Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G014900.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6P5T8
Pfam -
Panther DB PTHR33065 PTHR33065:SF10
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g54759.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.009G014900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G092600 seven in absentia protein family protein, expressed -
2 Sobic.004G322901 - -
3 Sobic.002G147466 - -
4 Sobic.003G325800 ATP-binding region, ATPase-like domain containing protein, expressed -
5 Sobic.006G015800 "1,4-alpha-glucan branching enzyme/starch branching enzyme II, PULLULANASE 1, CHLOROPLASTIC"(PubMedID : 21853065)@Alpha amylase, catalytic domain containing protein, expressed -
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7 Sobic.005G083280 - -
8 Sobic.002G267700 bZIP family transcription factor, putative, expressed -
9 Sobic.003G091500 expressed protein -
10 Sobic.008G184100 aspartic proteinase, putative, expressed -
11 Sobic.008G031400 OsSub63 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
12 Sobic.001G371600 - -
13 Sobic.003G214650 - -
14 Sobic.002G015800 OsFBD13 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
15 Sobic.008G088900 hypothetical protein -
16 Sobic.002G108300 expressed protein -
17 Sobic.008G164101 - -
18 Sobic.001G489075 - -
19 Sobic.005G174200 - -
20 Sobic.003G207100 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic009G014900 Sobic009G014900 Sobic003G092600 Sobic003G092600 Sobic009G014900--Sobic003G092600 Sobic004G322901 Sobic004G322901 Sobic009G014900--Sobic004G322901 Sobic002G147466 Sobic002G147466 Sobic009G014900--Sobic002G147466 Sobic003G325800 Sobic003G325800 Sobic009G014900--Sobic003G325800 Sobic006G015800 Sobic006G015800 Sobic009G014900--Sobic006G015800 Sobic003G414000 Sobic003G414000 Sobic009G014900--Sobic003G414000 Sobic005G083280 Sobic005G083280 Sobic009G014900--Sobic005G083280 Sobic002G267700 Sobic002G267700 Sobic009G014900--Sobic002G267700 Sobic003G091500 Sobic003G091500 Sobic009G014900--Sobic003G091500 Sobic002G015800 Sobic002G015800 Sobic003G092600--Sobic002G015800 Sobic003G092600--Sobic005G083280 Sobic001G261529 Sobic001G261529 Sobic003G092600--Sobic001G261529 Sobic003G092600--Sobic004G322901 Sobic003G092600--Sobic009G014900 Sobic003G092600--Sobic006G015800 Sobic004G262100 Sobic004G262100 Sobic003G092600--Sobic004G262100 Sobic001G324800 Sobic001G324800 Sobic003G092600--Sobic001G324800 Sobic001G509100 Sobic001G509100 Sobic003G092600--Sobic001G509100 Sobic004G322901--Sobic005G083280 Sobic004G322901--Sobic001G261529 Sobic004G322901--Sobic003G092600 Sobic004G322901--Sobic009G014900 Sobic004G322901--Sobic006G015800 Sobic007G126000 Sobic007G126000 Sobic004G322901--Sobic007G126000 Sobic004G322901--Sobic002G147466 Sobic006G018751 Sobic006G018751 Sobic004G322901--Sobic006G018751 Sobic004G322901--Sobic002G015800 Sobic005G124400 Sobic005G124400 Sobic002G147466--Sobic005G124400 Sobic002G147466--Sobic009G014900 Sobic002G147466--Sobic004G322901 Sobic003G211600 Sobic003G211600 Sobic002G147466--Sobic003G211600 Sobic002G174500 Sobic002G174500 Sobic002G147466--Sobic002G174500 