Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G189300.1
Synonym Sb07g025900
Functional annotation DC1 domain containing protein, expressed
UniProt C5YHP0
Pfam -
Panther DB PTHR13871
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G54040 : Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g42490.1 : DC1 domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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16 Sobic.001G317900 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
17 Sobic.001G317900 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
18 Sobic.001G317900 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
19 Sobic.002G191200 OsFBX55 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.008G174400 OsFBX464 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G189300 Sobic007G189300 Sobic002G070700 Sobic002G070700 Sobic007G189300--Sobic002G070700 Sobic003G080500 Sobic003G080500 Sobic007G189300--Sobic003G080500 Sobic003G081500 Sobic003G081500 Sobic007G189300--Sobic003G081500 Sobic002G288800 Sobic002G288800 Sobic007G189300--Sobic002G288800 Sobic006G030250 Sobic006G030250 Sobic007G189300--Sobic006G030250 Sobic010G127500 Sobic010G127500 Sobic007G189300--Sobic010G127500 Sobic005G008101 Sobic005G008101 Sobic007G189300--Sobic005G008101 Sobic005G134301 Sobic005G134301 Sobic007G189300--Sobic005G134301 Sobic008G139100 Sobic008G139100 Sobic007G189300--Sobic008G139100 Sobic002G070700--Sobic003G080500 Sobic007G072166 Sobic007G072166 Sobic002G070700--Sobic007G072166 Sobic002G070700--Sobic007G189300 Sobic002G070700--Sobic006G030250 Sobic002G070700--Sobic010G127500 Sobic001G028301 Sobic001G028301 Sobic002G070700--Sobic001G028301 Sobic007G223150 Sobic007G223150 Sobic002G070700--Sobic007G223150 Sobic002G070700--Sobic005G134301 Sobic008G091100 Sobic008G091100 Sobic002G070700--Sobic008G091100 Sobic003G080500--Sobic006G030250 Sobic003G080500--Sobic010G127500 Sobic001G417100 Sobic001G417100 Sobic003G080500--Sobic001G417100 Sobic001G520050 Sobic001G520050 Sobic003G080500--Sobic001G520050 Sobic002G191200 Sobic002G191200 Sobic003G080500--Sobic002G191200 Sobic007G115050 Sobic007G115050 Sobic003G080500--Sobic007G115050 Sobic001G317900 Sobic001G317900 Sobic003G080500--Sobic001G317900 Sobic005G145000 Sobic005G145000 Sobic003G081500--Sobic005G145000 Sobic003G081500--Sobic006G030250 Sobic003G081500--Sobic010G127500 Sobic003G081500--Sobic001G317900 Sobic005G083932 Sobic005G083932 Sobic003G081500--Sobic005G083932 Sobic008G174400 Sobic008G174400 Sobic003G081500--Sobic008G174400 Sobic001G260900 Sobic001G260900 Sobic002G288800--Sobic001G260900 Sobic002G288800--Sobic007G115050 Sobic002G174000 Sobic002G174000 Sobic002G288800--Sobic002G174000 Sobic002G288800--Sobic005G134301 Sobic002G288800--Sobic008G139100 Sobic002G288800--Sobic005G083932 Sobic002G288800--Sobic001G317900 Sobic006G030250--Sobic010G127500 Sobic006G030250--Sobic001G317900 Sobic006G030250--Sobic005G083932 Sobic006G030250--Sobic008G174400 Sobic006G030250--Sobic002G191200 Sobic002G373500 Sobic002G373500 Sobic006G030250--Sobic002G373500 Sobic010G127500--Sobic006G030250 Sobic010G127500--Sobic001G317900 Sobic010G127500--Sobic005G083932 Sobic010G127500--Sobic008G174400 Sobic010G127500--Sobic002G191200 Sobic010G127500--Sobic002G373500 Sobic004G201800 Sobic004G201800 Sobic005G008101--Sobic004G201800 Sobic003G290050 Sobic003G290050 Sobic005G008101--Sobic003G290050 Sobic006G078450 Sobic006G078450 Sobic005G008101--Sobic006G078450 Sobic003G089700 Sobic003G089700 Sobic005G008101--Sobic003G089700 Sobic005G183450 Sobic005G183450 Sobic005G008101--Sobic005G183450 Sobic006G020350 Sobic006G020350 Sobic005G008101--Sobic006G020350 Sobic006G124850 Sobic006G124850 Sobic005G008101--Sobic006G124850 Sobic008G035633 Sobic008G035633 Sobic005G008101--Sobic008G035633 Sobic006G017266 Sobic006G017266 Sobic005G008101--Sobic006G017266 Sobic005G134301--Sobic001G260900 Sobic005G134301--Sobic007G115050 Sobic005G134301--Sobic005G083932 Sobic005G134301--Sobic001G317900 Sobic005G134301--Sobic002G191200 Sobic005G134301--Sobic008G174400 Sobic008G139100--Sobic002G174000 Sobic004G346700 Sobic004G346700 Sobic008G139100--Sobic004G346700 Sobic008G139100--Sobic001G260900 Sobic008G139100--Sobic002G288800 Sobic008G139100--Sobic007G115050 Sobic005G008400 Sobic005G008400 Sobic008G139100--Sobic005G008400 Sobic001G195550 Sobic001G195550 Sobic008G139100--Sobic001G195550 Sobic001G045500 Sobic001G045500 Sobic008G139100--Sobic001G045500 Sobic004G198701 Sobic004G198701 Sobic008G139100--Sobic004G198701
Octagon: transcription factors


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