Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G126000.1,Sobic.007G126000.2,Sobic.007G126000.4,Sobic.007G126000.3
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R9H4 , A0A1B6PHT2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G207900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@prenyltransferase, putative, expressed K09833: HPT, HGGT, homogentisate phytyltransferase / homogentisate geranylgeranyltransferase
2 Sobic.006G018751 - -
3 Sobic.004G322901 - -
4 Sobic.009G056100 splicing factor, arginine/serine-rich, putative, expressed -
5 Sobic.005G083280 - -
6 Sobic.002G286800 MATE efflux protein, putative, expressed -
7 Sobic.007G086701 - -
8 Sobic.009G202200 expressed protein -
9 Sobic.001G371600 - -
10 Sobic.002G174500 OsFBX252 - F-box domain containing protein, expressed -
11 Sobic.003G099900 expressed protein -
12 Sobic.001G261529 - -
13 Sobic.006G015800 "1,4-alpha-glucan branching enzyme/starch branching enzyme II, PULLULANASE 1, CHLOROPLASTIC"(PubMedID : 21853065)@Alpha amylase, catalytic domain containing protein, expressed -
14 Sobic.007G199500 MBTB30 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
15 Sobic.002G147466 - -
16 Sobic.006G142850 - -
17 Sobic.005G082300 - -
18 Sobic.009G014900 expressed protein -
19 Sobic.006G105300 expressed protein -
20 Sobic.007G095700 Brix domain containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G126000 Sobic007G126000 Sobic010G207900 Sobic010G207900 Sobic007G126000--Sobic010G207900 Sobic006G018751 Sobic006G018751 Sobic007G126000--Sobic006G018751 Sobic004G322901 Sobic004G322901 Sobic007G126000--Sobic004G322901 Sobic009G056100 Sobic009G056100 Sobic007G126000--Sobic009G056100 Sobic005G083280 Sobic005G083280 Sobic007G126000--Sobic005G083280 Sobic002G286800 Sobic002G286800 Sobic007G126000--Sobic002G286800 Sobic007G086701 Sobic007G086701 Sobic007G126000--Sobic007G086701 Sobic009G202200 Sobic009G202200 Sobic007G126000--Sobic009G202200 Sobic001G371600 Sobic001G371600 Sobic007G126000--Sobic001G371600 Sobic010G207900--Sobic006G018751 Sobic010G207900--Sobic007G086701 Sobic010G207900--Sobic007G126000 Sobic001G264600 Sobic001G264600 Sobic010G207900--Sobic001G264600 Sobic010G207900--Sobic004G322901 Sobic002G174500 Sobic002G174500 Sobic010G207900--Sobic002G174500 Sobic010G207900--Sobic009G056100 Sobic010G207900--Sobic005G083280 Sobic001G261529 Sobic001G261529 Sobic010G207900--Sobic001G261529 Sobic006G018751--Sobic007G086701 Sobic006G018751--Sobic010G207900 Sobic006G018751--Sobic001G264600 Sobic006G018751--Sobic001G261529 Sobic006G018751--Sobic005G083280 Sobic006G018751--Sobic007G126000 Sobic006G018751--Sobic004G322901 Sobic002G266600 Sobic002G266600 Sobic006G018751--Sobic002G266600 Sobic002G066700 Sobic002G066700 Sobic006G018751--Sobic002G066700 Sobic004G322901--Sobic005G083280 Sobic004G322901--Sobic001G261529 Sobic003G092600 Sobic003G092600 Sobic004G322901--Sobic003G092600 Sobic009G014900 Sobic009G014900 Sobic004G322901--Sobic009G014900 Sobic006G015800 Sobic006G015800 Sobic004G322901--Sobic006G015800 