Sobic005G174200 Sobic005G174200 Sobic002G147466--Sobic005G174200 Sobic007G032500 Sobic007G032500 Sobic002G147466--Sobic007G032500 Sobic001G374600 Sobic001G374600 Sobic002G147466--Sobic001G374600 Sobic009G062300 Sobic009G062300 Sobic002G147466--Sobic009G062300 Sobic008G031400 Sobic008G031400 Sobic003G325800--Sobic008G031400 Sobic001G511400 Sobic001G511400 Sobic003G325800--Sobic001G511400 Sobic001G284700 Sobic001G284700 Sobic003G325800--Sobic001G284700 Sobic002G172200 Sobic002G172200 Sobic003G325800--Sobic002G172200 Sobic008G159300 Sobic008G159300 Sobic003G325800--Sobic008G159300 Sobic002G172100 Sobic002G172100 Sobic003G325800--Sobic002G172100 Sobic003G325800--Sobic003G414000 Sobic002G015400 Sobic002G015400 Sobic003G325800--Sobic002G015400 Sobic005G082300 Sobic005G082300 Sobic003G325800--Sobic005G082300 Sobic006G015800--Sobic003G092600 Sobic004G212350 Sobic004G212350 Sobic006G015800--Sobic004G212350 Sobic006G015800--Sobic005G082300 Sobic006G015800--Sobic002G172200 Sobic002G100000 Sobic002G100000 Sobic006G015800--Sobic002G100000 Sobic006G015800--Sobic004G322901 Sobic001G371600 Sobic001G371600 Sobic006G015800--Sobic001G371600 Sobic005G032500 Sobic005G032500 Sobic006G015800--Sobic005G032500 Sobic001G489075 Sobic001G489075 Sobic006G015800--Sobic001G489075 Sobic005G174000 Sobic005G174000 Sobic003G414000--Sobic005G174000 Sobic004G171600 Sobic004G171600 Sobic003G414000--Sobic004G171600 Sobic001G200900 Sobic001G200900 Sobic003G414000--Sobic001G200900 Sobic003G414000--Sobic008G031400 Sobic008G184100 Sobic008G184100 Sobic003G414000--Sobic008G184100 Sobic003G414000--Sobic003G091500 Sobic008G088900 Sobic008G088900 Sobic003G414000--Sobic008G088900 Sobic005G077900 Sobic005G077900 Sobic003G414000--Sobic005G077900 Sobic003G414000--Sobic001G489075 Sobic005G083280--Sobic001G261529 Sobic005G083280--Sobic004G322901 Sobic005G083280--Sobic003G092600 Sobic005G083280--Sobic002G015800 Sobic001G264600 Sobic001G264600 Sobic005G083280--Sobic001G264600 Sobic005G083280--Sobic006G018751 Sobic005G083280--Sobic006G015800 Sobic007G086701 Sobic007G086701 Sobic005G083280--Sobic007G086701 Sobic005G083280--Sobic009G014900 Sobic005G033600 Sobic005G033600 Sobic002G267700--Sobic005G033600 Sobic006G070830 Sobic006G070830 Sobic002G267700--Sobic006G070830 Sobic002G267700--Sobic008G031400 Sobic006G031000 Sobic006G031000 Sobic002G267700--Sobic006G031000 Sobic005G174500 Sobic005G174500 Sobic002G267700--Sobic005G174500 Sobic002G089500 Sobic002G089500 Sobic002G267700--Sobic002G089500 Sobic002G267700--Sobic005G032500 Sobic002G267700--Sobic003G091500 Sobic006G117300 Sobic006G117300 Sobic002G267700--Sobic006G117300 Sobic003G091500--Sobic008G184100 Sobic003G091500--Sobic008G088900 Sobic002G108300 Sobic002G108300 Sobic003G091500--Sobic002G108300 Sobic002G007700 Sobic002G007700 Sobic003G091500--Sobic002G007700 Sobic003G091500--Sobic004G171600 Sobic003G207100 Sobic003G207100 Sobic003G091500--Sobic003G207100 Sobic001G233600 Sobic001G233600 Sobic003G091500--Sobic001G233600 Sobic003G091500--Sobic008G031400 Sobic003G091500--Sobic005G077900
Octagon: transcription factors


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