Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G240100.1
Synonym CRK10, RLK4, Sb09g029190
Functional annotation receptor-like protein kinase homolog RK20-1, putative, expressed
UniProt A0A1B6PA53
Pfam PF01657
Panther DB PTHR32099 PTHR32099:SF8
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G23180 : cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 10
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g41410.1 : receptor-like protein kinase homolog RK20-1, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a004650
Brachypodium KQJ85883
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G130700 expressed protein K14638: SLC15A3_4, solute carrier family 15 (peptide/histidine transporter), member 3/4
2 Sobic.007G047200 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase domain containing protein, expressed -
3 Sobic.002G174600 protein kinase, putative, expressed -
4 Sobic.007G176300 STIGL3 - Stigma-specific Stig1 family protein precursor, putative, expressed -
5 Sobic.003G059600 glycosyltransferase, putative, expressed K08238: xyloglucan 6-xylosyltransferase
6 Sobic.010G043350 - -
7 Sobic.006G252532 - -
8 Sobic.008G014601 - -
9 Sobic.007G191400 "domain confirmed by Pfam database, expression not supported"(PubMedID : 20499123)@OsSAUR7 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed K14488: SAUR family protein
10 Sobic.009G025950 - -
11 Sobic.003G380700 expressed protein -
12 Sobic.002G223550 - -
13 Sobic.008G110151 - -
14 Sobic.005G032700 phospholipase, putative, expressed K16818: phospholipase A1
15 Sobic.008G191800 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
16 Sobic.003G360500 glycosyl transferase, putative, expressed K00750: GYG1, glycogenin
17 Sobic.003G188700 expressed protein -
18 Sobic.003G254400 expressed protein -
19 Sobic.003G199650 - -
20 Sobic.003G318600 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G240100 Sobic009G240100 Sobic006G130700 Sobic006G130700 Sobic009G240100--Sobic006G130700 Sobic007G047200 Sobic007G047200 Sobic009G240100--Sobic007G047200 Sobic002G174600 Sobic002G174600 Sobic009G240100--Sobic002G174600 Sobic007G176300 Sobic007G176300 Sobic009G240100--Sobic007G176300 Sobic003G059600 Sobic003G059600 Sobic009G240100--Sobic003G059600 Sobic010G043350 Sobic010G043350 Sobic009G240100--Sobic010G043350 Sobic006G252532 Sobic006G252532 Sobic009G240100--Sobic006G252532 Sobic008G014601 Sobic008G014601 Sobic009G240100--Sobic008G014601 Sobic007G191400 Sobic007G191400 Sobic009G240100--Sobic007G191400 Sobic009G025950 Sobic009G025950 Sobic006G130700--Sobic009G025950 Sobic006G130700--Sobic009G240100 Sobic002G223550 Sobic002G223550 Sobic006G130700--Sobic002G223550 Sobic003G380700 Sobic003G380700 Sobic006G130700--Sobic003G380700 Sobic003G146450 Sobic003G146450 Sobic006G130700--Sobic003G146450 Sobic002G342901 Sobic002G342901 Sobic006G130700--Sobic002G342901 Sobic006G130700--Sobic007G176300 Sobic006G130700--Sobic008G014601 Sobic007G227401 Sobic007G227401 Sobic006G130700--Sobic007G227401 Sobic007G047200--Sobic009G240100 Sobic007G047200--Sobic006G252532 Sobic003G124900 Sobic003G124900 Sobic007G047200--Sobic003G124900 Sobic007G047200--Sobic003G380700 Sobic007G047200--Sobic003G059600 Sobic004G279900 Sobic004G279900 Sobic007G047200--Sobic004G279900 