Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G053000.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PFQ8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


cDNA sequences
Sobic.007G053000


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G020400 - -
2 Sobic.009G168700 ammonium transporter protein, putative, expressed K03320: amt, AMT, ammonium transporter, Amt family
3 Sobic.009G066850 - -
4 Sobic.008G085600 - -
5 Sobic.001G084200 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase domain containing protein, expressed -
6 Sobic.003G051300 expressed protein -
7 Sobic.001G192750 - -
8 Sobic.003G291050 - -
9 Sobic.002G057550 - -
10 Sobic.010G158601 - -
11 Sobic.002G302400 SAM dependent carboxyl methyltransferase, putative, expressed -
12 Sobic.007G154901 - K01674: carbonic anhydrase
13 Sobic.005G082950 - -
14 Sobic.008G032850 - -
15 Sobic.004G067850 - -
16 Sobic.003G141550 - -
17 Sobic.008G192100 Up-reguralion under drought(PubMedID : 24916767)@Up-reguralion under combine stress of drought and heat(PubMedID : 24916767)@expressed protein -
18 Sobic.005G129748 - -
19 Sobic.006G138966 - -
20 Sobic.004G082200 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, FKBP-type, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G053000 Sobic007G053000 Sobic008G020400 Sobic008G020400 Sobic007G053000--Sobic008G020400 Sobic009G168700 Sobic009G168700 Sobic007G053000--Sobic009G168700 Sobic009G066850 Sobic009G066850 Sobic007G053000--Sobic009G066850 Sobic008G085600 Sobic008G085600 Sobic007G053000--Sobic008G085600 Sobic001G084200 Sobic001G084200 Sobic007G053000--Sobic001G084200 Sobic003G051300 Sobic003G051300 Sobic007G053000--Sobic003G051300 Sobic001G192750 Sobic001G192750 Sobic007G053000--Sobic001G192750 Sobic003G291050 Sobic003G291050 Sobic007G053000--Sobic003G291050 Sobic002G057550 Sobic002G057550 Sobic007G053000--Sobic002G057550 Sobic008G020400--Sobic003G051300 Sobic001G267400 Sobic001G267400 Sobic008G020400--Sobic001G267400 Sobic008G020400--Sobic003G291050 Sobic008G020400--Sobic008G085600 Sobic004G082200 Sobic004G082200 Sobic008G020400--Sobic004G082200 Sobic008G020400--Sobic007G053000 Sobic007G154901 Sobic007G154901 Sobic008G020400--Sobic007G154901 Sobic008G020400--Sobic009G066850 Sobic008G020400--Sobic002G057550 Sobic009G168700--Sobic001G084200 Sobic002G302400 Sobic002G302400 Sobic009G168700--Sobic002G302400 Sobic008G192100 Sobic008G192100 Sobic009G168700--Sobic008G192100 Sobic005G082950 Sobic005G082950 Sobic009G168700--Sobic005G082950 Sobic010G021600 Sobic010G021600 Sobic009G168700--Sobic010G021600 Sobic008G032850 Sobic008G032850 Sobic009G168700--Sobic008G032850 Sobic004G048600 Sobic004G048600 Sobic009G168700--Sobic004G048600 Sobic004G067850 Sobic004G067850 Sobic009G168700--Sobic004G067850 SobicK042700 SobicK042700 Sobic009G168700--SobicK042700 Sobic009G066850--Sobic002G057550 Sobic009G066850--Sobic002G302400 Sobic009G066850--Sobic008G192100 Sobic007G100275 Sobic007G100275 Sobic009G066850--Sobic007G100275 Sobic009G147100 Sobic009G147100 Sobic009G066850--Sobic009G147100 Sobic009G066850--Sobic009G168700 Sobic009G150100 Sobic009G150100 Sobic009G066850--Sobic009G150100 Sobic009G066850--SobicK042700 Sobic003G091100 Sobic003G091100 Sobic009G066850--Sobic003G091100 Sobic002G342200 Sobic002G342200 Sobic008G085600--Sobic002G342200 Sobic008G085600--Sobic009G066850 Sobic008G085600--Sobic009G147100 Sobic008G085600--Sobic004G048600 Sobic008G085600--Sobic003G291050 Sobic008G085600--Sobic002G302400 Sobic010G158601 Sobic010G158601 Sobic008G085600--Sobic010G158601 Sobic010G262650 Sobic010G262650 Sobic008G085600--Sobic010G262650 Sobic008G085600--Sobic007G100275 Sobic001G084200--Sobic009G168700 Sobic001G084200--Sobic004G067850 Sobic001G084200--Sobic008G032850 Sobic006G178200 Sobic006G178200 Sobic001G084200--Sobic006G178200 Sobic001G084200--Sobic002G302400 Sobic001G084200--Sobic008G192100 Sobic001G084200--Sobic005G082950 Sobic001G084200--Sobic004G048600 Sobic001G272300 Sobic001G272300 Sobic001G084200--Sobic001G272300 Sobic003G051300--Sobic004G082200 Sobic007G075200 Sobic007G075200 Sobic003G051300--Sobic007G075200 Sobic003G051300--Sobic007G154901 Sobic001G530650 Sobic001G530650 Sobic003G051300--Sobic001G530650 Sobic001G497750 Sobic001G497750 Sobic003G051300--Sobic001G497750 Sobic007G005800 Sobic007G005800 Sobic003G051300--Sobic007G005800 Sobic003G049100 Sobic003G049100 Sobic003G051300--Sobic003G049100 Sobic003G051300--Sobic003G091100 Sobic006G018500 Sobic006G018500 Sobic003G051300--Sobic006G018500 Sobic001G192750--Sobic009G066850 Sobic001G192750--Sobic004G067850 Sobic001G192750--Sobic008G032850 Sobic001G192750--Sobic001G084200 Sobic001G192750--Sobic009G168700 Sobic006G138966 Sobic006G138966 Sobic001G192750--Sobic006G138966 Sobic001G192750--Sobic002G302400 Sobic001G192750--Sobic008G192100 Sobic001G192750--Sobic001G272300 Sobic003G291050--Sobic002G057550 Sobic003G291050--Sobic004G048600 Sobic001G452400 Sobic001G452400 Sobic003G291050--Sobic001G452400 Sobic002G380750 Sobic002G380750 Sobic003G291050--Sobic002G380750 Sobic005G156800 Sobic005G156800 Sobic003G291050--Sobic005G156800 Sobic003G291050--Sobic002G302400 Sobic003G291050--Sobic008G192100 Sobic003G291050--Sobic001G272300 Sobic002G057550--Sobic003G291050 Sobic002G057550--Sobic002G302400 Sobic002G057550--Sobic001G272300
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.