Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G164101.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R6Z8
Pfam -
Panther DB PTHR33207 PTHR33207:SF5
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g36920.1 : OsFBX255 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G302200 expressed protein -
2 Sobic.003G211600 - -
3 Sobic.007G066200 - -
4 Sobic.005G226800 pumilio-family RNA binding protein, putative, expressed K17943: pumilio RNA-binding family
5 Sobic.005G033600 heavy-metal-associated domain-containing protein, putative, expressed -
6 Sobic.005G173900 - -
7 Sobic.001G374600 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence./early senescence marker (common during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence)"(PubMedID : 27586543)@desiccation-related protein PCC13-62 precursor, putative, expressed -
8 Sobic.005G174200 - -
9 Sobic.005G198400 FHA domain containing protein, putative, expressed -
10 Sobic.009G062300 BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1-associated receptor kinase 1 precursor, putative, expressed -
11 Sobic.007G032500 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K11462: polycomb protein EED
12 Sobic.006G070830 - K01193: INV, beta-fructofuranosidase
13 Sobic.001G269650 - -
14 Sobic.008G037100 expressed protein -
15 Sobic.001G495700 Core histone H2A/H2B/H3/H4 domain containing protein, putative, expressed K11251: histone H2A
16 Sobic.007G040000 - -
17 Sobic.003G091500 expressed protein -
18 Sobic.008G184100 aspartic proteinase, putative, expressed -
19 Sobic.005G174500 - -
20 Sobic.002G267700 bZIP family transcription factor, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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