Sobic007G047200--Sobic006G130700 Sobic007G047200--Sobic010G043350 Sobic003G199650 Sobic003G199650 Sobic007G047200--Sobic003G199650 Sobic002G174600--Sobic009G240100 Sobic002G174600--Sobic004G279900 Sobic002G174600--Sobic007G176300 Sobic003G188700 Sobic003G188700 Sobic002G174600--Sobic003G188700 Sobic008G112700 Sobic008G112700 Sobic002G174600--Sobic008G112700 Sobic002G174600--Sobic007G191400 Sobic002G174600--Sobic007G047200 Sobic002G174600--Sobic010G043350 Sobic002G174600--Sobic003G199650 Sobic007G176300--Sobic002G342901 Sobic007G176300--Sobic003G146450 Sobic002G124766 Sobic002G124766 Sobic007G176300--Sobic002G124766 Sobic009G156700 Sobic009G156700 Sobic007G176300--Sobic009G156700 Sobic009G197350 Sobic009G197350 Sobic007G176300--Sobic009G197350 Sobic007G145300 Sobic007G145300 Sobic007G176300--Sobic007G145300 Sobic002G269800 Sobic002G269800 Sobic007G176300--Sobic002G269800 Sobic003G126700 Sobic003G126700 Sobic007G176300--Sobic003G126700 Sobic006G223700 Sobic006G223700 Sobic007G176300--Sobic006G223700 Sobic008G133750 Sobic008G133750 Sobic003G059600--Sobic008G133750 Sobic002G163950 Sobic002G163950 Sobic003G059600--Sobic002G163950 Sobic008G191800 Sobic008G191800 Sobic003G059600--Sobic008G191800 Sobic003G059600--Sobic009G025950 Sobic003G318600 Sobic003G318600 Sobic003G059600--Sobic003G318600 Sobic001G209000 Sobic001G209000 Sobic003G059600--Sobic001G209000 Sobic008G157400 Sobic008G157400 Sobic003G059600--Sobic008G157400 Sobic003G254400 Sobic003G254400 Sobic003G059600--Sobic003G254400 Sobic003G360500 Sobic003G360500 Sobic003G059600--Sobic003G360500 Sobic010G043350--Sobic003G360500 Sobic010G043350--Sobic003G254400 Sobic005G057500 Sobic005G057500 Sobic010G043350--Sobic005G057500 Sobic003G008400 Sobic003G008400 Sobic010G043350--Sobic003G008400 Sobic010G043350--Sobic008G191800 Sobic005G080075 Sobic005G080075 Sobic010G043350--Sobic005G080075 Sobic001G100650 Sobic001G100650 Sobic010G043350--Sobic001G100650 Sobic010G064050 Sobic010G064050 Sobic010G043350--Sobic010G064050 Sobic010G043350--Sobic003G188700 Sobic006G252532--Sobic007G047200 Sobic006G252532--Sobic003G380700 Sobic006G252532--Sobic009G240100 Sobic008G110151 Sobic008G110151 Sobic006G252532--Sobic008G110151 Sobic006G252532--Sobic006G130700 Sobic006G252532--Sobic003G188700 Sobic006G252532--Sobic003G199650 Sobic006G252532--Sobic010G043350 Sobic006G252532--Sobic004G279900 Sobic008G014601--Sobic006G130700 Sobic008G014601--Sobic003G380700 Sobic008G014601--Sobic009G025950 Sobic008G014601--Sobic007G176300 Sobic008G014601--Sobic009G240100 Sobic008G014601--Sobic003G146450 Sobic002G247700 Sobic002G247700 Sobic008G014601--Sobic002G247700 Sobic008G014601--Sobic002G342901 Sobic005G227900 Sobic005G227900 Sobic008G014601--Sobic005G227900 Sobic004G317401 Sobic004G317401 Sobic007G191400--Sobic004G317401 Sobic007G191400--Sobic007G176300 Sobic007G191400--Sobic009G240100 Sobic002G373700 Sobic002G373700 Sobic007G191400--Sobic002G373700 Sobic007G191400--Sobic006G130700 Sobic007G191400--Sobic008G014601 Sobic002G185400 Sobic002G185400 Sobic007G191400--Sobic002G185400 Sobic007G115600 Sobic007G115600 Sobic007G191400--Sobic007G115600 Sobic007G191400--Sobic009G025950
Octagon: transcription factors


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