Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G325800.1,Sobic.003G325800.2
Synonym Sb03g037180
Functional annotation ATP-binding region, ATPase-like domain containing protein, expressed
UniProt A0A1W0VZZ7 , A0A1B6Q6L0
Pfam PF13589
Panther DB PTHR23336:SF2 PTHR23336 PTHR23336 PTHR23336:SF2
NCBI CDD KOG1845; MORC family ATPases
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G19100 : Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g26830.1 : ATP-binding region, ATPase-like domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a039848 , Zm00025a027190
Brachypodium PNT73036 , KQK10180 , PNT73037
Barley -
Wheat TraesCS3D02G322900 , TraesCS3B02G359600 , TraesCS3A02G329400
Populus -


JBrowse

Open New Page


cDNA sequences
Sobic.003G325800


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G031400 OsSub63 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
2 Sobic.001G511400 BES1/BZR1 homolog protein, putative, expressed -
3 Sobic.001G284700 - -
4 Sobic.002G172200 receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed -
5 Sobic.008G159300 KUN1 - Kunitz-type trypsin inhibitor precursor, expressed -
6 Sobic.002G172100 receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed -
7 Sobic.003G414000 OsFBX1 - F-box domain containing protein, expressed -
8 Sobic.002G015400 OsFBD13 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
9 Sobic.005G082300 - -
10 Sobic.001G489075 - -
11 Sobic.009G058300 expressed protein -
12 Sobic.002G058900 OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed -
13 Sobic.007G037200 expressed protein -
14 Sobic.002G108300 expressed protein -
15 Sobic.009G112200 OsFBX361 - F-box domain containing protein, expressed -
16 Sobic.008G184100 aspartic proteinase, putative, expressed -
17 Sobic.003G091500 expressed protein -
18 Sobic.006G264800 GASR6 - Gibberellin-regulated GASA/GAST/Snakin family protein precursor, expressed -
19 Sobic.003G266100 ESP4, putative, expressed K06100: symplekin
20 Sobic.003G106400 3-beta-hydroxysteroid-Delta-isomerase, putative, expressed K01824: cholestenol Delta-isomerase


