Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G014601.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt C5YQK1
Pfam PF04578
Panther DB PTHR31325 PTHR31325:SF39
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G45530 : Protein of unknown function (DUF594)
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g16930.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium PNT78203 , PNT65129 , PNT65130 , PNT78225 , PNT78226
Barley -
Wheat TraesCS5D02G371000 , TraesCS5B02G364800 , TraesCS5D02G355200 , TraesCS5D02G370800 , TraesCS5D02G370800 , TraesCS5B02G364500
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G130700 expressed protein K14638: SLC15A3_4, solute carrier family 15 (peptide/histidine transporter), member 3/4
2 Sobic.003G380700 expressed protein -
3 Sobic.009G025950 - -
4 Sobic.007G176300 STIGL3 - Stigma-specific Stig1 family protein precursor, putative, expressed -
5 Sobic.009G240100 receptor-like protein kinase homolog RK20-1, putative, expressed -
6 Sobic.003G146450 - -
7 Sobic.002G247700 expressed protein -
8 Sobic.002G342901 - -
9 Sobic.005G227900 STIGL3 - Stigma-specific Stig1 family protein precursor, putative, expressed -
10 Sobic.008G191800 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
11 Sobic.005G032700 phospholipase, putative, expressed K16818: phospholipase A1
12 Sobic.002G124766 - -
13 Sobic.003G318350 - -
14 Sobic.003G059600 glycosyltransferase, putative, expressed K08238: xyloglucan 6-xylosyltransferase
15 Sobic.001G443850 - -
16 Sobic.007G154001 - -
17 Sobic.009G197350 - -
18 Sobic.009G156700 protein transport protein, putative, expressed -
19 Sobic.007G145300 zinc knuckle family protein, expressed -
20 Sobic.010G043350 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G014601 Sobic008G014601 Sobic006G130700 Sobic006G130700 Sobic008G014601--Sobic006G130700 Sobic003G380700 Sobic003G380700 Sobic008G014601--Sobic003G380700 Sobic009G025950 Sobic009G025950 Sobic008G014601--Sobic009G025950 Sobic007G176300 Sobic007G176300 Sobic008G014601--Sobic007G176300 Sobic009G240100 Sobic009G240100 Sobic008G014601--Sobic009G240100 Sobic003G146450 Sobic003G146450 Sobic008G014601--Sobic003G146450 Sobic002G247700 Sobic002G247700 Sobic008G014601--Sobic002G247700 Sobic002G342901 Sobic002G342901 Sobic008G014601--Sobic002G342901 Sobic005G227900 Sobic005G227900 Sobic008G014601--Sobic005G227900 Sobic006G130700--Sobic009G025950 Sobic006G130700--Sobic009G240100 Sobic002G223550 Sobic002G223550 Sobic006G130700--Sobic002G223550 Sobic006G130700--Sobic003G380700 Sobic006G130700--Sobic003G146450 Sobic006G130700--Sobic002G342901 Sobic006G130700--Sobic007G176300 Sobic006G130700--Sobic008G014601 Sobic007G227401 Sobic007G227401 Sobic006G130700--Sobic007G227401 Sobic008G191800 Sobic008G191800 Sobic003G380700--Sobic008G191800 Sobic002G082350 Sobic002G082350 Sobic003G380700--Sobic002G082350 Sobic007G145300 Sobic007G145300 Sobic003G380700--Sobic007G145300 Sobic009G197350 Sobic009G197350 Sobic003G380700--Sobic009G197350 Sobic009G156700 Sobic009G156700 Sobic003G380700--Sobic009G156700 Sobic003G380700--Sobic003G146450 Sobic010G064050 