Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G088600.1
Synonym Sb07g007720
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YJH6
Pfam -
Panther DB PTHR34130 PTHR34130:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g14600.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a054990 , Zm00025a030939
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


cDNA sequences
Sobic.007G088600


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G115200 - -
2 Sobic.002G142550 - -
3 Sobic.005G107250 - -
4 Sobic.010G165925 - -
5 Sobic.010G116200 bZIP transcription factor domain containing protein, expressed -
6 Sobic.005G019650 - -
7 Sobic.010G236950 - -
8 Sobic.007G003250 - -
9 Sobic.010G180300 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
10 Sobic.001G369701 - -
11 Sobic.001G310400 expressed protein -
12 Sobic.006G185150 - -
13 Sobic.006G024101 - -
14 Sobic.003G025500 ZOS8-02 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
15 Sobic.003G294550 - -
16 Sobic.001G519500 - -
17 Sobic.005G217400 AP2 domain containing protein, expressed -
18 Sobic.010G263051 - -
19 Sobic.008G135401 - -
20 Sobic.003G193400 TKL_IRAK_DUF26-la.4 - DUF26 kinases have homology to DUF26 containing loci, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G088600 Sobic007G088600 Sobic001G115200 Sobic001G115200 Sobic007G088600--Sobic001G115200 Sobic002G142550 Sobic002G142550 Sobic007G088600--Sobic002G142550 Sobic005G107250 Sobic005G107250 Sobic007G088600--Sobic005G107250 Sobic010G165925 Sobic010G165925 Sobic007G088600--Sobic010G165925 Sobic010G116200 Sobic010G116200 Sobic007G088600--Sobic010G116200 Sobic005G019650 Sobic005G019650 Sobic007G088600--Sobic005G019650 Sobic010G236950 Sobic010G236950 Sobic007G088600--Sobic010G236950 Sobic007G003250 Sobic007G003250 Sobic007G088600--Sobic007G003250 Sobic010G180300 Sobic010G180300 Sobic007G088600--Sobic010G180300 Sobic001G115200--Sobic005G107250 Sobic001G115200--Sobic005G019650 Sobic001G115200--Sobic010G180300 Sobic006G185150 Sobic006G185150 Sobic001G115200--Sobic006G185150 Sobic006G024101 Sobic006G024101 Sobic001G115200--Sobic006G024101 Sobic001G115200--Sobic002G142550 Sobic003G294550 Sobic003G294550 Sobic001G115200--Sobic003G294550 Sobic001G369701 Sobic001G369701 Sobic001G115200--Sobic001G369701 Sobic010G263051 Sobic010G263051 Sobic001G115200--Sobic010G263051 Sobic002G142550--Sobic005G107250 Sobic002G142550--Sobic010G165925 Sobic002G142550--Sobic001G369701 Sobic002G142550--Sobic007G003250 Sobic002G142550--Sobic010G180300 Sobic002G142550--Sobic001G115200 Sobic002G142550--Sobic005G019650 Sobic003G025500 Sobic003G025500 Sobic002G142550--Sobic003G025500 Sobic002G142550--Sobic010G236950 Sobic005G107250--Sobic002G142550 Sobic005G107250--Sobic010G165925 Sobic005G107250--Sobic010G180300 Sobic005G107250--Sobic001G115200 Sobic005G107250--Sobic005G019650 Sobic005G107250--Sobic001G369701 Sobic005G107250--Sobic007G003250 Sobic005G107250--Sobic006G185150 Sobic005G107250--Sobic006G024101 Sobic010G165925--Sobic007G003250 Sobic010G165925--Sobic001G369701 Sobic010G165925--Sobic005G107250 Sobic010G165925--Sobic002G142550 Sobic006G196800 Sobic006G196800 Sobic010G165925--Sobic006G196800 Sobic010G165925--Sobic003G025500 Sobic010G165925--Sobic001G115200 Sobic010G165925--Sobic010G180300 Sobic010G263151 Sobic010G263151 Sobic010G165925--Sobic010G263151 Sobic010G116200--Sobic010G180300 Sobic010G116200--Sobic005G019650 Sobic010G116200--Sobic006G024101 Sobic010G116200--Sobic006G185150 Sobic010G116200--Sobic002G142550 Sobic010G116200--Sobic003G294550 Sobic010G116200--Sobic005G107250 Sobic008G135401 Sobic008G135401 Sobic010G116200--Sobic008G135401 Sobic001G310400 Sobic001G310400 Sobic010G116200--Sobic001G310400 Sobic005G019650--Sobic006G185150 Sobic005G019650--Sobic006G024101 Sobic005G019650--Sobic010G180300 Sobic005G019650--Sobic005G107250 Sobic005G019650--Sobic003G294550 Sobic005G019650--Sobic001G115200 Sobic005G019650--Sobic010G263051 Sobic005G019650--Sobic008G135401 Sobic004G300400 Sobic004G300400 Sobic005G019650--Sobic004G300400 Sobic010G236950--Sobic002G142550 Sobic010G236950--Sobic005G107250 Sobic010G236950--Sobic010G263051 Sobic010G236950--Sobic010G180300 Sobic010G236950--Sobic005G019650 Sobic010G236950--Sobic010G165925 Sobic010G236950--Sobic001G115200 Sobic010G236950--Sobic006G185150 Sobic010G236950--Sobic003G025500 Sobic007G003250--Sobic010G165925 Sobic007G003250--Sobic001G369701 Sobic007G003250--Sobic005G107250 Sobic007G003250--Sobic002G142550 Sobic007G003250--Sobic003G025500 Sobic007G003250--Sobic006G196800 Sobic007G003250--Sobic001G115200 Sobic007G003250--Sobic010G180300 Sobic007G003250--Sobic010G263151 Sobic010G180300--Sobic005G019650 Sobic010G180300--Sobic005G107250 Sobic010G180300--Sobic006G024101 Sobic010G180300--Sobic006G185150 Sobic010G180300--Sobic001G115200 Sobic010G180300--Sobic003G294550 Sobic010G180300--Sobic008G135401 Sobic010G180300--Sobic002G142550 Sobic010G180300--Sobic010G263051
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.