Gene co-expression network
sample Sobic003G325800 Sobic003G325800 Sobic008G031400 Sobic008G031400 Sobic003G325800--Sobic008G031400 Sobic001G511400 Sobic001G511400 Sobic003G325800--Sobic001G511400 Sobic001G284700 Sobic001G284700 Sobic003G325800--Sobic001G284700 Sobic002G172200 Sobic002G172200 Sobic003G325800--Sobic002G172200 Sobic008G159300 Sobic008G159300 Sobic003G325800--Sobic008G159300 Sobic002G172100 Sobic002G172100 Sobic003G325800--Sobic002G172100 Sobic003G414000 Sobic003G414000 Sobic003G325800--Sobic003G414000 Sobic002G015400 Sobic002G015400 Sobic003G325800--Sobic002G015400 Sobic005G082300 Sobic005G082300 Sobic003G325800--Sobic005G082300 Sobic008G184100 Sobic008G184100 Sobic008G031400--Sobic008G184100 Sobic003G091500 Sobic003G091500 Sobic008G031400--Sobic003G091500 Sobic005G032500 Sobic005G032500 Sobic008G031400--Sobic005G032500 Sobic008G088900 Sobic008G088900 Sobic008G031400--Sobic008G088900 Sobic007G037200 Sobic007G037200 Sobic008G031400--Sobic007G037200 Sobic001G489075 Sobic001G489075 Sobic008G031400--Sobic001G489075 Sobic004G171600 Sobic004G171600 Sobic008G031400--Sobic004G171600 Sobic002G108300 Sobic002G108300 Sobic008G031400--Sobic002G108300 Sobic002G293100 Sobic002G293100 Sobic008G031400--Sobic002G293100 Sobic001G511400--Sobic002G015400 Sobic001G511400--Sobic002G172200 Sobic001G511400--Sobic008G159300 Sobic001G511400--Sobic002G172100 Sobic003G266100 Sobic003G266100 Sobic001G511400--Sobic003G266100 Sobic005G147500 Sobic005G147500 Sobic001G511400--Sobic005G147500 Sobic001G511400--Sobic001G284700 Sobic009G058300 Sobic009G058300 Sobic001G511400--Sobic009G058300 Sobic001G511400--Sobic005G082300 Sobic001G284700--Sobic005G147500 Sobic001G284700--Sobic009G058300 Sobic001G284700--Sobic002G172100 Sobic006G264800 Sobic006G264800 Sobic001G284700--Sobic006G264800 Sobic009G057100 Sobic009G057100 Sobic001G284700--Sobic009G057100 Sobic001G284700--Sobic001G511400 Sobic003G294800 Sobic003G294800 Sobic001G284700--Sobic003G294800 Sobic009G112200 Sobic009G112200 Sobic001G284700--Sobic009G112200 Sobic005G188800 Sobic005G188800 Sobic001G284700--Sobic005G188800 Sobic002G172200--Sobic005G082300 Sobic002G172200--Sobic002G172100 Sobic002G172200--Sobic003G266100 Sobic002G172200--Sobic001G511400 Sobic002G172200--Sobic003G294800 Sobic002G172200--Sobic005G147500 Sobic002G172200--Sobic002G015400 Sobic002G172200--Sobic005G188800 Sobic002G172200--Sobic001G284700 Sobic008G159300--Sobic002G015400 Sobic002G058900 Sobic002G058900 Sobic008G159300--Sobic002G058900 Sobic008G159300--Sobic001G511400 Sobic008G159300--Sobic003G266100 Sobic008G159300--Sobic007G037200 Sobic008G159300--Sobic005G032500 Sobic008G159300--Sobic002G172200 Sobic008G159300--Sobic002G172100 Sobic004G220900 Sobic004G220900 Sobic008G159300--Sobic004G220900 Sobic002G172100--Sobic003G294800 Sobic002G172100--Sobic006G264800 Sobic002G172100--Sobic002G172200 Sobic002G172100--Sobic005G147500 Sobic002G172100--Sobic005G082300 Sobic002G172100--Sobic003G266100 Sobic002G172100--Sobic009G058300 Sobic002G172100--Sobic001G284700 Sobic001G274025 Sobic001G274025 Sobic002G172100--Sobic001G274025 Sobic005G174000 Sobic005G174000 Sobic003G414000--Sobic005G174000 Sobic003G414000--Sobic004G171600 Sobic001G200900 Sobic001G200900 Sobic003G414000--Sobic001G200900 Sobic003G414000--Sobic008G031400 Sobic003G414000--Sobic008G184100 Sobic003G414000--Sobic003G091500 Sobic003G414000--Sobic008G088900 Sobic005G077900 Sobic005G077900 Sobic003G414000--Sobic005G077900 Sobic003G414000--Sobic001G489075 Sobic002G015400--Sobic008G159300 Sobic002G015400--Sobic001G511400 Sobic002G015400--Sobic003G266100 Sobic002G015400--Sobic002G172200 Sobic002G015400--Sobic002G172100 Sobic002G015400--Sobic002G058900 Sobic002G015400--Sobic009G058300 Sobic001G495700 Sobic001G495700 Sobic002G015400--Sobic001G495700 Sobic002G059500 Sobic002G059500 Sobic002G015400--Sobic002G059500 Sobic005G082300--Sobic002G172200 Sobic005G082300--Sobic003G294800 Sobic005G082300--Sobic002G172100 Sobic005G082300--Sobic005G188800 Sobic005G082300--Sobic003G266100 Sobic005G082300--Sobic005G147500 Sobic005G082300--Sobic001G511400 Sobic005G082300--Sobic009G057100 Sobic006G081400 Sobic006G081400 Sobic005G082300--Sobic006G081400
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.