Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G142401.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VT24
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G142801 - -
2 Sobic.001G172100 - -
3 Sobic.005G002100 protein kinase domain containing protein, expressed -
4 Sobic.005G026700 - -
5 Sobic.003G164400 potassium transporter, putative, expressed K03549: KUP system potassium uptake protein
6 Sobic.002G000200 cyclic nucleotide-gated ion channel, putative, expressed K05391: cyclic nucleotide gated channel, plant
7 Sobic.003G297100 expressed protein -
8 Sobic.005G187600 - -
9 Sobic.003G111000 transporter family protein, putative, expressed -
10 Sobic.001G094700 expressed protein -
11 Sobic.001G094700 expressed protein -
12 Sobic.001G094700 expressed protein -
13 Sobic.001G094700 expressed protein -
14 Sobic.001G094700 expressed protein -
15 Sobic.001G094700 expressed protein -
16 Sobic.001G094700 expressed protein -
17 Sobic.001G094700 expressed protein -
18 Sobic.001G094700 expressed protein -
19 Sobic.001G094700 expressed protein -
20 Sobic.001G094700 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic010G142401 Sobic010G142401 Sobic007G142801 Sobic007G142801 Sobic010G142401--Sobic007G142801 Sobic001G172100 Sobic001G172100 Sobic010G142401--Sobic001G172100 Sobic005G002100 Sobic005G002100 Sobic010G142401--Sobic005G002100 Sobic005G026700 Sobic005G026700 Sobic010G142401--Sobic005G026700 Sobic003G164400 Sobic003G164400 Sobic010G142401--Sobic003G164400 Sobic002G000200 Sobic002G000200 Sobic010G142401--Sobic002G000200 Sobic003G297100 Sobic003G297100 Sobic010G142401--Sobic003G297100 Sobic005G187600 Sobic005G187600 Sobic010G142401--Sobic005G187600 Sobic003G111000 Sobic003G111000 Sobic010G142401--Sobic003G111000 Sobic007G142801--Sobic001G172100 Sobic007G142801--Sobic003G297100 Sobic007G142801--Sobic005G026700 Sobic007G142801--Sobic005G002100 Sobic007G142801--Sobic003G164400 Sobic007G142801--Sobic002G000200 Sobic007G131000 Sobic007G131000 Sobic007G142801--Sobic007G131000 Sobic005G214800 Sobic005G214800 Sobic007G142801--Sobic005G214800 Sobic001G246001 Sobic001G246001 Sobic007G142801--Sobic001G246001 Sobic001G172100--Sobic005G026700 Sobic001G172100--Sobic005G002100 Sobic001G172100--Sobic003G164400 Sobic001G172100--Sobic007G142801 Sobic001G172100--Sobic002G000200 Sobic001G094700 Sobic001G094700 Sobic001G172100--Sobic001G094700 Sobic005G002100--Sobic005G026700 Sobic005G002100--Sobic003G164400 Sobic005G002100--Sobic001G094700 Sobic005G026700--Sobic003G164400 Sobic005G026700--Sobic005G002100 Sobic005G026700--Sobic001G094700 Sobic003G164400--Sobic005G026700 Sobic006G142200 Sobic006G142200 Sobic003G164400--Sobic006G142200 Sobic002G414150 Sobic002G414150 Sobic003G164400--Sobic002G414150 Sobic004G217200 Sobic004G217200 Sobic003G164400--Sobic004G217200 Sobic005G006300 Sobic005G006300 Sobic003G164400--Sobic005G006300 Sobic005G009500 Sobic005G009500 Sobic003G164400--Sobic005G009500 Sobic001G269400 Sobic001G269400 Sobic003G164400--Sobic001G269400 Sobic005G204500 Sobic005G204500 Sobic003G164400--Sobic005G204500 Sobic009G097000 Sobic009G097000 Sobic003G164400--Sobic009G097000 Sobic002G000200--Sobic003G164400 Sobic002G000200--Sobic005G026700 Sobic008G053750 Sobic008G053750 Sobic002G000200--Sobic008G053750 Sobic002G000200--Sobic005G204500 Sobic002G000200--Sobic005G006300 Sobic006G195000 Sobic006G195000 Sobic002G000200--Sobic006G195000 Sobic002G000200--Sobic004G217200 Sobic002G000200--Sobic006G142200 Sobic003G394801 Sobic003G394801 Sobic002G000200--Sobic003G394801 Sobic003G297100--Sobic007G131000 Sobic009G061601 Sobic009G061601 Sobic003G297100--Sobic009G061601 Sobic001G093100 Sobic001G093100 Sobic003G297100--Sobic001G093100 Sobic003G297100--Sobic007G142801 Sobic003G297100--Sobic003G164400 Sobic007G215200 Sobic007G215200 Sobic003G297100--Sobic007G215200 Sobic003G304600 Sobic003G304600 Sobic003G297100--Sobic003G304600 Sobic006G205400 Sobic006G205400 Sobic003G297100--Sobic006G205400 Sobic003G297100--Sobic005G026700 Sobic005G187600--Sobic001G094700 Sobic006G236300 Sobic006G236300 Sobic003G111000--Sobic006G236300 Sobic005G110120 Sobic005G110120 Sobic003G111000--Sobic005G110120 Sobic009G091300 Sobic009G091300 Sobic003G111000--Sobic009G091300 Sobic003G246500 Sobic003G246500 Sobic003G111000--Sobic003G246500 Sobic009G169500 Sobic009G169500 Sobic003G111000--Sobic009G169500 Sobic003G111000--Sobic006G195000 Sobic010G162700 Sobic010G162700 Sobic003G111000--Sobic010G162700 Sobic001G306200 Sobic001G306200 Sobic003G111000--Sobic001G306200 Sobic005G142400 Sobic005G142400 Sobic003G111000--Sobic005G142400
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.