Sobic004G322901--Sobic007G126000 Sobic002G147466 Sobic002G147466 Sobic004G322901--Sobic002G147466 Sobic004G322901--Sobic006G018751 Sobic002G015800 Sobic002G015800 Sobic004G322901--Sobic002G015800 Sobic009G056100--Sobic007G126000 Sobic009G056100--Sobic010G207900 Sobic002G358000 Sobic002G358000 Sobic009G056100--Sobic002G358000 Sobic009G056100--Sobic002G286800 Sobic003G099900 Sobic003G099900 Sobic009G056100--Sobic003G099900 Sobic007G131100 Sobic007G131100 Sobic009G056100--Sobic007G131100 Sobic008G082300 Sobic008G082300 Sobic009G056100--Sobic008G082300 Sobic008G188200 Sobic008G188200 Sobic009G056100--Sobic008G188200 Sobic008G064100 Sobic008G064100 Sobic009G056100--Sobic008G064100 Sobic005G083280--Sobic001G261529 Sobic005G083280--Sobic004G322901 Sobic005G083280--Sobic003G092600 Sobic005G083280--Sobic002G015800 Sobic005G083280--Sobic001G264600 Sobic005G083280--Sobic006G018751 Sobic005G083280--Sobic006G015800 Sobic005G083280--Sobic007G086701 Sobic005G083280--Sobic009G014900 Sobic010G035000 Sobic010G035000 Sobic002G286800--Sobic010G035000 Sobic007G199500 Sobic007G199500 Sobic002G286800--Sobic007G199500 Sobic001G297700 Sobic001G297700 Sobic002G286800--Sobic001G297700 Sobic002G286800--Sobic007G131100 Sobic006G105300 Sobic006G105300 Sobic002G286800--Sobic006G105300 Sobic005G184500 Sobic005G184500 Sobic002G286800--Sobic005G184500 Sobic005G185400 Sobic005G185400 Sobic002G286800--Sobic005G185400 Sobic005G184400 Sobic005G184400 Sobic002G286800--Sobic005G184400 Sobic007G025100 Sobic007G025100 Sobic002G286800--Sobic007G025100 Sobic007G086701--Sobic006G018751 Sobic007G086701--Sobic001G264600 Sobic007G086701--Sobic002G266600 Sobic007G086701--Sobic010G207900 Sobic007G086701--Sobic001G261529 Sobic007G086701--Sobic002G066700 Sobic007G086701--Sobic005G083280 Sobic007G086701--Sobic004G322901 Sobic002G099866 Sobic002G099866 Sobic007G086701--Sobic002G099866 Sobic009G202200--Sobic005G185400 Sobic009G202200--Sobic005G184500 Sobic005G184600 Sobic005G184600 Sobic009G202200--Sobic005G184600 Sobic009G202200--Sobic005G184400 Sobic001G225000 Sobic001G225000 Sobic009G202200--Sobic001G225000 Sobic006G142850 Sobic006G142850 Sobic009G202200--Sobic006G142850 Sobic007G049000 Sobic007G049000 Sobic009G202200--Sobic007G049000 Sobic009G202200--Sobic006G105300 Sobic006G081400 Sobic006G081400 Sobic009G202200--Sobic006G081400 Sobic005G082300 Sobic005G082300 Sobic001G371600--Sobic005G082300 Sobic002G172200 Sobic002G172200 Sobic001G371600--Sobic002G172200 Sobic005G147500 Sobic005G147500 Sobic001G371600--Sobic005G147500 Sobic002G172100 Sobic002G172100 Sobic001G371600--Sobic002G172100 Sobic009G057100 Sobic009G057100 Sobic001G371600--Sobic009G057100 Sobic009G058300 Sobic009G058300 Sobic001G371600--Sobic009G058300 Sobic001G284700 Sobic001G284700 Sobic001G371600--Sobic001G284700 Sobic006G264800 Sobic006G264800 Sobic001G371600--Sobic006G264800 Sobic005G188800 Sobic005G188800 Sobic001G371600--Sobic005G188800
Octagon: transcription factors


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