Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G120350.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VSL4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G03840 : C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g01830.1 : DEAD-box ATP-dependent RNA helicase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a028450 , Zm00025a038400
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G319500 heat shock protein DnaJ, putative, expressed -
2 Sobic.003G201800 coiled-coil domain-containing protein, putative, expressed -
3 Sobic.002G382400 - -
4 Sobic.002G249400 auxin efflux carrier component, putative, expressed -
5 Sobic.006G001600 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
6 Sobic.003G236501 - -
7 Sobic.004G342700 C2 domain containing protein, putative, expressed -
8 Sobic.006G246800 MBTB56 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
9 Sobic.008G176401 - -
10 Sobic.004G355101 - -
11 Sobic.003G014832 - -
12 Sobic.006G035950 - -
13 Sobic.009G174200 S-domain receptor-like protein kinase, putative, expressed -
14 Sobic.004G087750 - -
15 Sobic.001G121000 - -
16 Sobic.002G268450 - -
17 Sobic.001G285700 expressed protein -
18 Sobic.004G019250 - -
19 Sobic.001G439050 - -
20 Sobic.008G098032 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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