Sobic010G064050 Sobic003G380700--Sobic010G064050 Sobic001G100650 Sobic001G100650 Sobic003G380700--Sobic001G100650 Sobic005G080075 Sobic005G080075 Sobic003G380700--Sobic005G080075 Sobic002G124766 Sobic002G124766 Sobic009G025950--Sobic002G124766 Sobic009G025950--Sobic008G191800 Sobic009G025950--Sobic007G145300 Sobic009G025950--Sobic009G197350 Sobic009G025950--Sobic009G156700 Sobic002G269800 Sobic002G269800 Sobic009G025950--Sobic002G269800 Sobic003G126700 Sobic003G126700 Sobic009G025950--Sobic003G126700 Sobic009G025950--Sobic002G082350 Sobic007G003300 Sobic007G003300 Sobic009G025950--Sobic007G003300 Sobic007G176300--Sobic002G342901 Sobic007G176300--Sobic003G146450 Sobic007G176300--Sobic002G124766 Sobic007G176300--Sobic009G156700 Sobic007G176300--Sobic009G197350 Sobic007G176300--Sobic007G145300 Sobic007G176300--Sobic002G269800 Sobic007G176300--Sobic003G126700 Sobic006G223700 Sobic006G223700 Sobic007G176300--Sobic006G223700 Sobic009G240100--Sobic006G130700 Sobic007G047200 Sobic007G047200 Sobic009G240100--Sobic007G047200 Sobic002G174600 Sobic002G174600 Sobic009G240100--Sobic002G174600 Sobic009G240100--Sobic007G176300 Sobic003G059600 Sobic003G059600 Sobic009G240100--Sobic003G059600 Sobic010G043350 Sobic010G043350 Sobic009G240100--Sobic010G043350 Sobic006G252532 Sobic006G252532 Sobic009G240100--Sobic006G252532 Sobic009G240100--Sobic008G014601 Sobic007G191400 Sobic007G191400 Sobic009G240100--Sobic007G191400 Sobic003G146450--Sobic006G223700 Sobic003G146450--Sobic003G126700 Sobic003G146450--Sobic002G342901 Sobic007G154001 Sobic007G154001 Sobic003G146450--Sobic007G154001 Sobic003G146450--Sobic002G269800 Sobic008G154200 Sobic008G154200 Sobic003G146450--Sobic008G154200 Sobic003G146450--Sobic009G156700 Sobic003G146450--Sobic009G197350 Sobic003G064000 Sobic003G064000 Sobic003G146450--Sobic003G064000 Sobic005G057500 Sobic005G057500 Sobic002G247700--Sobic005G057500 Sobic005G032700 Sobic005G032700 Sobic002G247700--Sobic005G032700 Sobic002G247700--Sobic008G191800 Sobic002G247700--Sobic005G080075 Sobic002G247700--Sobic001G100650 Sobic002G247700--Sobic010G064050 Sobic002G313850 Sobic002G313850 Sobic002G247700--Sobic002G313850 Sobic003G008400 Sobic003G008400 Sobic002G247700--Sobic003G008400 Sobic002G247700--Sobic002G082350 Sobic002G342901--Sobic003G146450 Sobic002G342901--Sobic006G223700 Sobic002G342901--Sobic007G176300 Sobic002G342901--Sobic003G126700 Sobic002G342901--Sobic002G269800 Sobic002G342901--Sobic008G154200 Sobic002G342901--Sobic009G156700 Sobic002G342901--Sobic009G197350 Sobic002G342901--Sobic003G064000 Sobic004G041600 Sobic004G041600 Sobic005G227900--Sobic004G041600 SobicK044402 SobicK044402 Sobic005G227900--SobicK044402 Sobic003G015700 Sobic003G015700 Sobic005G227900--Sobic003G015700 Sobic005G227900--Sobic008G014601 Sobic007G055400 Sobic007G055400 Sobic005G227900--Sobic007G055400 Sobic007G115600 Sobic007G115600 Sobic005G227900--Sobic007G115600 Sobic001G423900 Sobic001G423900 Sobic005G227900--Sobic001G423900 Sobic005G227900--Sobic007G176300 Sobic005G227900--Sobic002G342901
Octagon: transcription factors


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