Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G049200.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt C5Z4T4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
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Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G174200 S-domain receptor-like protein kinase, putative, expressed -
2 Sobic.004G087750 - -
3 Sobic.010G238500 - -
4 Sobic.004G342700 C2 domain containing protein, putative, expressed -
5 Sobic.004G019250 - -
6 Sobic.008G176401 - -
7 Sobic.009G028700 OsFBX115 - F-box domain containing protein, expressed -
8 Sobic.004G139800 - -
9 Sobic.008G098032 - -
10 Sobic.004G355101 - -
11 Sobic.001G310133 - -
12 Sobic.006G246800 MBTB56 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
13 Sobic.003G014832 - -
14 Sobic.006G035950 - -
15 Sobic.005G035850 - -
16 Sobic.005G123000 gibberellin response modulator protein, putative, expressed -
17 Sobic.003G054950 - -
18 Sobic.002G268450 - -
19 Sobic.002G226600 - -
20 Sobic.006G037150 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G049200 Sobic010G049200 Sobic009G174200 Sobic009G174200 Sobic010G049200--Sobic009G174200 Sobic004G087750 Sobic004G087750 Sobic010G049200--Sobic004G087750 Sobic010G238500 Sobic010G238500 Sobic010G049200--Sobic010G238500 Sobic004G342700 Sobic004G342700 Sobic010G049200--Sobic004G342700 Sobic004G019250 Sobic004G019250 Sobic010G049200--Sobic004G019250 Sobic008G176401 Sobic008G176401 Sobic010G049200--Sobic008G176401 Sobic009G028700 Sobic009G028700 Sobic010G049200--Sobic009G028700 Sobic004G139800 Sobic004G139800 Sobic010G049200--Sobic004G139800 Sobic008G098032 Sobic008G098032 Sobic010G049200--Sobic008G098032 Sobic009G174200--Sobic004G087750 Sobic009G174200--Sobic004G019250 Sobic009G174200--Sobic008G098032 Sobic009G174200--Sobic008G176401 Sobic009G174200--Sobic004G342700 Sobic009G174200--Sobic004G139800 Sobic003G014832 Sobic003G014832 Sobic009G174200--Sobic003G014832 Sobic005G035850 Sobic005G035850 Sobic009G174200--Sobic005G035850 Sobic001G310133 Sobic001G310133 Sobic009G174200--Sobic001G310133 Sobic004G087750--Sobic009G174200 Sobic004G087750--Sobic004G019250 Sobic004G087750--Sobic008G098032 Sobic004G087750--Sobic008G176401 Sobic004G087750--Sobic004G342700 Sobic004G087750--Sobic004G139800 Sobic004G087750--Sobic003G014832 Sobic004G087750--Sobic005G035850 Sobic004G087750--Sobic001G310133 Sobic006G246800 Sobic006G246800 Sobic010G238500--Sobic006G246800 Sobic004G355101 Sobic004G355101 Sobic010G238500--Sobic004G355101 Sobic010G238500--Sobic004G342700 Sobic010G238500--Sobic008G176401 Sobic006G035950 Sobic006G035950 Sobic010G238500--Sobic006G035950 Sobic010G238500--Sobic003G014832 Sobic002G268450 Sobic002G268450 Sobic010G238500--Sobic002G268450 Sobic010G238500--Sobic009G174200 Sobic010G238500--Sobic004G087750 Sobic004G342700--Sobic008G176401 Sobic004G342700--Sobic006G246800 Sobic004G342700--Sobic009G174200 Sobic004G342700--Sobic004G087750 Sobic004G342700--Sobic003G014832 Sobic004G342700--Sobic004G355101 Sobic004G342700--Sobic006G035950 Sobic004G342700--Sobic004G019250 Sobic004G342700--Sobic002G268450 Sobic004G019250--Sobic004G087750 Sobic004G019250--Sobic009G174200 Sobic004G019250--Sobic008G098032 Sobic004G019250--Sobic004G139800 Sobic004G019250--Sobic008G176401 Sobic004G019250--Sobic004G342700 Sobic004G019250--Sobic005G035850 Sobic004G019250--Sobic001G310133 Sobic004G019250--Sobic003G014832 Sobic008G176401--Sobic004G342700 Sobic008G176401--Sobic009G174200 Sobic008G176401--Sobic004G087750 Sobic008G176401--Sobic003G014832 Sobic008G176401--Sobic006G246800 Sobic008G176401--Sobic002G268450 Sobic008G176401--Sobic004G355101 Sobic008G176401--Sobic006G035950 Sobic008G176401--Sobic004G019250 Sobic003G152050 Sobic003G152050 Sobic009G028700--Sobic003G152050 Sobic009G028700--Sobic008G098032 Sobic009G028700--Sobic004G139800 Sobic009G028700--Sobic004G087750 Sobic009G028700--Sobic009G174200 Sobic009G028700--Sobic004G019250 Sobic009G028700--Sobic005G035850 Sobic005G214900 Sobic005G214900 Sobic009G028700--Sobic005G214900 Sobic005G123000 Sobic005G123000 Sobic009G028700--Sobic005G123000 Sobic004G139800--Sobic008G098032 Sobic004G139800--Sobic005G035850 Sobic004G139800--Sobic004G019250 Sobic004G139800--Sobic001G310133 Sobic004G139800--Sobic004G087750 Sobic004G139800--Sobic009G174200 Sobic004G139800--Sobic005G214900 Sobic004G139800--Sobic003G152050 Sobic003G003900 Sobic003G003900 Sobic004G139800--Sobic003G003900 Sobic008G098032--Sobic004G139800 Sobic008G098032--Sobic004G019250 Sobic008G098032--Sobic004G087750 Sobic008G098032--Sobic009G174200 Sobic008G098032--Sobic005G035850 Sobic008G098032--Sobic001G310133 Sobic008G098032--Sobic008G176401 Sobic008G098032--Sobic005G214900 Sobic008G098032--Sobic004G342700
Octagon: transcription factors


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