Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G216401.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RC06
Pfam PF12854 PF13041 PF01535
Panther DB PTHR24015 PTHR24015:SF646
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G44880 : Pentatricopeptide repeat (PPR-like) superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g39130.1 : pentatricopeptide, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a033767
Brachypodium -
Barley HORVU7Hr1G049380.1 , HORVU7Hr1G049380.3 , HORVU7Hr1G049380.2 , HORVU2Hr1G116530.1 , HORVU5Hr1G054950.1 , HORVU5Hr1G054950.2
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G476201 - -
2 Sobic.006G266900 polygalacturonase inhibitor 3 precursor, putative, expressed -
3 Sobic.002G045900 - -
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15 Sobic.006G185150 - -
16 Sobic.004G337132 - -
17 Sobic.005G019650 - -
18 Sobic.007G118700 - -
19 Sobic.005G217400 AP2 domain containing protein, expressed -
20 Sobic.008G112700 NB-ARC domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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