Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G175500.2
Synonym Sb07g024730
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5RBI0
Pfam PF03087
Panther DB PTHR33070 PTHR33070:SF11
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G17070 : Arabidopsis protein of unknown function (DUF241)
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g43740.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G250150 - -
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16 Sobic.006G185150 - -
17 Sobic.010G263051 - -
18 Sobic.010G272700 exo70 exocyst complex subunit family protein, putative, expressed -
19 Sobic.008G112700 NB-ARC domain containing protein, expressed -
20 Sobic.003G294550 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G175500 Sobic007G175500 Sobic001G250150 Sobic001G250150 Sobic007G175500--Sobic001G250150 Sobic010G137500 Sobic010G137500 Sobic007G175500--Sobic010G137500 Sobic005G035400 Sobic005G035400 Sobic007G175500--Sobic005G035400 Sobic005G107250 Sobic005G107250 Sobic007G175500--Sobic005G107250 Sobic010G165925 Sobic010G165925 Sobic007G175500--Sobic010G165925 Sobic002G142550 Sobic002G142550 Sobic007G175500--Sobic002G142550 Sobic010G180300 Sobic010G180300 Sobic007G175500--Sobic010G180300 Sobic001G369701 Sobic001G369701 Sobic007G175500--Sobic001G369701 Sobic010G079150 Sobic010G079150 Sobic007G175500--Sobic010G079150 Sobic001G250150--Sobic010G079150 Sobic001G250150--Sobic010G137500 Sobic001G250150--Sobic007G175500 Sobic001G250150--Sobic005G107250 Sobic005G019650 Sobic005G019650 Sobic001G250150--Sobic005G019650 Sobic001G250150--Sobic010G180300 Sobic006G185150 Sobic006G185150 Sobic001G250150--Sobic006G185150 Sobic001G115200 Sobic001G115200 Sobic001G250150--Sobic001G115200 Sobic006G024101 Sobic006G024101 Sobic001G250150--Sobic006G024101 Sobic010G137500--Sobic001G250150 Sobic010G137500--Sobic007G175500 Sobic010G137500--Sobic010G079150 Sobic010G137500--Sobic010G165925 Sobic010G137500--Sobic005G107250 Sobic010G137500--Sobic001G369701 Sobic007G003250 Sobic007G003250 Sobic010G137500--Sobic007G003250 Sobic010G137500--Sobic002G142550 Sobic003G025500 Sobic003G025500 Sobic010G137500--Sobic003G025500 Sobic005G035400--Sobic010G165925 Sobic010G263151 Sobic010G263151 Sobic005G035400--Sobic010G263151 Sobic006G196800 Sobic006G196800 Sobic005G035400--Sobic006G196800 Sobic005G035400--Sobic007G003250 Sobic005G035400--Sobic001G369701 Sobic003G188700 Sobic003G188700 Sobic005G035400--Sobic003G188700 Sobic005G035400--Sobic002G142550 Sobic005G035400--Sobic005G107250 Sobic006G007700 Sobic006G007700 Sobic005G035400--Sobic006G007700 Sobic005G107250--Sobic002G142550 Sobic005G107250--Sobic010G165925 Sobic005G107250--Sobic010G180300 Sobic005G107250--Sobic001G115200 Sobic005G107250--Sobic005G019650 Sobic005G107250--Sobic001G369701 Sobic005G107250--Sobic007G003250 Sobic005G107250--Sobic006G185150 Sobic005G107250--Sobic006G024101 Sobic010G165925--Sobic007G003250 Sobic010G165925--Sobic001G369701 Sobic010G165925--Sobic005G107250 Sobic010G165925--Sobic002G142550 Sobic010G165925--Sobic006G196800 Sobic010G165925--Sobic003G025500 Sobic010G165925--Sobic001G115200 Sobic010G165925--Sobic010G180300 Sobic010G165925--Sobic010G263151 Sobic002G142550--Sobic005G107250 Sobic002G142550--Sobic010G165925 Sobic002G142550--Sobic001G369701 Sobic002G142550--Sobic007G003250 Sobic002G142550--Sobic010G180300 Sobic002G142550--Sobic001G115200 Sobic002G142550--Sobic005G019650 Sobic002G142550--Sobic003G025500 Sobic010G236950 Sobic010G236950 Sobic002G142550--Sobic010G236950 Sobic010G180300--Sobic005G019650 Sobic010G180300--Sobic005G107250 Sobic010G180300--Sobic006G024101 Sobic010G180300--Sobic006G185150 Sobic010G180300--Sobic001G115200 Sobic003G294550 Sobic003G294550 Sobic010G180300--Sobic003G294550 Sobic008G135401 Sobic008G135401 Sobic010G180300--Sobic008G135401 Sobic010G180300--Sobic002G142550 Sobic010G263051 Sobic010G263051 Sobic010G180300--Sobic010G263051 Sobic001G369701--Sobic010G165925 Sobic001G369701--Sobic005G107250 Sobic001G369701--Sobic007G003250 Sobic001G369701--Sobic002G142550 Sobic001G369701--Sobic006G007700 Sobic001G519500 Sobic001G519500 Sobic001G369701--Sobic001G519500 Sobic001G369701--Sobic001G115200 Sobic007G043050 Sobic007G043050 Sobic001G369701--Sobic007G043050 Sobic001G369701--Sobic003G025500 Sobic010G079150--Sobic001G250150 Sobic002G030100 Sobic002G030100 Sobic010G079150--Sobic002G030100 Sobic008G126100 Sobic008G126100 Sobic010G079150--Sobic008G126100 Sobic003G293550 Sobic003G293550 Sobic010G079150--Sobic003G293550 Sobic010G079150--Sobic010G137500 Sobic010G216500 Sobic010G216500 Sobic010G079150--Sobic010G216500 Sobic005G217400 Sobic005G217400 Sobic010G079150--Sobic005G217400 Sobic004G007550 Sobic004G007550 Sobic010G079150--Sobic004G007550 Sobic004G300400 Sobic004G300400 Sobic010G079150--Sobic004G300400
Octagon: transcription factors


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