Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G103800.1
Synonym RPS2, Sb07g014210
Functional annotation Leucine Rich Repeat family protein, expressed
UniProt A0A1B6PH08
Pfam -
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF498
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G26090 : NB-ARC domain-containing disease resistance protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g08390.1 : Leucine Rich Repeat family protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK07721 , PNT71909
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G012800 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
2 Sobic.005G227050 - -
3 Sobic.009G134000 receptor-like protein kinase precursor, putative, expressed -
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5 Sobic.009G154100 expressed protein -
6 Sobic.005G130700 expressed protein -
7 Sobic.005G196500 embryogenesis transmembrane protein, putative, expressed -
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9 Sobic.005G209900 expressed protein -
10 Sobic.006G001400 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
11 Sobic.010G143300 carboxyl-terminal peptidase, putative, expressed -
12 Sobic.006G062300 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
13 Sobic.006G233600 Homologous to EPF/EPFL genes in Arabidopsis. Modelling of protein structure.(PubMedID : 23755192)@expressed protein -
14 Sobic.002G072700 carboxyl-terminal peptidase, putative, expressed -
15 Sobic.004G259101 - -
16 Sobic.003G277200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@IQ calmodulin-binding motif family protein, putative, expressed -
17 Sobic.002G201100 ZF-HD protein dimerisation region containing protein, expressed -
18 Sobic.002G315000 - -
19 Sobic.005G188500 expressed protein -
20 Sobic.010G107200 3-ketoacyl-CoA synthase, putative, expressed K15397: 3-ketoacyl-CoA synthase


Gene co-expression network
sample Sobic007G103800 Sobic007G103800 Sobic007G012800 Sobic007G012800 Sobic007G103800--Sobic007G012800 Sobic005G227050 Sobic005G227050 Sobic007G103800--Sobic005G227050 Sobic009G134000 Sobic009G134000 Sobic007G103800--Sobic009G134000 Sobic002G179700 Sobic002G179700 Sobic007G103800--Sobic002G179700 Sobic009G154100 Sobic009G154100 Sobic007G103800--Sobic009G154100 Sobic005G130700 Sobic005G130700 Sobic007G103800--Sobic005G130700 Sobic005G196500 Sobic005G196500 Sobic007G103800--Sobic005G196500 Sobic003G420800 Sobic003G420800 Sobic007G103800--Sobic003G420800 Sobic005G209900 Sobic005G209900 Sobic007G103800--Sobic005G209900 Sobic007G012800--Sobic005G209900 Sobic001G488400 Sobic001G488400 Sobic007G012800--Sobic001G488400 Sobic007G012800--Sobic009G154100 Sobic007G012800--Sobic009G134000 Sobic005G188500 Sobic005G188500 Sobic007G012800--Sobic005G188500 Sobic010G107200 Sobic010G107200 Sobic007G012800--Sobic010G107200 Sobic007G012800--Sobic007G103800 Sobic006G032800 Sobic006G032800 Sobic007G012800--Sobic006G032800 Sobic003G277200 Sobic003G277200 Sobic007G012800--Sobic003G277200 Sobic005G227050--Sobic005G209900 Sobic005G227050--Sobic005G196500 Sobic005G227050--Sobic009G154100 Sobic005G227050--Sobic002G179700 Sobic001G356400 Sobic001G356400 Sobic005G227050--Sobic001G356400 Sobic005G227050--Sobic010G107200 Sobic006G001400 Sobic006G001400 Sobic005G227050--Sobic006G001400 Sobic005G227050--Sobic007G103800 Sobic007G123200 Sobic007G123200 Sobic005G227050--Sobic007G123200 Sobic009G134000--Sobic007G012800 Sobic010G143300 Sobic010G143300 Sobic009G134000--Sobic010G143300 Sobic009G134000--Sobic009G154100 Sobic009G134000--Sobic003G277200 Sobic006G178800 Sobic006G178800 Sobic009G134000--Sobic006G178800 Sobic009G134000--Sobic010G107200 Sobic001G389600 Sobic001G389600 Sobic009G134000--Sobic001G389600 Sobic001G478100 Sobic001G478100 Sobic009G134000--Sobic001G478100 Sobic009G134000--Sobic005G130700 Sobic002G179700--Sobic009G154100 Sobic002G179700--Sobic005G227050 Sobic002G179700--Sobic005G209900 Sobic002G179700--Sobic001G356400 Sobic002G179700--Sobic005G196500 Sobic006G233600 Sobic006G233600 Sobic002G179700--Sobic006G233600 Sobic002G179700--Sobic010G107200 Sobic002G315000 Sobic002G315000 Sobic002G179700--Sobic002G315000 Sobic002G072700 Sobic002G072700 Sobic002G179700--Sobic002G072700 Sobic009G154100--Sobic010G107200 Sobic009G154100--Sobic005G209900 Sobic009G154100--Sobic002G315000 Sobic009G154100--Sobic007G012800 Sobic009G154100--Sobic002G179700 Sobic007G189400 Sobic007G189400 Sobic009G154100--Sobic007G189400 Sobic009G154100--Sobic005G227050 Sobic001G221900 Sobic001G221900 Sobic009G154100--Sobic001G221900 Sobic009G154100--Sobic006G032800 Sobic005G110600 Sobic005G110600 Sobic005G130700--Sobic005G110600 Sobic006G062300 Sobic006G062300 Sobic005G130700--Sobic006G062300 Sobic010G116100 Sobic010G116100 Sobic005G130700--Sobic010G116100 Sobic003G419600 Sobic003G419600 Sobic005G130700--Sobic003G419600 Sobic001G140800 Sobic001G140800 Sobic005G130700--Sobic001G140800 Sobic005G130700--Sobic003G277200 Sobic005G130700--Sobic009G134000 Sobic006G245600 Sobic006G245600 Sobic005G130700--Sobic006G245600 Sobic003G272900 Sobic003G272900 Sobic005G130700--Sobic003G272900 Sobic005G196500--Sobic006G001400 Sobic005G196500--Sobic006G233600 Sobic005G196500--Sobic005G209900 Sobic005G196500--Sobic010G107200 Sobic005G196500--Sobic005G227050 Sobic007G142300 Sobic007G142300 Sobic005G196500--Sobic007G142300 Sobic004G001200 Sobic004G001200 Sobic005G196500--Sobic004G001200 Sobic003G333000 Sobic003G333000 Sobic005G196500--Sobic003G333000 Sobic004G291500 Sobic004G291500 Sobic005G196500--Sobic004G291500 Sobic007G210900 Sobic007G210900 Sobic003G420800--Sobic007G210900 Sobic003G420800--Sobic002G315000 Sobic005G204100 Sobic005G204100 Sobic003G420800--Sobic005G204100 Sobic003G420800--Sobic009G154100 Sobic003G420800--Sobic002G179700 Sobic003G420800--Sobic003G333000 Sobic003G174900 Sobic003G174900 Sobic003G420800--Sobic003G174900 Sobic001G482300 Sobic001G482300 Sobic003G420800--Sobic001G482300 Sobic001G047200 Sobic001G047200 Sobic003G420800--Sobic001G047200 Sobic005G209900--Sobic010G107200 Sobic005G209900--Sobic005G196500 Sobic005G209900--Sobic009G154100 Sobic005G209900--Sobic005G227050 Sobic005G209900--Sobic006G233600 Sobic005G209900--Sobic007G012800 Sobic005G209900--Sobic007G142300 Sobic005G147800 Sobic005G147800 Sobic005G209900--Sobic005G147800 Sobic005G209900--Sobic002G179700
Octagon: transcription factors


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