126000--Sobic001G371600 Sobic002G097100 Sobic002G097100 Sobic007G199500--Sobic002G097100 Sobic007G199500--Sobic003G319050 Sobic007G199500--Sobic001G297700 Sobic002G015500 Sobic002G015500 Sobic007G199500--Sobic002G015500 Sobic002G300900 Sobic002G300900 Sobic007G199500--Sobic002G300900 Sobic001G495700 Sobic001G495700 Sobic007G199500--Sobic001G495700 Sobic004G071100 Sobic004G071100 Sobic007G199500--Sobic004G071100 Sobic009G057100 Sobic009G057100 Sobic007G199500--Sobic009G057100 Sobic002G007300 Sobic002G007300 Sobic007G199500--Sobic002G007300 Sobic005G082300 Sobic005G082300 Sobic001G371600--Sobic005G082300 Sobic002G172200 Sobic002G172200 Sobic001G371600--Sobic002G172200 Sobic005G147500 Sobic005G147500 Sobic001G371600--Sobic005G147500 Sobic002G172100 Sobic002G172100 Sobic001G371600--Sobic002G172100 Sobic001G371600--Sobic009G057100 Sobic009G058300 Sobic009G058300 Sobic001G371600--Sobic009G058300 Sobic001G284700 Sobic001G284700 Sobic001G371600--Sobic001G284700 Sobic006G264800 Sobic006G264800 Sobic001G371600--Sobic006G264800 Sobic005G188800 Sobic005G188800 Sobic001G371600--Sobic005G188800 Sobic005G227151 Sobic005G227151 Sobic003G099900--Sobic005G227151 Sobic002G105900 Sobic002G105900 Sobic003G099900--Sobic002G105900 Sobic004G207500 Sobic004G207500 Sobic003G099900--Sobic004G207500 Sobic007G196100 Sobic007G196100 Sobic003G099900--Sobic007G196100 Sobic003G326300 Sobic003G326300 Sobic003G099900--Sobic003G326300 Sobic003G099900--Sobic006G142850 Sobic005G186250 Sobic005G186250 Sobic003G099900--Sobic005G186250 Sobic005G189000 Sobic005G189000 Sobic003G099900--Sobic005G189000 Sobic009G007100 Sobic009G007100 Sobic003G099900--Sobic009G007100 Sobic004G322901--Sobic005G083280 Sobic001G261529 Sobic001G261529 Sobic004G322901--Sobic001G261529 Sobic003G092600 Sobic003G092600 Sobic004G322901--Sobic003G092600 Sobic009G014900 Sobic009G014900 Sobic004G322901--Sobic009G014900 Sobic006G015800 Sobic006G015800 Sobic004G322901--Sobic006G015800 Sobic004G322901--Sobic007G126000 Sobic002G147466 Sobic002G147466 Sobic004G322901--Sobic002G147466 Sobic004G322901--Sobic006G018751 Sobic002G015800 Sobic002G015800 Sobic004G322901--Sobic002G015800 Sobic006G081400 Sobic006G081400 Sobic004G029800--Sobic006G081400 Sobic004G029800--Sobic005G188800 Sobic004G029800--Sobic005G185400 Sobic004G029800--Sobic005G147500 Sobic004G029800--Sobic009G057100 Sobic005G033400 Sobic005G033400 Sobic004G029800--Sobic005G033400 Sobic003G294800 Sobic003G294800 Sobic004G029800--Sobic003G294800 Sobic004G029800--Sobic005G184500 Sobic004G029800--Sobic004G071100 Sobic007G049000 Sobic007G049000 Sobic006G142850--Sobic007G049000 Sobic005G184600 Sobic005G184600 Sobic006G142850--Sobic005G184600 Sobic006G142850--Sobic005G184400 Sobic006G142850--Sobic005G186250 Sobic006G142850--Sobic006G105300 Sobic006G142850--Sobic009G007100 Sobic006G142850--Sobic010G035000 Sobic006G142850--Sobic004G207500 Sobic006G142850--Sobic005G184500 Sobic003G319050--Sobic002G097100 Sobic003G319050--Sobic002G007300 Sobic003G319050--Sobic001G297700 Sobic003G319050--Sobic007G199500 Sobic003G319050--Sobic004G071100 Sobic003G319050--Sobic006G105300 Sobic008G184500 Sobic008G184500 Sobic003G319050--Sobic008G184500 Sobic003G319050--Sobic002G015500 Sobic004G029700 Sobic004G029700 Sobic003G319050--Sobic004G029700
Octagon: transcription factors


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